麵對丁樹本破壞統戰，倒行逆施的行徑，王從吾領導中共直南、豫北地委與丁樹本進行了鬥爭。丁樹本下令成立“抗日動員委員會”，與共產黨組織領導的冀魯豫抗日救國總會相對抗。王從吾派唐克威代表地方黨組織向丁樹本說明邊區已有各級救國會，成立動員委員會沒有必要，隻能引起混亂，不利於團結抗戰。
直南特委對丁樹本爭取無效。1940年2月，八路軍冀中、冀南部隊在宋任窮、程子華指揮下，對勾結日軍的頑軍石友三部進行討伐，石友三部在日軍接應下逃竄到清豐、濮陽縣一帶丁樹本轄區。丁樹本不以民族利益為重，以糧秣、船隻支持石友三部。唐克威對此向丁樹本提出抗議，但丁樹本最終堅持了反動、反人民的立場，在石友三部受擊逃離濮陽時，也率部隨石逃跑。後來發展到勾結日軍，破壞抗戰，成為民族的罪人。
4.做會道門工作
王從吾領導中共直南特委工作期間，接觸到很多應運而生的各種迷信會道門組織。他領導幹部群眾，對各種會道門組織進行了調查研究，做了大量的爭取分化瓦解工作。
1937年到1938年，日本侵略軍占領直南、豫北城市後，廣大鄉村成為無政府狀態，土匪蜂起，人民群眾身受其害。廣大群眾迫於自衛，便在地方豪紳、地痞流氓串連下，參加了各種各樣的會門團體。當時，直南各縣尚未建立抗日民主政權。直南特委對會門采取努力爭取、必要的打擊和分化瓦解工作。1940年1月30日，王從吾在中共中央北方局黨刊《黨的生活》上發表《如何進行會門工作》一文。這篇文章對他在直南特委工作期間，黨進行會門工作的經驗教訓作了總結。
文章首先敘述了直南豫北會門的性質和特點。他說：日寇漢奸為達到他們欺騙麻醉民眾，破壞抗戰之目的；頑固分子及部分豪紳地主為保衛自己的生命財產，實現爭權奪利，投降分裂倒退之企圖；地痞流氓為著欺弄鄉愚，從中取利，他們不約而同地都采取公開與秘密方式，組織了各色各樣的迷信團體——會門。這些迷信團體在直南豫北不但組織發展很迅速，而且非常普遍，幾乎每個縣、每個村都有會門組織。公開活動的會門，都有武裝。滑縣大公團，共有數千支鋼槍。直南豫北民性強悍好鬥，更加迷信神咒，“不過槍炮”，動輒鳴號，聚眾亂衝亂打。許多會門，受日寇漢奸頑固分子操縱、利用；有的則抗日防匪。在敵占區，敵人公開收買會門首領，欺騙會門群眾，武裝驅逐我政府和軍隊；在我們占領區，敵派大批漢奸秘密潛入會門內部，散布反動會論，挑撥政府軍隊與民眾關係；頑固分子則利用會門反對八路軍和群眾團體。在我部隊經常活動，抗日工作有基礎的地方，好多會門被爭取到抗日陣線中來，或被瓦解消散。
在直南豫北活動的會門，主要的有三十餘種，可分為四類：公開投敵被漢奸秘密操縱的有黃槍會、大公團、聖道會等；防匪自衛，被頑固分子利用的有聯莊會、大仙會、紅槍會、黃香會、白槍會等，口號是“保家防匪”；欺騙鄉愚，造謠撞騙，詐財自肥的有九宮道、八卦、道德會、理門等；進步的反抗敵偽的會門有大公團的一部分參加救國會，滑縣聯莊會變成抗日自衛隊，長垣紅槍會改為自衛隊，積極進行抗日工作。