五路退兵之後，擺在諸葛亮麵前的重大戰略課題就是蜀漢組織在“後劉備時代”該何去何從？
劉備不聽諸葛亮勸阻，親自率兵討伐東吳，終遭致慘敗，連劉備本人也在受此重創後黯然離世。這件事情對諸葛亮的打擊是極其慘重的。表現在兩個方麵。
第一個方麵是對諸葛亮內心的打擊，讓他覺得自己沒有兌現“自比管樂”的豪言（詳見上一節）。第二個方麵則是對諸葛亮外在權威的打擊。向來對諸葛亮言聽計從的劉備，竟然會將諸葛亮的苦諫拋之腦後，而諸葛亮作為一個無所不能的“神”，竟然不能阻止、減小、挽回蜀漢的這一場大傷元氣的慘敗。人們對諸葛亮的懷疑也隨之產生。諸葛亮苦心經營的自我形象包裝頓時處於坍塌的邊緣。
諸葛亮閉門不出，固然是為了在劉禪麵前自高身價，但也還有另一個考慮。那就是，他必須盡快重新規劃好整個組織的戰略抉擇。
必須與東吳講和！這是非常痛苦的一個決定，蜀漢已經是三國中最弱的一環了，隻有不計前嫌，才能力挽危局。但是，諸葛亮非常擔心，在自己的權威已經遭到懷疑的前提下，自己提出這樣一個方案，會遭致什麼樣的反對。畢竟，與東吳之間的爭鬥，讓蜀漢喪失了劉備、關羽、張飛、黃忠等一大批開國元勳。這樣的對手，應該是勢不兩立的，怎麼能夠主動與之講和呢？
諸葛亮根本不擔心五路進兵，但卻對自己提出這個想法沒有把握。他隻有通過裝病來試探劉禪的底線，來試探文武百官的底線。
當諸葛亮很快就等到劉禪親自登門拜訪，文武百官靜候門外後，諸葛亮的自信也就很快恢複了。在這個組織中，他的權威仍在，並且已經是事實上的第一號人物。他決定施行“連和東吳”的戰略。
但是，諸葛一生唯謹慎。這句話還真不是白說的。盡管諸葛亮已經決定要這樣做了，他還是決定，不能由自己率先提出這個主張。否則，一旦施行不利，還是會影響到他的權威。
諸葛亮送劉禪出門。文武百官環立靜候，看見劉禪麵露喜色，眾人皆大惑不解。唯有一人，仰天而笑，麵露喜色。諸葛亮心中一動，吩咐下人暗中留下此人。此人名叫鄧芝，乃東漢開國功臣鄧禹之後，現任戶部尚書一職。
等眾人散後，諸葛亮請鄧芝到書院閑談。
諸葛亮問：“現金蜀、魏、吳三國鼎立。我國是漢室正統，要討伐魏吳，一統中興，你覺得應該先討伐哪個國家？”
諸葛亮深藏不露，故意以此問題來試探鄧芝的態度。
鄧芝說：“以我的愚見，魏國雖是漢賊，但實力雄厚，急切間不能根除，應當徐徐圖之。現在主上剛登寶座，民心未安，我覺得當務之急是與東吳連和，拋棄先帝的前嫌，唇齒相依，才是長久之計。不知道丞相鈞意如何？”
諸葛亮一聽，嗬嗬大笑，說：“這個問題我已經考慮很久了。隻是沒找到合適的人選。哈哈，直到今日，才算是得遇其人啊。”
諸葛亮當即要求鄧芝出使東吳，促成兩家連和。鄧芝果然不辱使命，為諸葛亮撫平了一大心病。
前麵已經說過，劉備之死令諸葛亮倍受打擊，他必須竭盡心力，全力攻伐曹魏，以實際戰績來證明自己才勝管樂，亦不負劉備所托。而聯吳之後，要征討魏國，必須做好各方麵的準備。諸葛亮苦心經營，終於兵強馬壯，糧草充足。但是，要讓國家突然從和平狀態進入戰爭狀態，也還需要一個好的契機和理由。
正當諸葛亮苦思冥想之際，益州飛報，蠻王孟獲，勾結建寧太守雍闓（漢朝什方侯雍齒之後）一起造反。牂牁郡太守朱褒、越雋郡太守高定獻城投降。隻有永昌太守王伉不肯反，與功曹呂凱會集百姓，殊死抵抗。雍闓、朱褒、高定三路人馬，作為孟獲的先鋒部隊，正在攻打永昌郡。
這正好給諸葛亮提供了一個好機會。諸葛亮立即奏知後主劉禪，要親領大軍征討。
南蠻之亂，其實不過是癬疥之患，隻需派一大將即可掃平。劉禪很不理解諸葛亮為什麼要親自出馬。劉禪說：“東有孫權、北有曹操，都是心腹大患。相父親自去征討南蠻，如果吳魏發兵，該如何是好？”
諸葛亮說：“如今我國已與東吳和好，無需多慮。就算他有什麼異心，有李嚴在白帝城，也能夠抵擋住陸遜。而魏國剛剛征吳大敗，銳氣已喪，短期內不會輕舉妄動。陛下大可不必擔心。老臣這次先去掃蕩南蠻，以絕後患，然後再行北伐，圖謀中原，以報答先帝三顧之恩、托孤之重任。”