概言
第二卷，乃發明第一卷未盡之意。其言理也，足乎其前所未盡言之理、其言象也，足乎其前所未盡言之象。然非理自理、象自象也。象，即理也。言象，正所以申明其理之所不可見者耳。有心者，若能於當體求之，則理象皆得；不能於當體求之，則理象之友人也遠矣，雖日披閱此圖、此文，不過涉獵焉已耳！於性命奚裨？
先天性品圖說
先天性品，其說已發明於性理始分圖矣。至此又列圖而詳其說者，研理之文愈詳，而理愈著也。先天之性，凡十有四品，至聖之性，即真宰之自為首顯者也。其名雖日至聖之性，而其實即真宰之知能德性也。自至聖之性之下。其依次而分著其品第者，皆從此一性之餘光。而得各有其性也。此一品之下，以聖性稱者三。以大賢稱者一，以知稱者一，以廉介稱者一，善人庸常之性，則又依次而遞下者也。鳥、獸、草。木、金、礦、石類之性，又其下而愈下者矣。溟渣之為物也，一切性命之所餘，相合變化而成者也。自至聖之性，以至於溟渣；凡十有四品。至聖之性，與真宰之本然無同無異。其餘性品，亦與真宰之本然，不甚相遠、而甚至頑鈍迥不相侔者，則其品第之界限為之也。諸品之性，發露於形色之後，數窮理極，萬有歸根，仍必盡返而人於至聖之性，乃得以因至聖之性，而歸於真宰之本然。至聖之性，所以為萬性之始終也欽！
清源黑氏回：“大數盡於九，小數盡於五，合大小數而十四品盡之。先天之理，後天之象，皆無過不及之數。然先天之化，盡於溟渣；後天之化，盡於三子。而人又生於三子之後，則人之身為阜中至卑也。卑至於極，則盡終返始，與真合焉，所謂妙合而凝也。”
性品知能圖說
先天性，凡十四品。其所以彼此分別而各有不同者，別之以其性中之知能耳。此一聖之知能，不同於彼一聖之知能，而其品第判然分矣。愚不肖之知能，不同於賢知之知能，物之知能，不同於人之知能，而其品第相去倍蓰無算矣。至聖，為渾同知能。渾同者，謂其知能，與真宰知能渾同一體，無欠無餘也。大聖，為任用知能。任用者，謂其知能不及於渾同，而真宰知能卻任其所用，如綱維天地者，真字之知能也，而大聖亦能起死回生，轉移天地等等，任其所用也。欽聖，為順應知能。順應，則不能任用，而但順應乎真率之運用也。列聖，為顯揚知能。顯揚者，謂其凡有得於真宰知能之發露，而盡以宣化於人類也。大賢，為希望知能；知者，為體認知能希望者，謂其不能聖而欲求至於聖；體認者，謂其求明一本，而體認之也。廉介，為堅守知能。善人，循習知能。庸常；為自用知能。知能而至於自用，則幾幾乎其近於物矣。物雖具有知能，而不可以知能稱，禽獸曰知覺，草木日發生，金石曰堅定，同一知能也，而物類得之於最後，故其品愈下，而逐覺其漸遠於真宰也。若混其分別之跡，去其先後之形，而複返之於一原焉，物與人，未見其甚相遠也。
清源黑氏日；“知能，即各物之本領，受賦於造
物者也。造物授之全、人物得之偏，非偏也，用各有宜耳。用之得宜，則偏者全；用之失宜，則全者偏。顧其人之用之何如耳！各正性命，保合太和，此之謂也。”
後天形器圖說
後天形器，凡十四層。其數與先天性品之數相對。上界之層第九，即九天之位也；下界之層第五，即四氣與四氣所生之三子也。“阿爾實”為至清無上之天，諸天之懸位於其中也，猶珠之懸於水晶室也。此第一天之體，一麵有形向下，一麵無形向上。無形而向上者，以其尚屬於先天也。有形而向下者，以其始人於後天也。此際位分。天分先後，而兩界卻無隔絕。其第二層日“庫而西”，為二十八宿及群星所麗之天，雖有形，而其形實無容思議者也。當其無火冒人天體而成象也，其力僅能至此而止，過此以上，則至清而無可而矣。下此七天，則每一層僅有一星麗之。其三層則土星麗焉，四層則木星麗焉，五層則火星而焉，六層則太陽麗焉，七層則金星而焉，八層則水星麗焉，九層則太陰麗焉。天有九，而於其最上者稱為一層，於其最下者稱為九層，蓋自上麵數及於下也，是為順其次第而數之也。苦於其最下者稱為一天，最上者稱為九天，則為逆其次第而數之矣。其每一天安置一星者，蓋每一天有一天之功用，各置一星以作本天功用之機權也。九天之下，其次於天者，風。次於鳳者，火。次於火者，水。次於水者，土。土返而向水，遂與水相凝合，而金生焉。金能吸火下降，火降則氣隨人於土，而木生焉。木能生，而金能鳴，二者相湊，又以適合於四氣之感，而飛楊生活之氣生焉。木、金、活三者，風。火、水，、土四氣所生之三子也。合三子而僅為十四層之一層。
清源黑氏曰：“經曰：‘唯“阿爾實”代行化育。’“阿爾實”理，即先天性智之智也，歸之於物，則名曰理。其為形也，上無下有。其為器也，上虛下凝，蓋先天後天，承流宣化，而後天之卵殼也，至“庫而西”，則殼內白翳矣。三子生生之次第，於此尤詳。”
形器功用圖說
形氣十四層，每一層有一層之功用。萬物之紛錯，人事之不同，莫非此十四層功用，有以照映而關合之也。“阿爾實’，為代行造物之功用。以其居形器之最首，而得夫真宰化育之全能也。一麵向理世，一麵向象世。凡理世一物欲來於象世，必由此境而來，乃能成其為象世之人物也。其下諸天之功用，亦莫不由此天而得，故其功用為諸天功用之總持也。“庫而西”，為錯合變化之功用。諸天功用皆各有一定，不能彼此相代，而此天獨能代行別天之功用，上代“阿爾實”以總諸天之動，下代諸天以行其本天之用。所以然者，因諸天各載一星，而其功用亦隻各歸於一事。此天之星無可數計，二十八宿及一切群星，莫不麗於其上，故其功用亦無可數計。土星天，則創無為有者也。人物賦形成質，自無趨有，皆此天之功用也。木星天，則發隱成顯者也。物之所以生長發達，人之所以才敏茂著，以及一切祥征瑞應，，皆此天之功用也。火星天，則化小為大者也。人物自小而大，由此蔭彼，以及一切苦毒災異，皆此天之功用也。太陽天；則彰明貴顯者也。其功用特不及於“阿爾實”、“庫而西”兩天，然較上下六天為最盛焉。上下六天，莫不借此天功用之力，而乃能自行其本天之功用。所以然者，以其位居七政之最中，而實為七政之主宰也。上下六天，特其輔佐耳。故凡人禽之生活、草木之長發，金石之變化，花實之蕃碩，人物之貴顯，年力之康壽，皆此天功用為之，即雲雨雷電。霧露霜雪、寒暑濕燥。四時往複、萬物消長、一切變化施為，皆莫不成於此天之功用也。金星天，為結交離合之功用。人物交接契合、相感相配、以及一切音聲色貌、香臭氣味，皆莫非此天之功用為之。水星天，則化蠢而為靈者也。人物有蠢而漸化於靈者。有暗而漸化於明者。除垢卻汙，以及一切浸潤透亮之故，皆莫非此天之功用為之。太陰天，則善於改移，而流動者也。凡一切乍增乍減、倏成倏敗。以及潮汐之消長、事物之變亂，皆莫非此天之功用為之。風之功用為能舒鬱，以助生活。火之功用為能薰蒸，以助溫暖。水之功用為能滋潤，以益生味。土之功用為能負載，以奠安處。金則善於定困者也，木則善於建立者也，活則善於運行者也。上界下界之功用全，而形器之能事畢矣。功用者，真宰妙用之跡也。妙用者，全體之活潑流行而不膠於一定者也。因形器以識形器之功用，複因十四層之功用，以悟真宰之全體大用，則謂形器為形器可也，即謂形器為非形器可也。