5月，史語所遷往北平。
6月，中央研究院聘傅斯年為曆史語言研究所所長。史語所遷入北海靜心齋。
9月，史語所所務會議議定，將原設八組並成三組：史學（第一組主任陳寅恪）、語言學（第二組主任趙元任）、考古學（第三組主任李濟）。
高小時期，羅家嶺小學從省城安慶請來算術教師馮溶生。
馮氏為懷寧縣人，時尚不過三十歲，程度不錯，課講得精彩，令耕望對算術發生濃厚興趣，不斷看課外書，並自己找習題做，尤喜四則難題。當時學校課本，每課隻四五道練習題，但難度很大。
耕望感到題目越難，越有興趣，因為難題才好轉彎抹角的思考，設法得到正確的答案，增加成就感。小學畢業時，耕望已把初中一年級的數學習題都做完了。其時做算術尚用毛筆，耕望的預習初中算術簿，直到1946年還留在羅家嶺初級中學作學生的範本。
〇民國十九年庚午（1930年） 十四歲
高小畢業，耕望到安慶入安慶初級中學就讀，仍對數學特感興趣，而文科程度顯得很差。一日，在樓上做功課，聽一位同學和一個同鄉在樓下聊天。同學稱讚耕望的數學好，那位同鄉卻說“嚴某連一封信都寫不好，數學再好又有什麼用”，聽後很受刺激。不久，長兄德明亦勸耕望對國文下點功夫，自此始考慮如何增進國文程度。聽聞陳壽的《三國誌》是好文章的典範，自己看過《三國演義》，以為內容差不多，遂買了一部來看，發現生字極多，文章不易懂，借助字典硬著頭皮看下去。一年下來，雖然還未看完，但閱讀能力卻頗有進步。
秋，江蘇省立蘇州中學國文教師錢穆，在北平燕京大學曆史係教授顧頡剛推薦下，到燕大講授大一大二國文。此前，錢穆已撰有辯駁康有為《新學偽經考》所說之非的《劉向歆父子年譜》一文，刊於顧頡剛擔任編輯的《燕京學報》。來平授課之餘，乃就蘇中時期已開始撰述的《先秦諸子係年》稿續加增補，並作《通表》，凡三閱月而訖。
〇民國二十年辛未（1931年） 十五歲
錢穆執教燕京大學，終感教會學校環境不易適應，故一年即辭職。
夏，錢穆在蘇州得北京大學聘書。及到北平，清華大學亦請兼課。殆皆出自顧頡剛預為安排者。錢穆任教北大曆史係，第一年開課三門，“中國上古史”與“秦漢史”皆為學校指定之必修課；另一選修課由其自定為“近三百年學術史”。彼時北方學術空氣濃厚，加之北大講學自由，曆史係除錢穆所開“上古史”為必修課之外，別開八門“上古史”選修課，各教授分別講授，意趣各異。“近三百年學術史”一課，前有梁啟超在清華研究院開授，其時梁卒後未久，錢穆續開此課，取徑與任公迥殊，故亦特受注意。
教者尚未講，講義已流傳校外，眾相討論，竟至有“上課幾於登辯論場”之勢。
繼《三國誌》後，耕望又自修《左傳》，看《曾文正公家書》、《飲冰室文集》之類書，對國文漸感興趣。其中，《曾文正公家書》為國文老師謝養和指定之課外讀物，耕望非但仔細看過，且作了摘要。進而讀《論語》、《孟子》、《老子》、《莊子》；又看到一本漢譯德國某人所寫有關修身的著作，內中分項列表，每日自記其過失。自謂一生的生活與做人受這些書的影響很大。寒暑假回家，則時時翻閱詩集以為消遣，但隻是咿唔亂唱，並不真懂。
錢穆至北平，即與傅斯年相識，屢受其邀至史語所。史語所有宴外國學者如伯希和之類，錢穆常坐貴賓之旁座。傅斯年必介紹是乃《劉向歆父子年譜》之作者。其意在以此破當時經學界之“今文學派”，乃及史學界以顧頡剛為代表之“疑古派”。惟其時錢穆之疑古思想且有甚於顧頡剛，繼此以往，遂與傅斯年意見亦多不合。此一時期，傅斯年給錢穆的印象是：
孟真在中國史學上，實似抱有一種新意向。惟茲事體大，而孟真又事忙未能盡其力，以求自副其望，而遂有未盡其所能言者。彼似主先治斷代史，不主張講通史。彼著述亦僅限先秦以上，即平日談論，亦甚少越出此範圍，凡北大曆史係畢業成績較優者，彼必網羅以去，然監督甚嚴。有某生專治明史，極有成績，彼曾告餘，孟真不許其上窺元代，下涉清世。然真於明史有所得，果欲上溯淵源，下探究竟，不能不於元清兩代有所窺涉，則須私下為之。故於孟真每致不滿。
〇民國二十一年壬申（1932年） 十六歲
春，錢穆又為《先秦諸子係年》撰成《再論老子成書年代》一篇。
6月，“九·一八”事變後，華北局勢日非，史語所考慮南遷。
初中時代，耕望讀書實頗用功，而尤不愛運動。長兄德明一次於信中勸其注意身體，謂身體即如一隻船，學問如同載量，船不堅固，甚至破壞了，如何還能運載！此語給耕望留下極為深刻之印象。
新學年，錢穆在北大曆史係開設的選修課改為“中國政治製度史”。曆史係主任陳受頤以為，今已民主時代，此前中國君主專製不必再講，是以曆史係學生無一人選課。但法學院院長周炳霖以為政治係同學隻知西洋政治，不知中國政治，遂有政治係全班學生選聽此課。稍後曆史係同學多來旁聽，乃知中國君主專製政治，亦有可討論者。
〇民國二十二年癸酉（1933年） 十七歲
春，長城戰事起，日軍飛機盤旋北平城上，仰首如睹蜻蜓之繞簷際。錢穆恐《先秦諸子係年》書稿散失，始覓人寫副本，亟謀刊布。
初中畢業。耕望少年時代即深契“讀萬卷書，行萬裏路”之意，欲投考黃山二中，以就黃山。未果，意甚憾之。在安慶高級中學讀了一年的高級師範科，對《論理學》（即邏輯學）一課別有會心。
秋，北京大學請錢穆獨任部定課程“中國通史”之講授，並特置一助教。早先，該課在北大由多人分時代講授。錢穆以為多人講授，彼此不相通貫，失去通史意義。且通史必須於一年內，自古至今，一氣講授完畢，絕不可有首無尾，有失通史課程之精神。因此集中全副精神，為此課作準備，務期章節間彼此相關，上下相顧，俾學生對於中國曆史能有一貫而全麵之概括性了解。
每周兩次課，每次兩小時，課前一日，錢穆例到草坪茶座，擇幽靜處，斟酌講稿。通史為文學院新生必修課，但高年級與其他學院、其他學校學生旁聽者亦不少，每堂常近三百人，坐立皆滿。
與此同時，為續成《中國近三百年學術史》講義稿，新學年錢穆仍開“學術史”為選修課。
10月，中研院史語所留第一組少數人在北平整理明清檔案，其餘人員南遷上海曹家渡極斯菲爾路145號小萬柳堂。