抑餘尤有言者，晚周所遺一切故籍毀滅於呂秦，廢棄於劉漢，今欲考論晚周學術發展之程度與諸子百家之理論或格物之創見，今皆無文籍可稽。《大學》格物，程、朱解為是，謂窮究物理。夫秦火之毒，古今共憤，而漢人廢學之害後世猶不悟也。漢初司馬談《論六家要旨》，其說曰“夫儒者以六藝為法。藝者，知能。古言藝有二解：一者，如格物的知識與一切技術，通名為藝。二者，孔子六經亦名六藝。六經者，《易經》《春秋經》《詩經》《書經》《禮經》《樂經》。司馬談所雲六藝，蓋專指六經。凡經有孔子親作者，有孔子口說，而弟子記之者亦名為經。六藝經傳以千萬數，六藝，專指孔子六經。見前注。傳者，弟子依據經義而推廣之是名傳。司馬談雲“經傳以千萬數”，自是親考目錄，而見經與傳各類之書目有千萬數之多也。累世不能通其學。當年不能究其禮，禮當作理。禮理古通用。故曰博而寡要，勞而少功”雲雲。司馬談此論，見於其子司馬遷《史記》自序，古今稱誦之。其言“六藝經傳以千萬數”本諸目睹，可見晚周故籍非秦火可毀盡。蓋遷自稱司馬氏世典周史，其家藏典冊當不少。漢興，談複掌史職。惠帝、武帝之世除秦挾書律，民間獻書於朝者必多，故談得睹“六藝經傳以千萬數”而歎其博也。但談一人所閱家藏及公府之目錄究有限，其散在民間之書甚眾，而其書目為談所不及窺者豈少也哉！且不獨儒籍廣博而已，晚周諸子百家風起雲揚，異幟分途，各為大國，譬如五星麗天，十日並出，光焰萬丈，其作述宏富，自不待論。由司馬談見六藝經傳千萬數之言而推之，則諸子百家之書，值漢初惠、武二帝除秦挾書律，其出自山岩屋壁，或獻闕廷，或行民間者必不可數計。馬融傳稱武帝除挾書律，皮錫瑞謂惠帝始除此律，馬說誤。餘謂皮說非也。惠帝雖除此律，而其時距秦禍太近，人情不無觀望，武帝複申除挾書律之令自是事所應有，馬融以漢人說漢事。當不誤。然事之極可異者，司馬談所睹六藝經傳千萬數，在武帝時似已缺損脫亡大半，或徒存其目耳。《漢書·藝文誌》雲：“漢興改秦之敗，大收篇籍，廣開獻書之路。迄孝、武世，書缺簡脫，書冊腐敗缺失。偶存者，其簡編亦散脫不完。禮壞樂崩。”此舉禮樂崩壞而言，亦可見先世之學術思想與所發明製作等，皆無可征也。聖上閔焉。據此，則六藝群書千萬數，司馬談所睹者當為太史博士之藏，或內廷秘室諸目錄耳。其書之未壞者亦罕矣。考《藝文誌》，凡六藝，一百三家，三千一百二十三篇，實則六經皆被漢人改竄，而諸傳記又多出漢世老師或博士手。司馬談所睹千萬數之六藝書目，皆是未經漢人竄亂之晚周故籍，乃《藝文誌》所不載也。《藝文誌》所載六藝群書之目，其出於談之後者不必論，若其出於文、景、武諸帝之世，則為談之同時長者或其同輩所造。談既是批判古六家得失，必不涉及其近人或並時人之書也，故知談所睹之六藝諸經傳千萬數，必是未經漢人改竄之故籍，至可寶貴。然可惜者，孔門群籍雖自漢興多獻於朝，而漢朝固任其廢棄莫肯護惜。所以然者，漢武與董仲舒定孔子為一尊，實則其所尊者非真孔學，乃以祿利誘一世之儒生，盡力發揚封建思想與擁護君主統治之邪說，而托於孔子以便號召，故漢儒所弘宜之六藝經傳實非孔門真本。易言之，孔門真本漢廷必廢棄之，方可售其偽也。朝臣與博士之徒既如此，則草野之士揣摩風會，欲其鑽研真孔學必不可得也。晚周一切故籍無不滅絕，職此之由。此非餘之臆說，當於《原學統》《原外王》中略舉其證。向擬作《六經發微》一書辨其真偽，而《量論》及《易傳》未能執筆，卒無暇及此。
由孔門六藝及諸子百家之書，並亡於秦、漢，而呂秦以前之中國文化學術其真相不可得而明。清季迄民國，後生遊海外者，其議國學之根本缺點，略有三：一曰無科學思想。西洋科學源出希臘，而吾晚周儒學以及百家，不見有關於科學知識之載籍。是一缺點。二曰無民主思想。六經及法家言皆擁護君統，道家雖惡專製，獎自由，亦未嚐昌言民主。是二缺點。三曰持論無係統。西洋著述貴乎理論宏密，一本眾幹枝葉扶疏，說理詳明啟人思路。中國古籍或微言而不盡意，或眾義雜集紛然無有體係，難以導人造於精思之境。是三缺點。此等議論吾儕當清季已熟聞，且與之同調，及餘年四十以後始自悔其淺妄。請先言科學。數學為各科基本。伏羲畫八卦在鴻古時代，世代太遠，稱曰鴻古。而漢人言八卦與《九章》相表裏，今之通數學者莫能否認其說。夫《九章算術》造詣已深，而見於鴻古期豈不奇哉？指南針作者，有雲黃帝，有雲周公，或黃帝首創，周公繼述，二說皆不無根。若非明於電磁斷不能有此創製，安得謂黃帝、周公全無格物之術乎？木鳶，則墨翟、公輸並有製作，是亦飛機之始，謂其純出偶然之巧可乎？且《墨經》中有物理學，今人固有發見之者。公輸機械精妙見稱《孟子》，惜其所發明者皆不傳於後，為可惜耳。化學始於煉丹，漢世已有為之者，其源蓋在戰國。張衡東漢初人，著《靈憲算網論》，網絡天地而算之，製候地震儀，可見古代天文學甚精。張衡所憑藉者厚也。李冰戰國時秦人，其水利工程著神績於蜀，迄今二三千年永享其利。抗戰時外人睹之驚歎莫及，則工程學盛於古代可知。醫學與藥物發明並在太古，逮春秋之世扁鵲、倉公精察腑髒經絡，則解剖術已盛行。《周官》有《壺涿氏》秋官之屬。掌除水蟲，可見古代對於微生物之研究必不淺。地圓之論見於《曾子·天員篇》，詳《大戴禮》。《周髀算經》亦言之。五洲之說鄒衍首唱於戰國時。此皆就鴻古以至戰國略征數事，可證中國古代無科學思想之說純是妄自菲薄，毫無事實根據。此皆二字，至此為長句。尤奇者，《尚書·帝典》稱帝堯之言曰“天工，人其代之”。初民皆驚歎上天有創造萬物之神工不可思議，帝堯卻謂吾人當發揮自己力量來代上天而奏改造宇宙之神工，故曰“天工，人其代之”。此等高明聖智，偉大氣魄，不謂為科學思想之導源，何可乎？孔子祖述之，有以也。呂秦、劉漢將故籍毀棄盡淨，後之人遂臆斷古代無科學思想，此為中國文化史上大不幸事。
其次，民主思想，談者謂不見於六經，予當於《原外王》中正其迷謬，此姑不詳。
第三，說者謂古籍無有成係統之理論，今且就晚周儒家六藝群書言。司馬談在漢初所睹千萬數之目錄，而其書西漢已無存，諸子百家故籍一切廢絕更不待論，晚世後生乃輕議古籍無成係統之理論，懸空臆斷，征考無由，非大妄歟？六經雖遭漢人竄亂，而以《大易》較之他經，其保存真相處較多。六十四卦含藏萬有，攝無量義，直如天地之無不覆載，此既不可以散漫無係統議之，更未可以係統一詞讚之也。凡成係統之理論，其含義便盡於其所持之論，更無餘蘊，而六十四卦之妙直是無盡藏，此意難為不知者言，嗚乎深微乎！
司馬談譏儒者“博而寡要，勞而少功”。談於儒學實未之有聞也。談嚐受《易》於楊何。《易》為五經之原，含藏萬有，廣大悉備，廣則無不包，大則無有外。悉備則小大精粗其運無乎不在，此《係辭傳》讚《易》之詞。而歸本窮理盡性以至於命，窮理雲雲，詳在《原學統》中。正是博而有要。談乃茫然莫省何耶？漢世易家同主象數，實皆古術數家枝流。《藝文誌》言：“漢興言《易》者皆本之田何。”可知田何以術數開宗，其於孔子之《易》無預也。談之師楊何，本田何再傳弟子，故談於儒學全無所知。
談於道家確有得。道家反知而遺物，訾文明。儒者六藝以格物備物、化裁變通乎萬物為用，詳《易·係傳》。故談以為竭其知而勞其神，博而無當，道家之觀點則然。
中國文化學術畢竟當求之於呂秦以前。自六國全亡，呂政統一天下之歲起，至二世亡時止，是為呂秦。呂政方為秦王時，猶屬戰國，馬遷《史記》為嬴秦作本紀，殊無義。晚周諸子百家，其書雖亡絕，然殘篇碎義偶存者，亦足珍貴。孔子六經雖遭竄亂，然由《大易》《春秋》《周官》三經，參以《禮記》諸經，謹於抉擇，猶可窺見內聖外王之大體。惟漢以來經生多注重家法及今古文之爭，趙宋以下更有漢、宋之爭，此皆奴儒或迂儒以鑽鼠穴為遼闊，而不睹天地之廣大也。此類爭端，當於以後隨文涉及時略為辨正。