進入1945年，日本大本營確定，該年的對華戰爭，主要是加強中國東南沿海地區、長江下遊和上海周圍地區，以及海南島的兵力和戰備，以便在盟軍進攻時，與之決戰。中國派遣軍根據這一任務，於1945年1月底下達轉入新的作戰準備的命令。1945年1月，小林茂三郎中將接任總參謀長。到日本宣布無條件投降時止，中國派遣軍總司令部總司令為岡村寧次大將，總參謀長為小林茂三郎中將。下轄華北方麵軍（轄第一、第十二、第四十三軍，駐蒙軍，方麵軍直轄兵團）、第六方麵軍（轄第十一、第二十、第十三、第六、第二十三軍），以及航空部隊，總計26個師團、1個戰車師團、22個獨立混成旅團、11個獨立步兵旅團、1個騎兵旅團、13個獨立警備隊、1個特別警備隊，總兵力為達120餘萬人。
中國派遣軍總司令部設立時的任務是：統率侵華日軍，協調各軍間的行動；確保華北、華中、華南占領區的治安和長江下遊的交通；切斷重慶國民政府的南方補給線；實施航空作戰，壓製和擾亂重慶國民政府的政治及戰略中心，統轄所有在華的政治謀略機關，加強對重慶國民政府的誘降工作。中國派遣軍總司令部是日本在華的最高軍事指揮機關，對中國人民犯下了滔天罪行。
四聯總處成立
抗日戰爭爆發後，麵對全國金融、經濟恐慌，國民政府財政部於1937年7月31日決定中央銀行、中國銀行、交通銀行、中國農民銀行在上海組成聯合辦事處，由蔣介石兼理事會主席，宋子文為副主席，聯合辦理戰時貼現和放款事宜，以救濟銀行和工商各業。"八一三"事變後，國民政府於1937年8月26日公布《中中交農四行內地聯合貼放辦法》，命令四行組成聯合貼放委員會辦理貼放業務，貼放範圍包括貼現與再貼現、抵押、轉抵押及財政部命令對於鐵路、交通、農貸、工貸等項放款；貼放數額按照中央35％、中國35％、交通20％、中國農民10％的比例攤派；在漢口、長沙、上海、南京等12個大城市設立同樣機構，辦理當地貼放事務。四行聯合辦事處成立之初，沒有具體的組織和實施細則，屬於一個聯係性質的業務機構，一切事務主要由宋子文主持。"八一三"事變後，四行聯合辦事處遷到漢口，由孔祥熙主持。1938年秋，武漢淪陷前夕，隨國民政府其他機構遷往重慶，組織仍相當渙散。
隨著戰爭的發展和統製經濟、壟斷財政金融業務的需要，國民政府決定改組四行聯合辦事處為四行聯合辦事總處，作為戰時財政金融及經濟方麵的最高決策機構。1939年9月8日，國民政府令設中央、中國、交通、農民四銀行聯合辦事總處，同時公布《戰時健全中央金融機構辦法》。該《辦法》規定，四聯總處為一決策性機構，負責指導政府戰時金融的各種業務，統一領導四行業務，將四聯總處置於戰時金融經濟的最高權威地位；賦予四聯總處理事會主席在非常時期內，對中央、中國、交通、中國農民四銀行可為便宜之措施，並代行其職權。隨後，四聯總處進行了改組，10月1日，四聯總處正式宣告成立；10月2日召開第一次理事會，通過《中央中國交通農民四銀行聯合辦事處總處組織大綱》及四聯總處《組織章程》，規定四聯總處的宗旨是：在非常期內，負責監督指導中中交農四行之業務事務；四聯總處的職權為：全國金融網之設計、分布；各行、局人員之訓練、考核與調整；各行、局開支之審核與各項預決算之複核；法幣發行之調度與發行準備之審核；各行、局吸收存款，推行儲蓄之指導、考核；各行、局投資、放款之審核與查考；各行、局農貸之審核與查考；各行、局彙款之審核；協助財政部管理一般金融事項；其他與戰時金融政策有關事項。
四聯總處最高權力機關為理事會，由中央銀行總裁、副總裁，中國銀行、交通銀行董事長、總經理，中國農民銀行理事長、總經理，及財政部、經濟部、交通部有關代表組成；理事會主席由蔣介石擔任，總攬四聯總處事務；常務理事由中央銀行總裁、行政院長兼財政部長孔祥熙、中國銀行董事長宋子文、交通銀行董事長錢永銘3人擔任，襄助辦理四聯總處事務，實際事務由孔祥熙一手操縱。理事會下設秘書處，掌理統計、文書、稽核3科；另設戰時金融和戰時經濟兩委員會，前者設發行、貼放、彙兌、特種儲蓄、農業金融、收兌金銀6處，後者設特種物資、物價、平市3處。1940年又添設全國節約建國儲蓄勸儲委員會和農業金融設計委員會。至此，四聯總處成為淩駕四行之上的金融最高決策機構。