艾森豪威爾對巴頓的戰術意識和膽略給以高度評價，表示要全力支持他的工作，要求巴頓對那些不稱職的軍官要“毫不留情地撤換”。同時他還十分關心巴頓的安全，告誡巴頓千萬不能逞匹夫之勇，他說：“我要你擔當的是一位軍長，而不是一個死人。”
當天下午4時30分，巴頓來到伊斯坦布爾第18集團軍群司令部報到，並馬上會見了司令官亞曆山大，兩人進行了徹夜長談。亞曆山大向巴頓詳細介紹了他的任務：大約兩個星期後，蒙哥馬利的部隊向隆美爾的馬雷斯防線發動進攻，屆時，巴頓部隊的任務是支援蒙哥馬利穿越加貝斯平原的行動，因此他要盡可能多地牽製軸心國的部隊。為了避免重蹈卡塞林山口戰役的覆轍，也是由於亞曆山大仍對美軍的作戰能力持懷疑態度，他對巴頓部隊的行動做了周密部署：從西多塞爾推進到東多塞爾，奪取通向加貝斯道路上的咽喉加夫薩，占領梅克納西。一言以蔽之，巴頓的任務僅僅是威脅海岸平原上軸心國部隊的側翼，推進到多塞爾為止。
雖然隻能充當配角，但一聽到要與德國人交戰，巴頓仍然激動不已。每當提到“德國鬼子”，他總是顯得咄咄逼人，怒不可遏，甚至聲淚俱下地痛罵一通。亞曆山大喜歡巴頓的性格，但仍坦率地談了對美國第2軍的印象，他對美軍的“身心軟弱、缺乏訓練”感到失望，希望巴頓的到來能夠徹底轉變這一局麵。這次會見是令人愉快的。
3月6日，巴頓趕到設在庫伊夫山的第2軍司令部。此時，梅德寧戰役正在東南約100英裏處激烈進行。隆美爾的第10、第15和第21裝甲師連續四次向蒙哥馬利的第8集團軍發動猛攻，但遭到了英軍的迎頭痛擊。日落前，德軍損失了52輛坦克和大量人員裝備，無功而返。此次失利使隆美爾認識到：對於軸心國部隊來說，留在非洲“等於自尋死路”，但他的上司（包括希特勒在內）卻堅決反對撤離非洲。失望之餘，隆美爾於3月9日把軍隊交給副手阿尼姆將軍指揮，自己返回歐洲治病去了。
聽到隆美爾離去的消息，許多人都感到鬆了一口氣。而巴頓卻有些心灰意冷，認為這是他個人的一個“重大挫折”。巴頓一直把隆美爾視為自己在北非的最大對手，認為隻有戰勝他，才能奠定自己在軍事史上的地位，從而實現自己夢寐以求的理想。他曾對一位朋友說：“我花了多年時間磨練自己，準備對付這個家夥，對他的書我不知讀了多少遍，研究了他的每一個戰役，自認為對他了如指掌。我的平生願望就是能夠與他捉對廝殺。”隆美爾的病退使他的這一夢想破滅了，也使他對這場戰役的興趣大大減弱。
巴頓是3月6日正式接管第2軍的，而亞曆山大把軍事進攻的日期定在3月17日，也就是說，他隻有11天的時間整頓軍隊，進行戰鬥準備。當務之急是使萎靡不振的軍隊恢複士氣，提高戰鬥力。任務是十分艱巨的。根據自己長期的治軍經驗，巴頓認為，一支紀律鬆懈、軍容不整的軍隊是不會有所作為的。因此，他決心從整頓軍紀入手，采取“不民主和非美國的方式”，對這群“烏合之眾”進行嚴厲整頓。
他首先從嚴格作息時間抓起，並以身作則。到任後的第二天早上7點鍾，巴頓按作息規定準時到食堂就餐，發現隻有他的參謀長加菲來了。他當即命令廚師馬上開飯，1小時後停業。並發布命令：“從明天起，全體人員準時吃飯，半小時之內完畢。”由於巴頓抓住了吃早飯這一環節，從而杜絕了軍人上班遲到的現象。
接著，巴頓發布了強製性的著裝令，規定：凡在戰區，每個軍人都必須戴鋼盔、係領帶、打綁腿，後勤人員亦不例外。這項命令還適用於戰區的醫務人員和兵器修理工。對於違反此命令者規定了罰款數額：軍官50美元，士兵25美元。巴頓半開玩笑地說：“當你要動一個人腰包的時候，他的反應最快。”
盡管如此，還是有些人不以為然，不斷出現違紀現象。聽到這一情況後，巴頓親自帶人四處巡視，把不執行命令的人強製集中起來，進行訓斥，話語不免十分粗魯：“各位聽著：我決不會容忍任何一個不執行命令的兔崽子。現在給你們一個選擇的機會，要麼罰款25元，要麼送交軍事法庭，並記入檔案。你們自己看著辦吧！”這些倒黴的士兵隻好乖乖認罰。
1943年3月12日是巴頓值得紀念的一天，他被晉升為三星中將，他的喜悅之情溢於言表。但巴頓對此並不滿足，他還有更為宏偉的人生目標。他在日記中寫道：“在孩提時代，我常常自稱小喬治·巴頓中將，那時我還不知道有上將。而如今，我想要得到四顆將星，我一定會得到的。”