在30多名恐怖分子中，有兩人竟是來自車臣的親兄弟。這之前，他們住在車臣一個叫做斯塔裏·安吉諾伊的小村莊。他們的父親——一位70歲的老人阿布格哈迪·庫拉耶夫看電視新聞時，居然看見了自己的兩個兒子——24歲的努帕薩和31歲的罕帕薩，兩兄弟竟然都是參加別斯蘭中學人質事件的恐怖分子。老人露出一臉困惑和恐怖的表情，囁嚅道：“這太令我震驚了。”努帕薩曾是俄羅斯軍隊的一名前軍士，有一個兩歲大的兒子和4周大的女兒。後來，他和兄長罕帕薩一起幹建築工。1994年，罕帕薩與車臣叛軍匪首巴薩耶夫建立聯係，曾是他手下的一名戰地指揮官。數年前，努帕薩和罕帕薩兄弟倆去了印古什。庫拉耶夫老人痛苦地說：“我從電視上認出了他們倆。我們是這麼地感到羞恥，我們甚至再也不敢走出家門，麵對村民和鄰居。我無法相信我的兩個兒子竟會做出這樣的事。他們不應該殺死孩子。”
調查人員指出，參與別斯蘭學校人質事件的恐怖分子無一例外都曾參與過早些時候（2004年6月）造成90人死亡的印古什襲擊事件。印古什內政部副部長穆薩·阿皮耶夫說：“襲擊印古什的就是這些人。他們打一槍換一個地方，四處流竄作案。”
此外，恐怖分子中有10名阿拉伯人，其中一些來自約旦和敘利亞。
32名恐怖分子在前往學校的途中曾設法躲避檢查，而且他們在沿途找了好幾個警察幫助他們通過關卡，這些警察很可能是被迫的。
同2002年莫斯科人質事件一樣，製造別斯蘭中學事件的恐怖分子也事先把武器運進了這座城市、這所學校，而且，他們幹得更加“出色”。
暑假期間，學校對一些設施進行修繕，施工人員中有一些印古什人，把炸藥隱藏在學校，或許就是他們幹的。他們把爆炸物藏在體育館地下室裏，這是最安全的儲藏室，因為義務替恐怖分子保管爆炸物的，就是學校的教職員工和學生，整整兩個月，他們一無所知，而後來，他們又成了恐怖分子的人質。這對俄羅斯安全部門而言，真是一個絕妙的諷刺。
恐怖分子衝進學校體育館後，當著眾多人質的麵，從地下室取出了大量爆炸物。直到整個恐怖事件結束後，清理現場的工兵還在那裏發現了大約50公斤未來得及使用的炸藥。
警方對此事的解釋是：學校裏可能藏有內奸，因為恐怖分子不可能把爆炸物放在學校幾十天而不加照管，如果他們並不知道爆炸物是否還安全地保存在原地，是否能使用，他們是不會輕易進入學校的。
此外，當眾多人質被趕進體育館後，恐怖分子毫不費力就知道了其中的幾名高級幹部子女，而且很快就將他們找了出來。例如北奧塞梯議長馬姆蘇羅夫的兩個孩子都是在這種情況下被恐怖分子從人群裏揪出來的，他們逼著議長11歲的兒子和15歲的女兒與這位議長通話，以此要挾。十分幸運的是，馬姆蘇羅夫議長的兩個孩子最後都奇跡般逃出了體育館。
上述兩件事表明，別斯蘭中學裏確實藏有內奸，為恐怖分子幹事和通風報信，當然，也許內奸不在學校工作。但是，誰是內奸，最終也沒能發現、清除。
落網的恐怖分子均受到法律的製裁。9月6日，首名參與製造北奧塞梯共和國別斯蘭中學人質事件的嫌疑人被送上法庭，受到正式起訴。這名男子沒有刮臉、雙手反銬在背後，他的俄語帶有濃重的北高加索地區口音。他情緒激動，高聲喊叫：“我沒有開槍！”“我沒有殺人！”
10月17日，俄羅斯副總檢察長舍佩爾宣布，在別斯蘭人質事件中，32名恐怖分子都是吸毒者。他們在毒癮的控製之下，劫持了人質，製造了這起震驚世界的慘劇。舍佩爾說，對這匪徒的屍體進行的化驗表明，他們全是長期吸毒者，其中22人定期注射海洛因和嗎啡。在劫持人質後期，有的匪徒毒品用完，症狀發作，失去理智，行為開始失控。在2002年莫斯科劇院人質事件中，綁匪也服用了毒品，以在較長時間裏不睡覺，保持神經興奮。
（2）全力以赴搶救傷員。
至9月4日清晨，已有700多名傷員在醫院接受緊急治療。俄總理弗拉德科夫責成衛生和社會保障部、教育部、財政部、緊急狀況部等相關部門，與北奧塞梯共和國共同製定方案：向遇難者家屬和傷員提供幫助，恢複校舍等，以消除人質事件所造成的後果。普京離開別斯蘭之後，緊急狀況部長紹伊古留守事發地，處理相關事宜。衛生部長和教育部長也於5日前來參與事件的處理。俄緊急狀況部的飛機還將數名傷勢嚴重的學生運往莫斯科，進行搶救。
（3）積極做好心理疏導工作。
俄紅十字會委員會在北奧塞梯設立了心理谘詢工作站，並派出36名心理學專家向此次恐怖事件中的受害者及其親人提供心理幫助，對事件中受到傷害的孩子進行一對一的工作。