五，藏文大藏經的編撰
藏傳佛教的《大藏經》分為《甘珠爾》和《丹珠爾》這兩大部分，其中，“甘珠爾”意指“佛語譯典”，它所收錄的是顯密佛經和律藏；“丹珠爾”意指“論著譯典”，其收錄以印度佛教大師的著作為主，兼收部分前弘期吐蕃王朝時期有關顯密的論著。吐蕃時期編寫的《青浦目錄》、《龐塘日錄》和《丹噶目錄》三大目錄是藏文《大藏經》的雛形，而公元11世紀的魯梅·慈城喜饒等人編寫的《顯密經典分類和並列目錄》則開創了後弘期的編目之先河。最早進行正式編撰《大藏經》的則是後藏噶當派的納塘寺。
1312年，國師尊巴絳央受元朝皇帝的邀請，駐錫大都，在此期間給他的上師——納塘寺堪布覺丹·日貝熱智寄去了墨、紙張等眾多資具作為編纂《大藏經》所用。堪布覺丹·日貝熱智在弟子衛巴·洛色絳曲益西和譯師索南沃賽、江若絳曲等人的協助下，廣泛搜集藏文譯本，進行整理、彙編、校勘和抄錄等工作，經過多年努力，在完成編撰後，把抄寫完畢的全套《甘珠爾》和《丹珠爾》供奉於嘉拉康殿。
堪布覺丹·日貝熱智編寫了《甘珠爾》和《丹珠爾》的目錄，其中《甘珠爾》目錄稱為《甘珠爾目錄·日輝》，衛巴·洛色絳曲益西又為之編寫了簡目。所以，最早編成的《甘珠爾》和《丹珠爾》被稱為“納塘本”，對它們的抄寫和供奉在那之後就成為了一種風尚。
著名的史學家蔡巴·貢嘎多吉（1309——1364年）在擔任蔡巴萬戶長時，曾特意邀請著名的佛教學者布頓大師以納塘版《甘珠爾》為底本，進一步的校勘和整理。布頓大師住夏魯寺期間，又對納塘本《丹珠爾》進行校勘，完成了“夏魯本”的《丹珠爾》。貢嘎多吉編寫了《甘珠爾》目錄，並用混合的金銀汁書寫了一部《甘珠爾》共260函，史稱《蔡巴甘珠爾》。
六，集大成者的高僧學者
在這一段藏傳佛教自由發展的黃金時期，出現了精通大小五明的薩迦班智達、百科全書式的人物布頓大師、寧瑪派的集大成者龍欽饒絳巴等高僧大德。他們沒有教派偏見地學習顯密經論教法，兼通大小五明學科，對藏傳佛教和藏族五明文化都作出了很大貢獻。
（一）精通大小五明的薩迦班智達
薩迦派的四祖薩班·貢噶堅讚是藏族宗教史上的一位重要人物，他在20歲之前師從劄巴堅讚、庫敦等人學習祖傳諸法和慈氏五論，從22歲起向1204年入藏地的克什米爾大班智達釋迦室利師徒學習聲明、因明、律學、俱舍及其他佛教顯宗經典，又師從尼泊爾班智達桑普紮學習梵文聲明學、《詩境》、聲律學、詞藻學、工巧明等各種學科，同時還熟習噶當派、希解派的教法以及大圓滿和大手印等密法，最終以精通大小五明之學而著稱，被人們尊稱為“薩迦班智達”（意為“薩迦派的大學者”），簡稱為“薩班”。
薩班一生勤於著述，在大小五明方麵皆有很高的成就。他的一生著有大量作品。《薩迦世係史》中對此作了較詳細的記載。如，聲明類的論著有《入聲論》《語言之略義》等；因明類的有《智慧之寶本釋》；修詞類的有《賢者口飾促發修伽陀之悲心》；韻律類有《韻律之花束》；詞藻類的有《詞彙之寶藏》；戲劇類的有《極喜地入門淪》和《樂器論》；工巧類的有《佛像量度淪》和《察地品》；醫方類的論著有《八支攝義》；內明類關於讚詞方麵的有《佛陀讚》等等。
（二）百科全書式的布頓大師
布頓·仁欽珠（1290——1364年）在藏傳佛教史上是一位百科全書式的人物，他在幼年就學過寧瑪派的大圓滿等法，後來又學習了噶舉、噶當、薩迦等派的教法，最後創立了夏魯派。
他通達梵文，學習過聲明學、修持學、戲劇等學科，並掌握了很好的翻譯技巧，是一名出色的翻譯家。他不僅廣泛地學習了各派傳承的時輪密法，還改譯、校正了時輪密法的舊譯本，在對時輪密法的整理和傳播方麵功績顯著。並且，凡是以前譯師們由梵文譯為藏文的翻譯典籍，他幾乎都審閱和修訂過，後世格魯派的宗喀巴大師將他修訂過的經典視為範本。
布頓大師的著述極豐，他的著作、注釋和譯作共計26函、200餘種，包括了曆史、對法、律經、般若、中觀、量釋、聲明、星算、秘典等大小五明，探討和總結了佛教文化的方方麵麵。
他所著的《佛教史·大寶藏論》（又稱《布頓佛教源流》）是第一部由藏族高僧撰寫的係統的佛教教法史，也是西藏早期難得的佛教編年史，對14世紀以後的西藏佛教著述以及藏族史學產生了重大的影響。他的《智者生悅論》一書，為西藏天文曆算學奠定了深厚的基礎。他的《宇宙構造論》進一步闡發了印度時輪派的曆算學說，使之地方化和民族化。