第一節 Bm109基因生物信息學分析
一、Bm109的核苷酸和其編碼的氨基酸的序列特征
Bm109（orf109）全長663 bp，編碼221個氨基酸，預測分子量是25.2 kDa。其轉錄的方向和多角體轉錄方向相同。1個晚期轉錄基序ATAAG發現在ATG上遊的6nts，1個加尾信號ATTAAA發現在TAG下遊的63 nts處。通過GenBank和Swiss Prot 預測保守區和功能區，沒有發現信號肽、跨膜區和核定位信號。
二、Bm109的氨基酸同源性分析
登錄網站Swiss Port用Blast 搜索Bm109的氨基酸序列後發現，有11種杆狀病毒編碼的蛋白有Bm109的同源序列。Bm109和這些蛋白的同源性介於30%~93%之間，其中與AcMNPV的同源性高達93%。與EppoMNPV的同源性最低，隻有30%。
氨基酸序列比對用Clustal W和Cenedoc軟件。用3個陰影水平來表示它們之間的同源性高低：黑色表示100%同源，深灰色表示80%同源，淺灰色表示60%同源。
第二節 Bm109在BmN細胞中的轉錄與表達
一、Bm109的轉錄時相
從感染了BmNPV不同時間的BmN細胞中提取總RNA，進行RT PCR，顯示從感染病毒後12小時開始，樣品中出現了一條約為237 bp的條帶，該轉錄本一直持續到感染後72小時。同時，315 bp的ie1的轉錄從感染後6小時開始檢測到，直到72小時。而193 bp的p10的轉錄直到24小時才檢測到。上述結果表明Bm109可能是一個晚期基因。熒光定量PCR（QRT PCR）也反映出相應的趨勢。
二、Bm109的表達時相
為了進一步確定蛋白在感染細胞中的表達情況，收取了BmNPV感染的BmN從0小時、6小時、12小時、24小時、48小時和72小時的細胞樣品，用Bm109多克隆抗體進行Western blot分析，確定了該蛋白在病毒感染細胞中的表達時相，同時無His的Bm109蛋白作為對照。結果發現在感染後24~72小時的細胞中均有一條大小為25 kDa的特異蛋白質帶能與Bm109抗體發生特異性反應，而且大小與無His的Bm109蛋白雜交的結果一致。上述結果表明該蛋白從24小時開始可以檢測到，是一個晚期表達的蛋白。
第三節 Bm109的亞細胞定位
為了確定Bm109的亞細胞定位，用BmNPV感染BmN細胞，在感染後收集細胞，用Bm109的抗體和羊抗兔的二抗進行免疫雜交後，在激光共聚焦顯微鏡下進行觀察。為了確定Bm109蛋白在整個病毒感染過程中有無發生轉運，對感染後24小時、48小時、72小時收集的細胞進行了觀察，結果顯示在病毒整個侵染過程中24小時Bm109蛋白一直存在於細胞質內，48小時後Bm109大部分定位在細胞質，但在細胞核中也隱隱可見，在72小時Bm109蛋白開始出現在細胞核中。表明在感染早期Bm109定位於細胞質，到感染晚期Bm109在細胞質和細胞核中都有定位。
分別收集BmNPV的BV和ODV病毒粒子以及BmNPV感染的BmN細胞的總蛋白，用Bm109蛋白抗體對其總蛋白進行Western blot分析，結果在ODV病毒粒子的組分中發現25kDa的蛋白帶，在BV中沒有發現，而在對照BmNPV感染BmN細胞的組分中檢測到1個大小約為25 kDa的蛋白帶（使用Bm51的抗體作為BV蛋白的Western blot檢測的陽性對照）。結果表明Bm109是BmNPV病毒粒子的結構蛋白。