這個教派的教法傳播很廣，藏傳佛教各教派都接受過它的影響。到了15世紀，宗喀巴大師以這個教派的教義為基礎，創立了格魯派，然後，原噶當派的僧人和寺院都先後改宗格魯派，“噶當派”就從此消失了。
（二）“三士道”理論
噶當派教法的主要依據是阿底峽尊者的《菩提道炬論》。它主張先學顯宗，後學密宗，並且根據修習佛法者的不同根器，提供了三種不同的修習途徑，這就是噶當派著名的“三士道”法。
《菩提道炬論》把人按照根器的不同劃分成了三大類：
“下士”、“中士”和“上士”。“下士”隻求今世的利樂，不知輪回之苦，也沒有要脫離輪回的願望；“中士”深知輪回之苦，但是隻求自我的解脫；“上士”不僅尋求自我的解脫，而且發願普渡眾生，具有廣大的利他心願。
這三類人學習佛法的動機不同，所修的佛法也就不同。“下士”為了獲得今生或來世的善果而學佛，對應的佛法是“人天乘”；“中士”隻追求自我的解脫，對應的佛法是“小乘”，並且，根據修行的方式，從中又分為“聲聞乘”（由聽佛說四諦法的音聲而獲得證悟的人）或“緣覺乘”（又稱“獨覺”，指世間沒有佛的時候，靠自己觀修緣起性空而獲得證悟的人）；“上士”是為了利濟眾生而學佛，對應的佛法是“大乘”。這三乘的修行之道也就是下、中、上“三士道”。
“下士道”要求修行者珍惜人身、皈依三寶、止惡行善，由此集聚福德，遠離地獄、餓鬼、畜牲道的“惡趣”之苦，獲得人、天的“善趣”利益。但是，這種利益隻是相對的、暫時的，如果要獲得絕對的、永恒的解脫，就必須脫離輪回，必須行“中士道”——這就要求修行者在下士道的基礎上修四聖諦、十二因緣，修學戒、定、慧三學，最後達到涅槃。但是，如果想要讓廣大的眾生也獲得解脫，那就隻有佛才能做到，所以就要修習“上士道”法，發菩提心，作菩提行，為了利益眾生而成佛。
三、薩迦派
藏語“薩迦”的意思是“灰白色的土”，這個教派的主寺建立在一個灰白色的山坡上，所以名為“薩迦寺”，教派也由此而得名。
（一）創建與發展
昆·貢卻傑布（1034——1102年）是薩迦寺的修建者，不過，薩迦派是在他的兒子貢噶寧布（1092——1158年）主持薩迦寺的48年中才真正發展起來的。所以，貢噶寧布被後人推崇為“薩迦五祖”的第一祖，他才是這個教派的創始人。
薩迦第二祖索南孜摩（1142——1182年）是貢噶寧布的次子，三祖紮巴堅讚（1147——1216年）則是貢噶寧布的第三子，四祖是貢噶寧布的第四子貝欽沃波的兒子貢噶堅讚（1182-1251年），他也就是曆史上赫赫有名的薩迦班智達，而五祖則是薩迦班智達的侄子——著名的八思巴（1235——1280年）。
在薩迦四祖時期，薩迦派取得對西藏地方行政事務和宗教事務的統治權，並且使藏傳佛教開始向元朝傳播。在薩迦五祖時期，八思巴被元世祖忽必烈封為國師、帝師，領總製院事，管理西藏地方政教事務，薩迦派也由此成為元朝在西藏統治的代表。在八思巴之後，薩迦派還先後出現了十幾位帝師，在元代可以說盛極一時。
到了元朝中後期，隨著蒙古統治勢力的削弱，薩迦派的勢力也日漸衰落，並且它的內部矛盾也逐漸發展，後來分成了細脫、仁欽崗、拉康、都卻4個拉章，各領屬民、土地。與此同時，帕竹噶舉的勢力逐漸強大，最終在元末明初時將薩迦派在西藏的統治權取而代之。
從那之後，薩迦派在政治上的勢力逐漸減弱，但作為一個宗派，一直都在續傳著。如今不丹王室的國師、當今著名的藏傳佛教高僧宗薩蔣揚欽哲仁波切，就屬於薩迦派傳承。
（二）核心教法——道果法
薩迦派的教法和理論非常雜多，有的人以中觀自續派的觀點為主，有的人則持中觀應成派之見，還有持唯識之學和覺囊派見解的人，另外，也還有許多人推崇寧瑪派的大圓滿法。不過，薩迦派自身所特有的核心教法叫做“道果法”。
道果法在總體上分為顯宗和密宗兩個方麵。
顯宗的理論傳承又分為兩個方麵：跟隨龍樹的教授和跟隨彌勒的教授。