2.基礎設施改造工程重複立項申報，浪費財政資金。
3.違反學校合同管理規定，未經學校法律事務辦公室審核，擅自對外簽訂合同。
4.個別項目已購固定資產長期未登記固定資產賬，或已購固定資產還未安裝到位卻提前驗收入固定資產賬，致使賬實不相符。
5.未按合同執行，提前支付項目工程款。
6.固定資產閑置、利用率不高的問題。
7.超範圍超標準支出項目經費。如基建修繕工程用料，為提高檔次、美觀程度，不按項目預算批複的材質用料，提高裝飾標準；購置的設備自行調整型號，不按預算批複的型號、規格、標準購置。
（三）專項經費績效風險問題
1.軟性專項績效風險
（1）出版費執行效果差。造成問題的原因，一是出版費預算製定不合理；二是不能按期出成果。（2）一本圖書或一篇論文標注多個項目成果。有的出版專著書名相似、內容雷同，但標注的卻是兩個項目的成果。（3）差旅費支出不合理：車票與住宿時間不符；同一時間，1人同時去兩地；往返車票不全；出差調研無調研報告等。（4）會議費支出缺少支撐材料：會議無記錄，無議程、參會人員以及簽到簿等。（5）專家谘詢費、學生助研費支付不規範：缺少依據，缺少谘詢內容且支付較頻繁；此外，還有一些專家谘詢費、學生助研費的領取可看出是出自同一人筆體等等。（6）超範圍、超內容支出項目經費：未經審批，自行調整項目預算批複內容。具體表現為以下兩種情形：一是出差調研地點發生變更（與預算申報相比）；二是購置了與項目無關的書籍，如職稱考試、瑜伽（DVD）、素描教程、初中生輔導書等。（7）實驗室購料和領用問題：實驗室大額用料無入庫、出庫手續，無流水賬簿，無法說明真正用料量。（8）外協費的管理問題：外協費支出的科學性、效益性論證不足。
2.硬性專項績效風險
（1）工程質量或設備質量不達標，或未達到立項目標。（2）基礎設施經裝修改造後、設備軟件采購後長期閑置，使用率不高。
二、產生問題的原因
綜觀上述專項經費審計中發現的問題，筆者認為，形成這些問題的原因是多方麵的，有的屬於財政體製原因，有的屬於學校製度不夠完善及已有製度需提高執行力的問題，有的可歸結為項目管理和執行不規範，也有的是屬於專項執行單位或專項負責人認識不到位，還有的屬於“一支筆”簽字人法製觀念淡薄、存在僥幸心理等原因。具體來說，主要體現在以下三個方麵：
（一）財政體製製約
現行的財政體製，專項經費撥款時效性差。財政預算時間較長，導致專項經費撥款時間較晚，使個別專項沒有足夠時間進行有效實施和執行。在這種體製下，個別項目負責人迫於趕進度的壓力，造成理財粗糙、績效意識淡漠，甚至出現違規行為。
（二）內部控製體係不健全
內控等相關製度欠健全和完善。盡管針對專項經費的管理和使用有一些製度規定，但仍有一些細節缺乏明確要求。
（三）有關責任人管理意識、法製觀念不強，部門協作不力
上述問題的出現，與有關責任人法製觀念淡薄、存在僥幸心理、管理意識欠缺、沒有形成全校一盤棋的觀念有關，也有學校部門與部門之間溝通協作不暢的因素存在。
三、強化專項經費管理、提高專項經費績效的對策
（一）增強“一支筆”責任人道德感與法律意識，有效地抵禦外界誘惑
高校近幾年頻頻發生的腐敗案件給各層次“一支筆”責任人敲響了警鍾，從這些案件中可以看出，一些受過良好教育的知識分子也成了腐敗“毒瘤”的犧牲品。究其內因，貪心熾盛、缺乏道德感、法律意識淡薄是使他們走上犯罪道路成為階下囚的根本原因。因此，采取各種措施不斷增強“一支筆”責任人的道德感與法律意識是懲治腐敗與舞弊行為的有效機製，是保護各級領導幹部的根本措施。希望各“一支筆”責任人從他人“落馬”的案件中吸取教訓，不斷提高自身的思想境界，內心建立起堅實的“防火牆”，以有效地抵禦外界誘惑。