第二步是政治清鄉，他們建立了一套保甲製度，挨門挨戶核查所有人員，身份確實後頒發良民證。為了在清鄉中相互配合保持一致，日偽雙方還簽訂了《清鄉協定》，企圖以此作為清查抗日人士、打擊抗日力量的手段。
第三步是經濟清鄉，汪精衛美其名曰“改善經濟”，實際上就是依靠軍事力量，鎮壓抗日力量，大肆搜刮民間財物，以致淪陷區的老百姓把清鄉叫作“清（老百姓）箱子”。
1943年1月9日，偽國民政府發表《宣戰布告》，對英美宣戰。汪精衛在各種集會上賣力地發表演講，對所謂的“大東亞共榮圈”大肆吹捧，同時認為把歐美等西方殖民勢力驅趕出境，中國就實現“獨立自主”了：“我們知道中國在一百年以來，經過多次戰爭，內戰不用講了，外戰呢，總是枝枝節節的，唯有這一回的戰爭才正是為‘獨立自主’而戰的戰爭。”
同年11月，日本在東京召開大東亞會議，汪偽政權、偽滿洲國、泰國、菲律賓和緬甸等幾個由日本扶植起來的傀儡政權派代表參加會議，汪精衛在會上宣誓願與日本共進退。與會的各傀儡政權代表在日本的主導下，簽署《大東亞共同宣言》，宣稱各政權間實行文化交流，進而開放資源，建設所謂共存共榮的“東亞新秩序”。
東京大東亞會議結束後，汪精衛離開日本回到南京。此時國際形勢發生了翻天覆地的變化，意大利墨索裏尼的法西斯政權已經投降，納粹德國在歐洲戰場上陷入孤軍作戰的境地。汪精衛喪失了之前的鬥誌，再次陷入對自己前途的憂慮之中。
1943年11月下旬，蔣介石與羅斯福、丘吉爾共同舉行開羅會議。汪精衛得知這個消息後，心情更加糟糕。
1944年3月，汪精衛舊傷發作，前往日本名古屋帝國大學醫學院進行治療，11月10日，病發不治，死於異國他鄉。汪精衛的遺體後來由日本運回國內，按其遺願葬在南京中山陵西南的梅花山。
1945年8月15日，日本政府宣布無條件投降。次日，偽國民政府宣告解散。
全國人民對汪精衛的墳墓留在南京梅花山極為憤慨，紛紛要求予以鏟除。在全國的一片呼聲中，國民政府隻得派工兵炸毀汪精衛的墳墓。一聲巨響後，汪的遺體隨硝煙崩散。
1946年4月1日，在南京朝天宮，高等法院正式成立，舉世矚目的中國漢奸大審判拉開了序幕。
這次審判的頭號漢奸是“立法院院長”陳公博，對於這個汪偽政權的第二號人物，法官認為應該“從重處斷，以為叛國者戒”，並在判決書中指出：“陳公博通敵謀國，圖謀反抗本國，處死刑。”6月4日，陳公博被執行死刑。
汪偽“外交部部長”褚民誼同樣因為積極勾結日本、出賣國家利益，被南京高等法院以漢奸罪判處死刑，後執行槍決。
汪偽“實業部部長”、“最高委員會”成員梅思平，經常公開嘲諷抗日是唱高調，被視為汪偽的八個“首義分子”之一。1946年5月，高等法院判決：“梅思平通謀敵國，圖謀反抗本國，處死刑。”9月14日，梅思平在南京被執行槍決。
汪偽“財政部部長”周佛海因主持偽政權期間向國民政府投降，並且維持政權過渡期間的社會治安，受到蔣介石的特別庇護，被判處無期徒刑，但是沒過多久，他就病死在獄中。後來台灣公布的三卷本《戴笠與抗戰》顯示，他在1943年被戴笠說服，成為國民政府在汪偽政權的臥底。
1948年1月5日，長達兩年多的漢奸大審判宣告終結，賣國求榮的漢奸們得到應有的下場。國民政府司法行政部對外宣布：各省共審判辦結漢奸案25 155件，14 932名漢奸被判刑，其中死刑369人，無期徒刑979人，有期徒刑13 570人，處以罰金14人。