遷都長安時，為了防止官員和人民逃回故都洛陽，董卓將整個洛陽城以及附近二百裏內的宮殿、宗廟、府庫等大批建築物全部放火燒毀。昔日興盛繁華的洛陽城，瞬息之間變成一片廢墟，淒涼慘景令人頓足痛惜。為了攫取財富，董卓還派呂布洗劫皇家陵墓和公卿墳塚，盡收珍寶。整個洛陽城狼藉不堪，在董卓肆意踐踏破壞下，已是千瘡百孔，滿目瘡痍。
董卓掌權後，國家製度朝令夕改，反複無常，嚴重阻礙了整個國家政權機器的正常運轉。其中，他頒布的法律刑罰尤為混亂無度，不成體統。對普通老百姓往往實施嚴刑酷法，而對親信家族，則違法不究，一切都取決於董卓個人的意誌。《魏書》記載：董卓專門指派司隸校尉劉器登記所謂“為子不孝，為臣不忠，為吏不清，為弟不順”的臣民，凡是冊上有名者，都被處死，財產沒收。不久，整個社會便民怨沸騰，冤獄遍地。
為了聚斂巨額財富，董卓大量毀壞通行的五銖錢，還下令將所有的銅人、銅鍾和銅馬打碎，重新鑄成小錢。粗製濫造的小錢不僅重量比五銖錢輕，而且沒有紋章，錢的邊緣也沒有輪廓，不耐磨損。小錢的流通直接導致了嚴重的通貨膨脹：貨幣貶值，物價猛漲。據史書記載，當時買一石穀大概要花數萬錢。老百姓苦不堪言，生活陷於極度痛苦之中。董卓卻利用搜刮來的錢財，整日歌舞升平，尋歡作樂，荒淫無度。
（三）董卓之死
善有善報，惡有惡報。董卓的倒行逆施終於激起了廣大人民的憤怒與反抗。許多有誌之士出於對國家危亡的考慮，與董卓進行了不屈的鬥爭，在很大程度上打擊和動搖了董卓的地位和統治基礎，同時也緩解了董卓對整個東漢政權的破壞性影響。起初，議郎楊勳與左將軍皇甫嵩秘密商議，準備共同討伐董卓，隻是後來由於皇甫嵩被征調，楊勳勢單力薄，才就此罷休。初平元年(190年)，冀州刺史韓馥、兗州刺史劉岱、豫州刺史孔伷、南陽太守張谘和袁紹等十餘人都紛紛起兵反對董卓，從此掀起了大規模持續反抗董卓的鬥爭浪潮。不久，長沙太守孫堅率領豫州各郡軍隊征討董卓，在梁地(今汝州梁縣西南)被董卓部將徐榮打敗，聯合孫堅反董卓的潁州太守李曼也被生擒。
接著，河內太守王匡又屯兵河陽津(今河南省孟縣西部的黃河渡口)，準備進攻董卓。不料老謀深算的董卓早有覺察，先派疑兵向王匡挑戰，而暗中卻派精銳部隊從小平津渡河北上，繞道偷襲王匡所部。王匡大敗，幾乎全軍覆沒。第二年，孫堅重新收攏流散部屬，進駐梁縣，準備再度討伐董卓。董卓派胡軫、呂布迎擊孫堅。由於胡、呂二人心存芥蒂，不能和睦相處，還沒交戰，士兵就四散逃離。孫堅趁機出擊，胡軫、呂布大敗而逃。董卓見勢不妙，不得不派部將李傕向孫堅求和。孫堅不理，繼續進攻距洛陽隻有90裏的大穀關。董卓被迫率軍出戰，被孫堅擊敗，退駐澠池。孫堅乘勝追擊，遇呂布，大敗呂布後，出兵函穀關，分兵兩路，直取新安和澠池。
此時，山東諸路豪傑也紛紛揭竿而起，共同起兵聲討董卓。被多股義軍逼得無路可走的董卓決定遷都長安，以避鋒芒。但是，征討董卓的鬥爭並沒因此而有絲毫鬆懈，反而更加風起雲湧。這時，董卓已成為眾矢之的。
在天下之人聲討董卓的同時，朝中許多官員更是對董卓深惡痛絕，欲殺之而後快。越騎校尉伍孚對董卓的倒行逆施十分痛恨，發誓要親手殺死董卓。一天，伍孚身藏佩刀，前來拜見董卓。交談完畢後，伍孚便告辭離去。董卓起身出門相送，用手輕輕拍著伍孚的後背，表現出極其親切的樣子。伍孚瞅準機會，猛地抽出佩刀向董卓刺去。由於殺人心切，用力過猛，並沒刺中要害。董卓大驚，慌忙奮力反擊，並急呼警衛出手相救，這才脫離危險。伍孚與警衛展開搏鬥，由於寡不敵眾，被亂劍刺死。
當時，天下老百姓為了表達對董卓的痛恨，到處傳唱《千裏草》的歌謠，希望他盡快死去。
初平三年四月，司徒王允、尚書仆射士孫瑞與董卓的親信呂布共同密謀誅殺董卓。之前，王允先後與司隸校尉黃琬、尚書鄭公業等人多次商議誅殺董卓的事情。初平三年春天，陰雨連綿長達兩個多月，王允與士孫瑞、楊瓚借登台拜神為名，又一次秘密商量除掉董卓的事宜。士孫瑞說：“自從去年年底以來，太陽不照，陰雨不斷已達六十多天，我們應該讓這種不利國家和老百姓的時期盡快結束。現在，時機大好，我們正可趁天下沸騰之際，主動采取措施，消滅罪魁禍首!”士孫瑞意在提醒王允可借天時地利人和之機除掉董卓。王允同意士孫瑞的意見，可是，考慮到董卓平時戒備森嚴，而且他本人勇武過人，如果不采取周密措施，恐怕不易得手。於是，王允便物色了董卓的親信呂布作為內應。
呂布年輕勇猛，武藝超群，起初董卓對他深為喜愛和信任，收他為義子，並提拔他擔任騎都尉。後來，董卓又遷呂布為中郎將，封他為都亭侯。董卓明白自己樹敵太多，常常懷疑有人暗算他，於是，便把呂布當做自己的貼身侍衛。不管董卓走到哪裏，呂布總是形影不離，負責保護董卓的生命安全。一次，呂布不小心得罪了董卓，董卓大怒，隨手抽出手戟向呂布擲去，幸虧呂布眼疾手快，才得以幸免。當時，呂布並沒直接頂撞董卓，而是立即向他謝罪道歉，董卓便不再追究，以後也根本沒把這件事放在心上。可是，呂布卻從此心懷憤恨。此外，董卓經常讓呂布把守中閣，呂布因而得便與董卓的一名侍婢私通，恐怕事情敗露，常常心不自安。當他私下聽說司徒王允要謀算董卓的消息後，便主動前往，向王允等人揭發董卓的各種罪狀。王允把誅殺董卓的計劃告訴呂布，並要求他充當內應。起初，呂布不同意，他說：“不管怎樣，他和我之間有父子關係，要我作內應，恐怕不行吧!”王允開導說：“你姓呂，他姓董，又不是骨肉親情。況且董卓現在已是人人得而誅之的國賊，你難道還認他作父親嗎？他向你擲手戟的時候，把你當兒子看待嗎？”在王允的勸誘下，呂布最終答應了。
一切準備就緒，正好趕上皇帝大病初愈，朝中文武大臣都集會於未央殿，恭賀天子龍體康複。呂布借此機會，事先安排同郡人騎都尉李肅等人帶領十多名親兵，換上衛士的裝束隱蔽在宮殿側門的兩邊。董卓剛到側門，便遭到李肅等人的突襲。董卓大駭，慌忙向呂布呼救，呂布正襟危坐，大聲道：“我們是奉詔討殺亂臣賊子，你死有餘辜！”絕望中的董卓雖然奮力反抗，但已無濟於事，當場被殺，並株連三族。
董卓被殺的當天，滿朝文武和所有士兵都高呼萬歲。長安老百姓高興得在大街小巷載歌載舞，共同慶祝奸賊被誅。據說董卓死後，被暴屍東市，守屍吏把點燃的撚子插入董卓的肚臍眼中，點起天燈。因為董卓肥胖脂厚，“光明達曙，如是積日”。