3性染色體或常染色體異常
凡是基因型為男性，而X染色體增多者往往伴有小陰莖。
4原發性小陰莖
排除各種病因，下丘腦、垂體、睾丸也都正常，家族中一些成員常常出現這種情況，等經曆青春期後，陰莖可以發育到正常狀態。
簡單地說，青春期啟動後，雄性激素大量分泌，陰莖上的雄性激素受體增加，對雄性激素的敏感性增加，從而促進陰莖、睾丸進一步發育。因此，在青春期任何造成雄性激素合成和分泌障礙因素，都可影響陰莖的發育，形成陰莖短小。
（三）小陰莖的治療
小陰莖的治療通常包括內分泌激素和手術兩種選擇，關鍵之處還是根據不同疾病類型製定最合適的方案。
1內分泌激素療法
促性腺激素不足者可選擇絨毛膜促性腺激素治療；下丘腦促性腺激素釋放激素分泌不足者，可選用促黃體激素釋放激素；睾酮分泌不足者可肌注庚酸睾酮。
2手術療法
包埋隱匿型小陰莖可采用手術矯治；經激素治療無效的小陰莖可考慮做陰莖再造成形術，也可以根據本人意願做變性手術。
小陰莖病人除少數單純性者外，絕大多數至青春期都沒有正常的性發育，可在12歲左右開始較大劑量的性激素治療，幫助第二性征的發育。
一些成年男性常因為一些廣告誤導或是缺乏自信，自我判斷是小陰莖，這種觀點是不對的。判定陰莖大小，不能隻用肉眼觀察，需要測量確定，所以要到男性病專科進行檢查測量。其方法是在室溫18℃條件下，讓患者呈直立姿勢，用一把直尺，前端頂在陰莖上方的恥骨聯合，把陰莖提起與身體呈90°，測恥骨聯合處到陰莖頭部的長度。一般這樣測量的長度達到65厘米以上，勃起時達到9厘米以上，都是正常的，不必為此憂心，也不要抱著追求完美的想法，達到所謂“更高、更快、更強”。其實，這樣的基本標準也完全可以滿足性生活和生育的需要。
第二節性發育的時間誤差
一、8歲男孩的性早熟
曉楠的兒子8歲多，細心的曉楠卻發現兒子的外陰出現了陰毛，睾丸也變大了，聲音變得啞啞的。去醫院檢查，醫生給兒子測骨齡，發現骨齡有12歲了。兒子自己也有些煩惱，私自剪了陰毛，曉楠為此很煩惱。
男性未到性成熟年齡而出現性成熟的表現，稱之為性早熟。通常，女孩是在8歲以前，男孩子是在9歲或9歲半以前。男性性成熟的標誌是男性生殖器發育為成人型和男性第二性征的出現，如睾丸陰囊增大，陰莖增長變粗，出現陰毛、胡須、腋毛，聲音變粗且低沉，喉結變大，身材長高，甚至出現陰莖勃起、排精現象等。
性早熟的原因有很多，大概可以分為下麵3類。
●腦型真性性早熟。如顱底骨折、嚴重產傷、下丘腦小腫瘤、結核性腦膜炎治愈後、麻疹腦炎後遺症等因素所致。
●體質型性早熟。病孩多有家族史，由於下丘腦—垂體—性腺軸提前活動所致，又稱原因不明性性早熟。
●假性性早熟。如腎上腺皮質增大、腎上腺皮質腫瘤、性腺功能性腫瘤、絨癌及胚胎組織腫瘤，由於病變及腫瘤本身能分泌性腺激素或促性腺激素，使性器官發育而出現性早熟；又如小孩誤服母親的避孕藥，也可以產生外源性早熟。
性早熟的危害有幾方麵。一是，男孩因為與眾不同，從而產生自卑心和羞恥心，引起性格內向和自閉；二是，因為早熟，身體發育過快，骨骺閉合早，最終反而導致身材變矮。
與男孩子相關的檢查主要有骨齡、性腺激素、CT或MRI、尿液精子等。骨齡超過生活年齡1歲以上視為提前，這是判斷性早熟最簡易可信的指標；性腺激素測定包括促性腺激素、黃體生成素、雌二醇、催乳素、睾酮和絨毛膜促性腺激素；CT或MRI主要是排除腦部的器質性病變；尿液精子檢查主要是檢查晨尿中是否有精子，如果顯示陽性，說明睾丸已有生精功能。
治療方麵，應該首先查明原因，再確定治療方案，而不要濫用藥物。部分體質性的性早熟不需要治療就能自行緩解，但要充分追蹤觀察與真性性早熟區別。甲狀腺功能低下伴有性早熟需要用甲狀腺素治療；單純男性化型先天性腎上腺皮質增生症可用氫化可鬆治療；顱內腫瘤、性腺腫瘤需要手術、放療及化療治療原發病，可以使症狀緩解；特發性中樞性性早熟，也就是找不到明確原因的中樞性性早熟，可采取國際通行的ICPP療法，治療目標主要是改善最終身高，控製和減緩第二性征成熟度和速度，恢複其實際生活年齡應有的心理行為。這樣的治療都比較專業，需要在專科醫生指導下進行。
此外，7～8歲的男孩在淩晨出現陰莖勃起，但沒有陰莖、陰毛、睾丸的提前發育，這是正常現象，不是性早熟。男孩子在七八歲時，有20%的男孩在淩晨時小陰莖會勃起，因為人體內腎上腺糖皮質激素成脈衝樣釋放，淩晨時達到高峰，這種激素結構類似於雄激素，會引起陰莖呈勃起狀態。
二、4歲男孩的“性騷擾”
4歲半的男孩小熊，身高卻有123厘米，手臂粗得像成人，晃眼一看，像個小夥子。孩子媽媽吳芳說起孩子的病史，就不停地抹淚。小熊在2歲時，他就開始長陰毛，4歲時外生殖器就和成年人一樣，力氣很大，能提起40多斤重的東西。有時見到女娃娃，他要去“逗”。“小小年紀，怎麼就會騷擾女的？”“他力氣這麼大，是不是大力神投胎！”村民都對她的孩子議論紛紛，罵他是“怪物”。這些年來，為了不讓孩子惹事，他們不敢將他送到幼兒園，也不敢讓他單獨出門，隻能將他帶在身邊。經醫學專家會診，他被查出患上了下丘腦錯構瘤，病根在他小腦袋的中央。
一些找不到原因的特發性性早熟患者，在死後經屍體解剖發現下丘腦有微小錯構瘤。下丘腦是人的大腦中一塊不大的組織，但不可小看它的作用，它是人體內分泌係統的最高中樞，生產各種激素的指令就是在這裏擬訂並通過垂體柄及其門脈血管直接下達給腦垂體的。腦垂體再分泌促性腺激素給睾丸，指揮它製造和分泌雄激素、雌激素。這就是通常所說的下丘腦、垂體、性腺軸係統，這個係統對男人和女人起著類似的作用。
錯構瘤實際上不算是真正的腫瘤，而是腦組織在胚胎發育時期的異常。下丘腦錯構瘤能模仿下丘腦的神經元構成，還能合成類似促性腺激素釋放因子的功能。促性腺激素再促進男性的睾丸過量分泌性激素，導致男孩的睾丸、附睾、輸精管、陰莖等性器官生長發育，同時出現長高、肌肉發達、喉結突出、嗓音渾厚，生出胡須、陰毛等第二性征。
因為孩子比較小，腫瘤又在顱內，手術一般要在技術力量雄厚的大醫院才能做，切除腫瘤是一方麵，關鍵是要能避免傷害正常腦組織。因此，一般都選擇顱腦顯微外科手術或是伽瑪刀來去除腫瘤。
三、16歲男孩戴文胸
王蒙蒙16歲，正在讀高中一年級，身高將近170米，體重150多斤，算是個小胖子。從王蒙蒙上初一的時候開始，胸部就比一般男生豐滿，有點“肉肉的”，爸爸媽媽看到總認為是兒子身上肉多，所以胸部有點肉也沒有什麼不正常。王蒙蒙因為父母如此說也就沒有在意。等王蒙蒙讀到高一時，他的胸部卻已非常“雄偉”，甚至因為乳房大而有點下垂，不得已就用C罩杯的文胸來固定胸部。這種在女性身上很可能是值得驕傲的豐乳，卻讓這個男孩子不敢抬頭挺胸走路。
在某次洗澡的時候，他的家人突然發現他的生殖器太過短小，埋在兩條大腿的贅肉中都很難找到，這才慌忙去看醫生。在排除了兩性畸形和其他疾病引起的可能之後，醫生確認，王蒙蒙的這些異常體征是因為性早熟引起的，隻不過他沒有向男性方向發展，而是轉向了女性。
男孩的性早熟根據發展方向不同而分為同性性早熟和異性性早熟。同性性早熟就是男孩的性器官和第二性征發育是和成年男性統一的，異性性早熟是指男孩子提前出現了女孩的第二性征。王蒙蒙出現的情況就屬於異性性早熟。引起異性性早熟的原因主要包括女性化腎上腺皮質瘤、環狀小管性索瘤和外源性雌激素攝入。前兩者都屬於器質性病變，需要接受手術或放療、化療治療；後者多是與現代孩子們的日常飲食有關，當孩子們攝入含有雌激素的食物，喝下過多添加劑的飲料，就會使體內雌激素增加。同時，孩子們攝入高脂高熱的食物很多，引起肥胖，也會引起雌激素在血液的含量增加，結果就會導致男孩子也會出現女性特征的發育。所以，男孩異性性早熟的預防應該從飲食入手，培養孩子良好的飲食習慣。
四、沉睡的青春期
齊文生今年17歲，長得很高，隻是至今四肢纖細、聲音依然保持著尖細的童子音。他的父親經曆過青春期的巨變，感覺兒子有些不對勁，就帶著齊文生去看醫生。醫生問他幼時是否得過腮腺炎，他的父親想起齊文生的確在6歲時得過，但1周就好了。醫生說齊文生的青春發育延遲可能與此有關。齊文生的父母很擔心。