2006年由新疆維吾爾自治區文化廳編寫的《新疆非物質文化遺產代表作》一書中（新疆人民出版社，2006年），從流傳地區、基本內容、史詩的主題、藝術特色、基本特征、主要價值、保護內容等七個方麵對《瑪納斯》進行了全麵評價和介紹。書中對《瑪納斯》史詩的基本特征進行介紹時說：“1、典型的史詩特征：《瑪納斯》以詩的語言敘述了柯爾克孜的傳說史，滄海桑田，大氣磅礴，具有典型的史詩特征。2、百科全書的特征：在史詩《瑪納斯》豐富的內容中包含了柯爾克孜古代社會政治、經濟、文化、民俗等各方麵的信息，因而被學術界公認為是柯爾克孜族曆史的百科全書。3、活態傳承的特征：《瑪納斯》在千年傳承中，沒有文字記載，依靠口耳相傳至今仍是活形態地流傳，且像滾雪球一樣越滾越大，不斷加入不同曆史時期的內容和民族意識。4、全民族傳承的特征：《瑪納斯》並非是一個地區或一個部落中流傳的，而是柯爾克孜族全民族的史詩，全民族都在傳承這一史詩，並以全民族的智慧不斷完善著這部史詩。5、人民性特征：瑪納斯汗王在人民保護下出生和成長，為人民利益而死，是人民的一員，深受人民的愛戴，是人民心目中的英雄。至今，柯爾克孜全民族還自稱為瑪納斯的後代，以為榮耀。6、團結愛國的特征：史詩《瑪納斯》中始終強調民族的團結、部落的團結、人民的團結和愛國的主題，揭示了團結的重要、團結的力量。7、多樣性特征：《瑪納斯》內容十分豐富，變體很多，目前搜集出的已有80多種變體，且各有特點，充分體現了變體的多樣性、內容的多樣性和演唱音調、技巧、形式的多樣性。8、敘事結構譜係性、完整性特征：《瑪納斯》敘述了瑪納斯及其七代子孫的傳奇英雄故事，在人物情節、敘事結構上緊密相連，形成具有完整結構的史詩，不僅是正反兩方麵的人物，就連他們的坐騎以及馴養驅使的飛禽走獸，也都是以譜係方式世代傳承。9、即興性演唱的特征：《瑪納斯》的演唱是將富於創作性的背誦與即興創作結合在一體的，每一個演唱者都會在敘事框架內、在多次演唱中，由於智慧、靈感的迸發而即興創作，是作品不斷完善和升華，這就是變體極多的原因。10、悲劇美和崇高美的美學特征：悲劇美和崇高美這兩大文學藝術創作的美學特征不僅貫穿史詩《瑪納斯》的始終，而且是緊緊結合在一起的，主人公瑪納斯及其後代以生命的代價，為之奮鬥的是民族部落團結、戰鬥求生存、求發展的崇高事業，但大都以不幸的悲劇而終結，這種悲劇美的特征在東方史詩中是較為罕見的。”該書還從《瑪納斯》史詩的曆史文化和科學價值，社會價值，服務現實的實用價值，科學研究價值、藝術價值等方麵係統地評價了這部史詩的總體價值。
此外，申報書中對我國政府如何對《瑪納斯》實施保護提出許多具體的措施和方案。申遺的目的是為了更好地保護，我國申報《瑪納斯》史詩為人類非物質文化遺產代表作成功之後，已經開始履行向聯合國教科文組織發出的莊嚴承諾，逐步實施和落實各項保護措施。從2009年到2013年，要從在《瑪納斯》流傳最為集中的地區社區建立文化生態保護區和保護機構；在相關社區加大資助鼓勵“瑪納斯奇”的史詩演唱活動的頻率和培養更多年輕史詩歌手；支持和鼓勵民眾定期舉辦《瑪納斯》演唱活動，在更大範圍內提高民眾的認知度；選編《瑪納斯》代表性內容，編印教材，把《瑪納斯》史詩納入本民族中小學語文課本和藝術課程；建立《瑪納斯》數據庫，開設專門網站，利用現代傳媒手段提升《瑪納斯》的可見度和認知度；用四年時間將20世紀80年代以來的所有《瑪納斯》演唱音像資料轉錄為數字化音像，長期保存和利用，以柯爾克孜文陸續出版《瑪納斯》的不同異文，啟動英文翻譯出版工作，編輯《瑪納斯詞典》；召開《瑪納斯》國際學術研討會，推動相關學術研究等7個全方位實施對《瑪納斯》史詩的保護。申已成功，標誌著《瑪納斯》的保護與傳承進入了一個新的曆史時期。以口傳形式流傳千年的《瑪納斯》史詩，在我國各級政府部門大力推動下，必將以多種形式走向另一個千年。