食品衛生是指為確保食品安全必須采取的一切措施。倉庫是食品貯存的場所，是食品生產經營企業不可缺少的組成部分，其衛生管理的好壞會直接影響食品的質量安全。搞好食品在倉庫貯存過程的衛生管理，就可以使食品盡可能地保持原有的性狀和質量，防止微生物和有害物質的汙染，延長其貯藏期。
一、工作人員的衛生要求
由於倉庫管理的工作人員直接或間接地接觸所貯的食品，所以他們的健康狀況如何，將直接關係到食品的安全和廣大消費者的健康，如果這些人患有傳染病或是帶菌者，就很容易通過被汙染的食品造成傳染病的傳染和流行。因此，加強食品從業人員的健康管理是貫徹“預防為主”的一項重要措施。
（一）衛生教育
食品倉庫應對新參加工作或臨時參加工作的從業人員進行衛生安全教育，定期對職工進行食品衛生法、食品企業衛生規範及其它有關衛生規定的宣傳教育，做到教育有計劃、考核有標準、衛生培訓製度化和規範化。
（二）健康檢查與要求
食品倉庫及與之相關的從業人員每年應至少進行一次健康檢查，必要時接受臨時性的檢查。新參加工作的從業人員，必須經健康檢查並取得健康合格證後方可上崗。食品倉庫應建立職工健康檔案。
凡患有痢疾、傷寒、病毒性肝炎等消化道疾病（包括病源攜帶者），活動性肺結核、化膿性或滲出性皮膚病以及其它有礙食品衛生的疾病者，不得參加接觸直接入口食品的工作。凡發現患有上述疾病的患者，應及時調離並積極治療。
（三）個人衛生
食品的從業人員應保持良好的個人衛生，勤洗手剪指甲、勤理發、勤換衣、勤洗澡；不得將與生產無關的個人用品帶入倉庫；進倉庫時必須穿戴工作服、工作帽、工作鞋；工作衣帽應每天（或定時及時）換洗；不得穿戴工作服、工作帽、工作鞋上廁所；嚴禁在工作期間吃食物、吸煙及隨地吐痰。
二、倉庫內的衛生要求
倉庫是食品貯存的場所，是食品生產經營不可缺少的組成部分，其衛生管理的好壞會直接影響食品的衛生質量。
（1）首先要做好防黴工作。加強通風工作，除了自然通風外，還可安裝機械排風裝置，有條件的地方可以安裝空調。
（2）加強防鼠、防蟲工作。除了在建築設計上注意此項要求外，平時還應采用不同方法來滅鼠、滅蟲，並且要定期檢查滅鼠和滅蟲的情況。
（3）倉庫要建立清潔衛生製度，應定期進行清掃、消毒，保持倉庫內及周圍環境的衛生。
（4）對冷庫要定期除霜，保持冷凝管上不積霜。要注意做好冷庫的防黴、除臭和消毒工作。