這次，他是以技術專家的身份出席聽證會的。舉行這次聽證會的是原子能的共同委員會，包括參眾兩院議員，旨在調查“原子能委員會”將輻射原料送至美國盟國研究室的這一舉動，是否觸犯國家安全法。
不少參議員以及“原子能委員會”的路易·斯特勞斯，特別關切一批運至挪威的鐵的放射性同位素，這批原料是送往挪威的兵工廠以協助鑄造技術，改善生產的鋼材的強度。
以奧本海默的看法，這些輻射性原料的價值，僅在一般例行的實驗用途中。
他更強調，這些同位素根本不具任何機密的軍事價值。他說，這些同位素在原子能的軍事用途上“不具任何地位”。
他又針對斯特勞斯個人補充了一句：“沒有人能強迫我這樣說：這些同位素絕不可能被用於發展原子武器。因為任何東西都可以用於發展原子武器。你可以說，一把鐵鍁可用於發展原子武器，事實也正是如此。你也可以說一瓶啤酒可用於發展原子武器；事實也是如此。”
“但隻要有一點頭腦的人，就可以看到，不論在戰時或戰後，這些同位素對於發展原子武器都沒有重要作用。依我看，這些同位素的重要性……根本連電子儀器都不如，不過倒是比維生素重要一些！”
在他說完這些話後，整個房間立刻笑聲不斷；不過，很明顯地，其中有一位聽眾並不覺得有趣。
坐在奧本海默身邊的約瑟夫·沃爾普看見了斯特勞斯當時的表情：他眯起雙眼，兩頰肌肉發顫，滿臉通紅，顯然是被激怒了。
斯特勞斯是個不輕易忘記侮辱的人，他總有一天會對奧本海默采取報複行動，來回敬他在這天自以為聰明卻是相當殘忍的行為。
奧本海默和斯特勞斯的分歧，演變成杜魯門總統政府中保守派和自由派間更嚴重的意見之爭的導火線。
蘇聯第一枚原子彈“喬依一號”的成功試爆，也就標誌著美國在國際上這一領域的核壟斷地位已被打破。美國政府頓時感覺到了沉重的壓力。它必須采取一些行動來安撫一般民眾突然襲來的不安全感。
在1949年整個秋天，美國一些政府機構私底下展開了激烈的辯論，辯論焦點在尋求與蘇聯的應對之道上。
其中一邊，包括愛德華·泰勒、路易·斯特勞斯以及美國空軍在內，都要求立即展開計劃，研製可行的氫彈，與之持相反意見的則是“全國性顧問團”大多數成員，甚至還包括“原子能委員會”中的多數委員。
對奧本海默及他的同事來說，要求立即研製氫彈更暴露出訂立限製武器條約的需要；對他們來說，這些軍事將領和其他人發起的武器製造要求，隻是代表著一項大規模武器競賽的開始，競賽中還有數不清的危機隱藏著。
“全國性顧問團”的其他科學家更注意到，把氫彈當成一項軍事武器根本是不可能的；它所蘊涵的爆炸威力之巨大，隻能算是一項毀滅全世界的工具而已！
而陸軍總司令歐瑪·布拉德利將軍也強調，氫彈的價值隻在於它的恐嚇作用。
氫彈注定是城市毀滅者，或者如同奧本海默在“全國性顧問團”呈給杜魯門總統的報告附件中寫的：“一項會造成大規模滅族慘劇的武器。”
因為這個理由，再加上製造氫彈仍有相當大的技術問題，顧問團投票反對了氫彈的研究案。
顧問團中另一成員恩裏科·費米寫道：
基於這項武器威力無限的事實，它的存在以及製造技術對人類來說是禍不是福，不管怎樣，它都是邪惡的。
也因為這些顧慮，我們相信，美國總統有必要讓美國老百姓及全世界的人們都知道，就基本的道德原則來說，要開始這種武器的研製計劃，是大錯而特錯的！
軍方、國防部部長，甚至新任國務卿狄恩·艾奇遜均不讚同這項評估結果。
就在此時，一件事的發生終止了雙方的爭論。
1950年1月27日，英國駐華盛頓大使館的原子能專家弗雷德裏克·雷伊爾·米拉爾爵士緊急訪問了副國務卿羅伯特·墨菲。
他通知墨菲說，英國已經在倫敦逮捕了原子間諜克勞斯·富克斯。
在經過嚴刑拷打和審訊後，被捕的富克斯如實地供認了他在整個戰爭期間以至戰後一直向蘇聯遞送情報的事實。
所有與富克斯在洛斯阿拉莫斯共事過的人，都知道他參加原子彈計劃的深度。
因為，他在洛斯阿拉莫斯的專利委員會內工作過，並負責登記所有可能在戰後申請專利的新發明。因此，人們相信蘇聯必定已經知道有關裂變彈與超級彈的全部重要機密。
愛德華·泰勒也是了解富克斯的科學家之一。
他立即聯想到所有有關超級彈的建議，包括最新的想法，都曾經寫入富克斯提供的絕密《發明登記表》內，現在蘇聯必定全部掌握了這份材料，而且蘇聯人可能看到後還會譏笑他填寫得亂七八糟。
泰勒在大怒之餘，立即采取行動。
在1月30日，即富克斯被捕後的第一個工作日，泰勒與勞倫斯聯名寫信給參眾兩院聯合原子能委員會。
他們明確地指出美國目前已經別無選擇，隻能盡快地推進超級彈製造的計劃。
他們的請求是如此之堅決，使得聯合委員會也不得不立即采取了緊急行動。
委員會的成員們會見了總統，並且憂心如焚地告訴總統說：“你最好駁回顧問委員會的決定。泰勒先生說隻有一種選擇，就是立即全力發展超級彈。”
當天稍晚一些時候，奧本海默也會見了總統，彙報了富克斯涉密的範圍。
然後杜魯門舉行了一次會議，參加者有國防部部長約翰遜，國務卿艾奇遜和利連索爾。
利連索爾仍然堅持反對立場，結果3位總統顧問以兩票對一票決定開始一項研製超級彈的緊急計劃。
第二天淩晨1時左右，在白宮新聞發布會上宣讀了美國總統的如下聲明：
身為三軍總司令，我有責任保衛我的人民抵抗任何可能的侵略。因此，我指示“原子能委員會”繼續所有核武器研製計劃，包括氫彈，也就是超級炸彈。
這樣，奧本海默竭力爭取的終止軍備競賽的局麵就壽終正寢了。杜魯門的決定不僅打開了熱核軍備競賽的大門，而且改變了美國政府內部各派力量的平衡。