秦王政剛剛親政，就顯示出他臨危不懼、冷酷無情的人格力量。這一震驚朝野的叛亂，被他用血腥的手段果斷地鎮壓下去。從此，秦國不但結束了“與氏乎？與呂氏乎？”的混亂局麵，並且秦王政在國內確立起了凜然不可侵犯的絕對權威。
在彌平內亂後，秦王政緊接著開始對外顯示他的力量。為了教訓暗中支持集團的魏國，他命令大將楊端和率兵猛攻魏國，一舉奪下魏國的衍氏城（今河南省鄭州市北１５公裏），借此機會也給其他國家一個嚴厲的警告。秦王政消滅太後、集團之後，本想乘勢將呂不韋集團除掉。在他看來，太後、集團固然危險，可呂不韋集團對他的威脅更大。他們盤踞在都城鹹陽，把持朝政，頤指氣使，發號施令，堪稱心腹之患。因此，必除之而後始能大安。但他覺得呂不韋畢竟有大功於己，沒有呂不韋能有自己的今天嗎？同時也不能不考慮，現在滿朝文武多是呂氏的支持者，他的門下還有數千門客、上萬奴隸，所以處理呂氏，一定得慎重從事。想到這裏，他決定先將呂不韋的事暫時放一放，集中力量把謀反案搞個水落石出。
在追查謀反案的過程中，很多事情逐漸明朗化了。經多方證實，原是呂不韋的舍人，偽裝成宦者混進宮中，與太後鬼混，乃是呂不韋一手策劃的陰謀。有了確鑿的證據，秦王政決定下手了。秦王政十年（公元前２３７年），也就是集團被鎮壓的第二年，秦王政毅然決然地罷免了呂不韋的相國之職，發出鎮壓呂氏集團的信號。呂不韋被罷免的消息傳出後，天下為之震動，朝野上下，秦國內外，無不對這位２３歲的年青君王刮目相視。誰也沒想到隻是一紙詔書，竟將炙手可熱的權相輕易地從權力的頂峰掀了下去，讓呂不韋跌得粉身碎骨！他的威力從何而來呢？人們在瞠目結舌之後，接著是迷惑不解。而這種社會氣氛對神話秦王政倒十分有利。
在國外，魏國因手伸得太長而受到了教訓，這也為他國做了個榜樣。齊、趙兩國馬上派使節，到秦國置酒祝賀秦王政親政後取得了輝煌的勝利，另外也想借此摸清這位年青君王的品格和秦國今後的動向。但他們沒想到，他們從這位年青的君主那裏，什麼也沒得到。
在國內，太後、集團的殘餘分子得知呂不韋垮台的消息後，這時，他們就像大海中的落難人突然見到遠處有陸地的影子一樣，油然看到了再生的希望。他們誤以為他們的政敵垮台之日，就是他們得救之時。於是他們蠢蠢而動，四處奔走，到處遊說，希望秦王政能夠改變政策，重新啟用氏集團的人。他們把文章做到了太後的身上，試圖利用母子之情打動秦王政，救出太後。太後得救，氏的追隨者也就得救了。
本著這個目的，太後、的餘黨冒死到鹹陽宮，請求秦王政赦免太後，望其母子和好如初。秦王政對太後、勢力的反撲大為震怒，決定給他們以最嚴厲的鎮壓。他頒布命令於宮門之外：“敢以太後事諫者戮而殺之！”但即使這樣，仍然沒能阻止住前來為太後求情的遊說之士。沒多久，在宮門之外的蒺藜叢中，已經堆積了２７具勸諫者的屍體，事態嚴重的程度可想而知了。的一個門客，齊國人茅焦仍不死心，他感到一旦失去這個惟一的機會，他們這些的追隨者將永無翻身之日。所以他置生死於度外，冒險來到鹹陽宮前，要求謁見秦王政。秦王政派使者去問：“難道是為太後的事來勸諫大王的嗎？”茅焦說：“是。”使者把情況報告了秦王政。秦王政命令使者出去警告茅焦：“你沒看見宮門前堆積著死屍嗎？”茅焦說：“我聽說天上有２８個星座，現在死的人已有２７個，我所以前來，不過是要湊齊這２８個數罷了。請你把我的話轉告給秦王政。”使者轉回去把茅焦的話傳給秦王政。秦王政聽罷，頓時怒從心頭起，他聲嘶力竭地大喊道：“這家夥是故意來觸犯我的禁令的，快把大鍋裏的水燒開，煮了他！哪能讓他和其他２７個人為伍呢？”說完，立刻命人把茅焦帶入宮來。
秦王政手按寶劍，口吐白沫，怒不可遏地坐在宮中等待著茅焦的到來。使者連拉帶拽，把茅焦帶到秦王政的麵前。茅焦見到怒發衝冠的秦王政，首先開口說：“我聽說，希望生存下去的人不忌諱談到有關死的事情；希望國家興旺的人不忌諱談到有關國家滅亡的事情。忌諱談死的人，活不了多長；忌諱談亡的人，存在不了多久。死生存亡的道理，聖人也急著想聽，不知大王想不想聽一聽？”
秦王政說：“你想說什麼？”
茅焦說：“陛下行為違背天理，難道陛下自己不知道嗎？”
秦王政說：“怎麼講？我願意聽一聽。”
茅焦回答說：“陛下車裂繼父，說明您嫉妒心太強；棒殺兩個弟弟，您落得個不慈之名；把母後幽禁起來，您有不孝之行；屠殺敢諫之士，您與暴君桀、紂有何區別？今天天下人聽到這些暴行，全都會遠遠地躲開秦國，我怕秦國因此而亡，所以很為陛下擔心。我的話說完了，請隨便處理我吧。”說完解衣就刑。秦王政立刻走下殿來，拉住他，悔悟地說：“我現在赦免你，先生請穿好衣服，從今以後我願意聽你的教誨。”從此他稱茅焦為“仲父”，並以上卿之爵尊之。他又親自帶領龐大的軍隊，趕到雍城陽宮，把母後接到鹹陽，居於甘泉宮，向天下人宣示他們母子重歸於好！秦王政突然改變對太後、集團的態度，聽了茅焦的勸諫是一方麵，除此之外，他還另有打算。他認為集團的勢力基本已被消滅，不會再對他構成什麼威脅了。但呂氏集團卻不同，呂不韋雖被罷相，呂氏的私人勢力卻沒被根除，這個勢力在朝廷內外盤根錯節，比的勢力大得多，要完全清除有很大難度。再說呂氏集團並沒搞叛亂，所以暫時還不能用血腥屠殺的辦法來清理他們。為了騰出手來摘掉呂氏集團，讓氏的殘餘勢力站在自己這邊是十分必要的。
太後被接回鹹陽的第二年，也就是秦王政十一年十月（公元前２３６年），秦王政命令呂不韋離開鹹陽，回到他河南的封地去。聽到這個消息，為了挽救呂不韋，他手下的賓客，各國的使者絡繹不絕地來到鹹陽，為呂不韋多方奔走，喊冤叫屈。秦王政見狀頗為驚恐，深怕釀成禍變，乃下詔書一封給呂不韋，斥責他說：“你有何功於秦？秦封你為十萬戶侯！你和秦國有何關係？你竟號稱‘仲父’！我命令你和你的家屬全都遷到蜀地居住。”
秦王政十二年（公元前２３５年），呂不韋自知秦王政不會放過他，與其被殺不如自殺，於是他飲毒自盡。這個自以為沒有比他更明智的大商人，在秦國的政治舞台上盡興地表演一番之後，終於死於他曾寄予厚望的秦王政之手。
呂不韋死後，他手下的門人、賓客偷偷地將他埋葬。此事被秦王政得知，覺得正中其下懷，這使他可以借機徹底地清除呂氏集團的勢力。他對竊葬呂不韋的人做出如下懲罰：凡是來自三晉地區的外籍人員，一律驅逐出境；凡是秦國人，六百石以下的官員剝奪爵位，降職使用；沒有參予此項活動，但與呂氏有牽連的人，凡五百石以下的官員保留爵位，降職使用。重申從今以後，像、呂不韋這種不忠於國家者，子孫後代，永不錄用，成為定例！
與此同時，他下令赦免流放到蜀地的餘黨。就這樣，秦國的政局在秦王政的手中再次發生了翻雲覆雨般的變化。而在這種他自己製造的變化中，他不僅鞏固了他的地位，而且感受到了擺布他人命運的快感和興奮，其中最大的收獲則是實現了“誰把痛苦和恥辱強加給我，我就把痛苦和恥辱加倍償還給他”的夙願。在他看來，這是人生的最大快事。