除了鬼神之外，祖先、巫師也被視為導致原始人患病的另兩種個體力量。原始人類通常會對創立部族的遠祖、聲望超群的領袖、孔武有力的英雄等祖先頂禮膜拜。他們雖早已去世，沒有了生前的肉身，但靈魂卻還存在。這些靈魂關注著後代的一切，不僅能夠調節氣候決定農業收成，而且還能隨意暫時附在原始人類的身體之上。如若對祖先有所不敬，怠慢失禮，侵入人體的靈魂就會降下災禍，懲罰世人，導致各種疾病甚至死亡。此外，巫師的力量也不容小覷。法國社會學家路先·列維－布留爾（1857—1939）在其《原始思維》一書中，引用羅特的觀點，以文明社會中保留原始社會文化傳統的土著人為例，介紹了他們對疾病源頭的看法。在澳大利亞北昆士蘭布裏斯本區的殖民地，歐洲殖民主義者最初到那兒的幾年中，他們發現當地的土著人有這樣的一種觀念：幾乎所有的病痛都是由某些巫醫掌握的石英石造成的。石英石賦予了它的所有者超自然的力量。巫醫的魂迫使這個石英石進入犧牲者的身體裏，隻有由另一個巫師用吮吸的辦法把它吸出來，才能治好病。因此，巫醫被認為是能夠在遠距離使人得病並且能夠使他注定死亡的人。
在這種鬼神致病的觀念裏，疾病被當作一種外來物，人與病相互對立。原始人罹患疾病，是因為天神、鬼怪、祖先的靈魂及巫師的魔力進入人體，據為己有，並能奪取患者的知覺，還可借助患者的身體來行動。原始人往往會通過一些較為特殊的經曆，建立起對疾病的認識。他們晚上做夢的時候，就會感覺到好像別人的靈魂正在進入自己的身體。原始人有時看到患者癲癇發作，或者頭腦發昏從床上跳起來，或者完全喪失理智，這一切似乎暗示，有種外來的力量劫持了患者的身心，控製著他的一舉一動。一份公元前650年的巴比倫泥板文書，對此有相當詳盡的描述：“如果發病時患者坐著，那麼左眼會斜向一側，口唇緊閉，口中流涎，左側手、腳、軀幹痙攣，像隻待宰的羔羊，這就是魔鬼附體。若發病時意識清醒，便能將惡魔驅逐出體外；若意識不清醒，惡魔就會附體。”
因此，在原始人的心目中，疾病本身也是一個生命，一個敵人。而身邊能夠有效對付這個難纏宿敵的人，就非部族的巫師莫屬了。
1.2.2戴鹿角的巫醫
根據德國學者文士麥所撰《世界醫學五千年史》一書的記載，1914年7月20日，一個炎熱的夏日，法國南部比利牛斯大區上加龍省圖盧茲大學古代史教授孔特·亨利·伯高恩，與他的三個兒子一同出外旅行。他們趟過阿列日省的一條小溪，而這條小溪正是流經圖盧茲城南部比利牛斯山麓加龍河的支流。
由於酷暑難當，父子三人就在離蒙泰斯基厄阿旺泰不遠的路邊坐下稍事休息。這時候，一位農夫從旁邊走過，對他們說道，何必坐在這個熱烘烘的地方，離這兒不遠處就有一個愜意得多的休息場所，在那個地方，即使是在最炎熱的日子裏，也有涼氣從地底下冒出來呢！
伯高恩教授當時猜測，從地下吹來的這股涼氣，很可能來自一個地下洞穴。於是他按照農夫的指點，帶著兒子們來到了這個“喘氣洞”。他們把半掩著洞穴進口的石塊清理掉，果然看到有一條縫隙裂入地底。這激發了伯高恩教授一行人的探索欲望。他們弄來繩索和提燈，讓一個兒子身上纏著繩子，小心翼翼地沿縫隙而下，下了60英尺左右（約合18.3米）就到了洞底。守在洞口的父子三人焦慮中帶著幾分渴望，期待著進洞兄弟發出信號。
約摸過了1小時多一點的時間，繩子終於動了起來，洞口兩位兄弟一齊用力，把進洞的兄弟拖回到地麵。進洞的小夥子起初是太激動了，以至於連話都說不出來。最後他總算脫口說出一句話：“洞壁上有成千幅圖畫！”之後的考古發現證明，他的說法並無誇大之處。為了紀念發現者，這個洞穴被命名為“三弟兄岩洞”（又名特洛亞·費萊爾洞）。洞內的岩壁十分陡峭，那些互相覆蓋的線雕就刻在峭壁之上，雕刻得很深，在淺色石壁的襯托下，產生了浮雕般的藝術效果。
在數不清的岩畫裏，有一幅半人半獸的形象，被畫在13米高的岩壁之上，這可以說是已知最古老的關於醫者的代表岩畫性岩畫：一個冰河時代戴有動物麵具的巫醫，上身前傾，下身直立，頭上戴著枝丫錯落的鹿角，兩耳直豎，雙目圓睜，長長尖尖的胡須拖甩在胸前，頸部有毛，類似野牛的肩峰高高隆起，肌肉清晰可辨，手部酷似動物的前爪並攏舉起，頗似人類的雙腿在向前邁步，腳也與人腳一樣，尾巴下垂，向後微微揚起，男性的生殖器也被逆向標明出來。他被法國考古學家步日耶（1877—1961）解析為巫師，是冰河時代最為奇特的藝術造型之一，也是距今17000年的歐洲舊石器時代晚期馬格德林文化的焦點所在。這位巫醫之所以戴上動物麵具，一方麵可能是為了嚇跑那些帶來疾病的妖魔，另一方麵或許是為了給患者留下更為深刻的印象，從而使患者對其所念的符咒、戲劇性的儀式表演與所開的藥方深信不疑。
1.2.3神奇穿顱術
根據古代民族共有的基於萬物有靈論的鬼神治病觀，便不難想象這個戴鹿角巫醫治療疾病的方式。那些淺層的可見病痛是易於治療的。例如，在去除了身上的棘刺、石刺或寄生物之後，損害或痛苦的原因便消除了，也就自然而然地逐漸痊愈了。同樣，對於深層的不可見的疾病，原始人也產生了除去的觀念。但事實上這些疾病無法被輕易治愈。既然原始人將疾病視作有目的地針對褻瀆神靈、招惹精怪、輕慢祖先、得罪巫師等這些忽視禮節的行為的報複與懲罰，那麼，要想治療與宗教信仰、社會行為關係密切的個人疾病，必須借由巫醫采取適當的獻祭儀式，以使神靈、妖魔、祖先、巫師息怒，從而驅逐由於過失行為而帶來的苦難。
文明社會的土著人，留存了包括宗教儀式、唱歌、巫術及符咒在內的治療方式樣本。例如，非洲巫醫引誘蟑螂以絆住犯罪精靈；美洲印第安人的治療者，會用整天跳舞、呼叫與敲鼓等治病儀式，以驅走邪惡的精靈，誘回失去的靈魂，或勸解一個犯罪神。
此外，新石器時代出現的一種帶有驅逐妖魔或釋放精靈性質的巫術儀式——穿顱術（又稱鑽顱術或環鑽術）——足以令現代人感到震驚。這種在人的顱骨上麵鑽孔打洞的手術，即使在今天也被認為是最困難和最擔風險的。出人意料的是，大量的史前時期的帶有鑽孔的顱骨，在法國、西班牙、德國、奧地利、俄羅斯和波蘭的新石器時代的洞穴中被發現，偶爾也在英國和秘魯出土。有些顱骨愈合正常，在孔洞的四周留有新生骨組織的痕跡，說明這個人在施行攸關生死的穿顱術後得以繼續存活了一段時間。
古人類學家已經發現，史前時代一些部落的巫醫進行既困難又危險的顱骨鑽孔術，既是出於宗教目的，也是為了實際需要：可能是緩解頭痛、癲癇或其他不適的一種嚐試。一個似乎更加合適的解釋可能是，患者顱骨損傷以後，骨碎片壓迫在大腦的一定部位會引起痙攣及不堪忍受的頭痛（像周期發作的偏頭痛之類），史前時期的巫醫在碰到這類突發情形時，可能假定那是一種邪惡的精靈棲身於顱骨之內，認為在那上麵打一個洞，或可為精靈提供一條逸出的通路。精靈遠離之後，患者的疾病就會自然痊愈。
洛伊斯·N.瑪格納在其《醫學史》一書中提出，史前的外科醫生使用了三種鑽孔方法。第一種技術，是利用一塊尖銳的石頭或金屬器具，在事先選定的區域刮鑿頭骨，直到鑿刻出一條弧形的溝。當這條溝足夠深時，大概會形成一個紐扣狀的小圓盤，這樣便能夠比較容易地將其從顱骨中移去。第二種技術出現在秘魯。最普遍、最常用的方法是，在顱骨上大致沿著圓形的邊緣鑽出一係列小孔，等這些小孔圍成一個圓圈後，就利用鋒利的燧石或石刀，去除或撬開這塊圓盤形的顱骨片。顱骨片取出後，通常會被再次打洞，患者可能會將顱骨圓盤當作護身符和驅邪物，或掛在脖子上，或隨身佩戴，以期日後能夠避免更多的不幸。第三種技術，可以稱為不完全的或可能帶有象征性意義的環鑽術。具體來說，頭骨上隻刻出淺淺的圓盤輪廓，但並不去除骨片。
意大利醫學史學家卡斯蒂格略尼在其《世界醫學史》中曾提到，原始人施行穿顱術的部位，最常見的是前頂，其次是額部，也見於顳部。施術時巫醫常用催眠藥使患者昏迷。而且在較近的年代裏，有些位於俾斯麥群島、玻利維亞和秘魯等地的原始部族，仍用原始方法實行穿顱術。1874年，有位英國傳教士埃拉就曾經見到，洛亞爾提群島的人沿頂骨與額骨之間的冠狀縫行十字切開。
除了穿顱術之外，另一個在顱骨上留下記號的外科手術被稱為“前頂殘缺”。這個手術中的“記號”是一些由於燒灼而引起的傷疤。帶有這種特殊損傷的新石器時代的顱骨，在今天的秘魯、歐洲和印度被發現。外科醫生先在患者的頭皮上做一個“T”形或“U”形的切口，再把沸油或者浸透沸油的植物纖維繩索接觸於暴露的骨骼上。無論哪種燒烙法，都會對覆蓋在骨頭上的厚纖維膜造成長久性損害。對於原始人而言，為了驅除妖魔、恢複健康，忍受這種燒燙之苦似乎也是值得的。
關於穿顱術的諸多研究表明，這種手術可能曾是對顱骨外傷的合理治療。盡管當時缺乏有效的消毒技術，需要冒著巨大的手術風險，但是，原始社會的巫醫仍然受到利用宗教儀式驅趕神魔這種信念的驅使，頗為熟練地完成了令現代人驚歎不已的顱骨開鑿與鑽孔。
1.3追尋藥的迷蹤
原始人外治疾病的手段，除了在遠古時代已經掌握的驚人的穿顱術，還包括利用銳利石器取出各種異物、放血、切開膿腫，以及拔火罐、熏煙、蒸汽浴、按摩、泥罨等。與此同時，自然界賜予原始人的各種帶有神奇藥效的植物、動物與礦物，也通過巫醫的不懈探索，將這些具有藥理學活性與效能的藥物一一展現在世人麵前。《伊利亞特》曾提到：
秀發的阿伽墨得，此女識曉每一種藥草，生長在廣袤大地上。
1.3.1根莖果葉入藥用
原始人在日常活動中，很可能觀察到動物吃下某些植物後的反應，才得以獲知關於植物療效的知識，認識到有些植物是有毒的，有些則能產生若幹治療效果，還有一些植物則具有止痛或減輕疾病痛苦的作用。
在西班牙人占領以前，美洲印第安人早已發現了許多具有治療效果的植物。胡椒的抗膿性炎症作用，馬替草和瓜拉那的療效，還有咖啡、茶與可可的興奮作用等，皆為他們所熟知。他們還知道莨菪堿有麻醉作用，從而使用了主要包含莨菪堿成分的曼陀羅花。尤為難得的是，在斯頓列出的印第安人用來治病的144種藥物中，有59種仍見於現代藥典。根據藥理作用，可將美洲印第安人所熟知的藥用植物分為很多種類，諸如解熱藥、緩瀉藥、催吐藥、鎮痙藥、利尿藥、緩解呼吸藥、止痛藥、鎮靜藥、興奮藥及幻覺藥等。
印第安民族的曆史，以及至今仍居美洲偏僻一隅的印第安人後嗣所保持的習俗顯示，行醫之人的觀察能力甚或可以說高過了現代人。因為他們從長久經驗中獲得了銳敏的感覺；這種銳敏的感覺正是很有意義的資本，並且與合理的治法聯結在一起。
中國的一些少數民族，在1949年之前依然處於原始社會末期階段。這些少數民族基於不同的自然環境和生產水平，各自總結出治療疾病的植物藥。據此，可推斷出原始人的相關認識。
自古繁衍生息在黑龍江以北的大興安嶺、小興安嶺地區，長期以狩獵、采集和捕魚為生的鄂倫春族人，對於出血的傷口，摘“安摩草”熬水，或口服，或擦傷口，用以止血；對於腫痛和關節炎，使用“八股牛”草根、“那拉塔”小樹，熬水擦患處，或剝“烏道光”樹皮包裹患處，可以起到消腫的作用；挖“摩加其”“木克切”草根或用“翁流東”莖熬水口服，治療腹瀉。
主要聚居於雲南省西北地區的普米族人，把蓖麻子炒幹、研末包腳心，並口服冬莧菜，來治療死胎不下；用黑豆子，治愈產後風寒；采“挖耳草”泡酒，可療疔瘡；將黃芩研細末加水，包於患處，能夠治癰；把羌活、獨活、木通泡酒，口服，治腰肌勞損和風濕性關節炎；使用野苦蕎根、麻芋兒，治瘋狗咬傷及狂犬病；取野蘆子藤，打絛蟲。
分布在雲南省西南部瀾滄江與薩爾溫江之間、怒山山脈南段的“阿佤山區”的佤族人，會利用獨子葉治腸胃病和便秘，剝桂樹皮健胃；而大蒜、香菜、蔥、薑等植物，也是佤族人治病過程中常用的藥物。
雲南省獨有的居住在海拔1500~2000米山區的景頗族人，采摘野蘆子藤，用於不孕症的治療；將“嘴抱七”根含於口內，能起到止牙痛的效果。
具有悠久曆史和古老文化的彝族人，采冬莧菜治婦科病，用草烏愈眼疾，以貝母止咳，摘石尾草治療瘧疾。
中國少數民族當中，分布在西藏珞渝地區的珞巴族人人口最少，他們被蛇咬傷後，立即用繩子紮住傷口，防止蛇毒擴散；此外，還會剝下“糾節”樹皮，熬水口服，用以治療刀傷和箭毒。
原始人類選擇植物藥的觀念之一，是隻要找到外形類似某種人體髒器的植物，便可將其用於治療與其形似器官的疾病。這種同形思想的治法，在以後的時代仍然常見。比如，傳統中醫認為，藥物外觀形似心者可以入心，狀如腎者能夠歸腎，像肺者宣肺，似腦者補腦，藤絡狀者能疏通人身脈絡等。棗仁可養心，沙苑子補腎，馬兜鈴清肺，核桃仁補腦，絲瓜絡通絡等具體實例，皆屬“同形相求”之類。同樣，在西方還流傳著神的“信號說”這種民間用藥的指導原則。具體內容是說，神靈在世界上設置了疾病和藥物，並且教導我們，任何事物都不會無目的地存在。因此可以假定，神靈對潛在的藥物做了某種標記，暗示著它們的治療功效。比如，一種治療黃疸有效的植物，可能開出黃色的花朵；治療心髒病有效的藥物，可能取自長有心形葉子的植物。