（三）舉兵長江，所根應天
和陽事件後約兩個月，即至正十五年三月，郭子興去世，朱元璋逐漸掌握了原郭子興所領導的紅巾軍的最高統帥權，其實力也得到了很大的加強，同時徐達也更受朱元璋器重。
隨著朱元璋地位的提高和實力的增強，他決定率領徐達等將士渡江南下，與元末群雄角逐，爭奪對江南的控製權。不久，徐達便隨從朱元璋率軍攻破了元將俞通海等據守的水寨，直接與元朝大將、中丞蠻子海牙所部元軍對壘，南下的戰鬥正式打響。
至正十五年四月，朱元璋和徐達等統領艦船，大敗蠻子海牙於峪溪口，兵臨長江。六月，從江北峪溪口順流東下，大舉進攻長江南岸的軍事要地 采石。經過激戰，朱元璋順利攻占了采石，建立了進攻江南的橋頭堡。然而，在渡江戰役初戰告捷後，紅巾軍官兵哄搶糧食、牲畜等財物，打算帶回正值饑荒的和陽。朱元璋看到士兵失去了進取心，心急如焚，對徐達等親信軍官說：“今天我們僥幸取得了渡江戰鬥的勝利，應該乘勝直接攻取太平（今安徽當塗縣），如果聽任士兵拿著財物返回和陽，日後再攻取江東，恐怕就不容易了。”在這關鍵的時刻，徐達堅決地站在了朱元璋的一邊，並且請求將所有戰艦的纜繩全部砍斷，以斷絕士兵的歸心。徐達的立場和態度，進一步堅定了朱元璋繼續擴大江南戰果的信心。於是，他采納徐達的建議，毅然下令將船纜全部砍斷，並將所乘船隻全部推入江水中，徹底斷絕了部下將士北歸的希望。徐達的建議使得朱元璋如願以償，一舉攻下了太平。
在朱元璋攻占太平之初，戰爭的形勢並不容樂觀。元右丞阿魯灰、中丞蠻子海牙等率巨艦封堵了采石江口和姑蘇口，不僅斷絕了朱元璋官兵與江北紅巾軍之間的聯係，而且阻截了朱元璋官兵的北歸之路，使得其部下軍心不安。與此同時，方山寨民也趁朱元璋立足未穩之機，向太平府城殺來，來勢極為凶猛。危急關頭，徐達奉命率兵出城，迎戰方山寨民，並將其成功擊潰。但是，元大將蠻子海牙的水師仍扼守著江麵，成為朱元璋的心腹大患。於是徐達在至正十五年八月奉朱元璋之命向東進攻溧水、句容等地，以期截斷蠻子海牙的陸上支援。徐達不負重托，兵鋒所至，所向披靡，連克溧水、溧陽後，又回師與常遇春等合力擊退扼守長江江麵的蠻子海牙的水師，確保了朱元璋安然無恙地進軍江南的基地 太平。
至正十六年（1356年）三月，徐達隨同朱元璋率兵大舉進攻集慶（今江蘇南京市），在順利攻占集慶後的一天，朱元璋巡視城池，對隨行的徐達等說：“金陵險固，古代所稱為長江天塹，的確是形勝之地啊。這裏倉廩充實，人民富足，今天我擁有了它，又能得到諸位的同心協力，何愁大功不成啊！”徐達應聲答道：“成功立業並非偶然，今得此地，乃是上天授予的。”不料，徐達這番迷信且帶謙讓之意的話，在朱元璋聽來不僅順耳，而且深信不疑。當天，朱元璋竟因徐達的這番話，而宣布改集慶為應天。至此，在徐達等人的共同輔佐下，朱元璋終於在江南建立起了一個初具規模的根據地。隨後，朱元璋便坐鎮應天以經營四方，徐達等為之統兵四出，攻城拓地。