先是，淡水、雞籠海口擒獲英人，總兵達洪阿、兵備道姚瑩將提郡查訊，因嘉義匪徒滋事暫停。及事平，仍分起提解來郡，委台灣知府熊一本、知縣閻炘帶習英語之宋廷桂、何金逐一研訊，將奏誅之。複奉上諭：『禦史福珠隆阿奏請暫留罪夷、以便解省訊究一折，台灣擒獲逆夷多名，如果尚未正法，即著劉鴻翱飭令達洪阿等按照該禦史折內所陳千裏鏡一節毋庸查究外，其餘逐層究結，明白曉諭，務得實情，密籌辦理，冀有裨於攻剿機宜』。姚瑩覆奏略雲：『臣等欽奉諭旨後，複加研訊。據黑番頭目〈口目〉莉〈口空〉等供稱：伊等均紅毛望結仔、吽朥油各島人，駕夾板洋船，向屬英人管轄，每年俱納鴉片煙土為貢稅。前年中國查禁煙土，無從銷售，英王遂索納金銀；各島亦因煙土難銷，無金銀供應，仍求收納煙土，英王即於檳榔嶼、望結仔、實力等處，雇調兵船七十餘艘，在孟加剌會齊，大船用八九百人、小船五六百人，每人月給番銀四、五圓至十餘圓不等；又漢奸數人沿途賣貨買物供用，令大頭目帶各船至中國，與領事義律求通商。因中國嚴禁如初，即帶各船至虎門、舟山、廈門等處滋擾。去年英王撤回義律，另以璞鼎查為領事；大頭目隨派三十餘船攻廈門，續派二十餘船再攻浙江，又派伊等三桅船三隻來台窺伺。伊等船於八月十二日晚先到雞籠外洋，其同來二船不知何處阻停。伊等遂於十六日駛入雞籠港口，與官兵開炮相攻，被岸上炮擊倒大桅；伊船立破，船中番官三人（一名可失萬、一名巴剌不、一名龍不粦）見勢危急，一於拜天後跳海、一傷目，其一同白番數十、黑番三百餘及漢奸數十分駕杉板船四隻逃走。官兵乘船追至，諸夷或投海死、或被殺死，伊等均被生擒；船上大小炮三十餘門及藥彈、金銀、器物，俱各散失。此該夷船聽從英逆各處滋擾，來台被擒原委也。詰以漢奸姓名、裏籍；據稱漢奸俱係粵人，前英人在廣通商，與管事白番相識。以是雇在各船照料，伊等實不知其姓名。詰以製藥、製炮，該逆能否造辦？據稱：火藥、船隻俱在本國及〈束〉息製造，炮用銅鑄；伊等但能用藥點放，不能造辦。詰以硝磺、米石由何處偷漏、所需內地何物接濟？畏懼中國何項兵法？據稱：硝磺、米石俱由息〈束〉、孟加剌等處運來，或各處漢奸接濟；船中所帶幹麵粉餅極多，非必需內地之物。至在中國打仗，最怕擱淺，是以到一海口，必量深淺；最怕火攻，是以船之兩舷皆用夾木，中層注水以防炮火等語。臣等複詰以檳榔嶼、望結仔、息〈束〉、孟加剌、實力等處是否國名？所獲圖冊、番書是何奸計？據稱：孟加剌、實力是英國屬島，檳榔嶼、望結仔、息〈束〉三處是英國大碼頭，在葛剌巴一帶，順風亦須四、五月方到中國。至所帶圖冊，是沿途各島及中國地圖；番書，是管船白番甲畢丹之物。伊等黑番俱不識字，莫能解說等供。再三嚴詰，矢口不移。臣等查該逆番等因天朝不準販賣煙土，輒聽英人調派，分至各省滋擾，實屬罪大惡極；若如該禦史所奏解省審辦，非惟現乏文武官兵護解過海，且此項黑番俱各島烏合愚蠢之人，問以秘要情形，不能明晰，且恐洋麵番船聞而截奪。應否仍照臣等原議，即在台正法，以彰國憲而快人心；抑如該禦史所奏，暫緩正法之處？臣等未敢擅便』。尋奉旨：『將頭目監禁留存，聽候諭旨；其餘概行正法』。於是將雞寵擒黑番一百二十三名，除受傷在途、在監身斃外，又留存頭目〈口目〉莉〈口空〉、哈吻叻〈口爾〉二人，其餘望葛等一百十七名斬決。又將大安生擒紅、白、黑番四十九名解郡訊供後，亦留存紅番頭目顛林、大夥長律比、二夥長吧底時、三夥長科因諫呢、副頭目怒文、白番頭目伊些駱、黑番頭忍滿七人，其餘紅番肐哩等三名、白夷密林等十名、黑番伊騷等二十九名悉誅之。
〔冬十二月〕，罷台灣鎮總兵達洪阿、兵備道姚瑩。
江寧議款成，約各歸還俘獲；而台灣先後英俘百六十五人已於五月奉旨伏誅，惟以白酋還之。璞鼎查抵廈門，積懷慚恨，遂訐台灣鎮達洪阿、兵備道姚瑩冒功貪賞，擄殺其遭風逃難商民；並張偽示，思與台灣構怨。而主款官吏及失守文武亦忌之，肆為蜚語。瑩等申奏雲：『臣等遵旨釋還英俘及此次遭風英人，業將兩次委員護送並廈門英官來台情形具奏。茲據各稟，委員張肇鑾護送此次遭風洋人二十五名，已於十月初八日交訖。其委員盧繼祖、梁鴻寶護送釋回頭目顛林等九十名，因風於十月二十一日始到廈門；先有洋船在港口守候，即將顛林等攔去鼓浪嶼，尚未給回照。風聞璞鼎查已到廈門，與鼓浪嶼夷酋劄士必作何忽生異議，以為台灣正法之洋人，皆係遭風洋商，不應正法等語；臣等不勝駭異。查台灣洋麵，自上年八月初一日後即有洋船南北遊奕，並無風暴；初九日始有台風，至十二日申刻即止，該洋船係十三日申刻泊雞籠外洋，十五日辰刻移泊近口之萬人堆。十六日卯刻駛進口門，對三沙灣炮台連發兩炮，打壞兵房；我兵即放炮回擊，見其桅折繩斷，船即退出口外，衝礁擊碎。該船來台遊奕在未起台風之先，及到雞籠洋已在風息之後；且先泊外洋、後進口門，中曆三日之久，何得謂之遭風？如係商船，為何開炮攻我炮台？且尚有所獲洋人大小炮位多門及戰甲可證。及九月初五日，又有三桅洋船至雞籠，攻我炮台、石壁，燒我哨船一隻；因上岸洋人為我兵炮斃，始退。似此攻戰交鋒，何竟不言，而以遭風借口？本年正月大安之役，先有三桅洋船三隻在彰化五〈氵義〉港外洋；臣等設伏定計，密遣漁船誘其擱淺擊破，除殺溺外，生擒顛林等四十九人及廣東奸民鄭阿二、黃舟等五人。起獲炮械，內多寧波、鎮海各營軍器，鐫有字號；並起獲浙江提督水師號衣、旗幟各二，署溫州鎮左營守備本汛水陸程途山水形勢冊一，浙江巡撫劄溫州左營包遊擊捕盜、又劄包遊擊查獲販賣鴉片之犯各二，並潁州營左軍葛守備劄薛外委查守兵陳廷儉各印文，現俱存庫可驗。若係商船，何有此物？其為在浙騷擾之兵船無疑。且據該夷目及奸民鄭阿二等供稱，係璞鼎查自定海遣來，持書尋台灣逃軍張從等內應；而張從已於上年由台被獲正法，果有其人。似此供證確鑿，乃捏稱遭風商船，以飾其在台挫衄之恥；夷情狡詐，一至如此。且事在和議未定，薄海同仇；即使洋船實係遭風，亦當乘勢攻擊，方為不失兵機。豈有釋而不擊、擒而不殺之理！況洋人夾板雖多，中多派用商船打仗；勝則稱為兵船以耀其武，敗則指為商船以諱其短，此無足怪。乃於和議已成之後，追尋前事，謂台灣不當以其人正法，成何理耶？臣等幸逢聖明在上，此等無理之言，本不足上瀆宸聰；但夷情難定，其在台者已感激恭順於先，而在廈者忽為此飾情翻異之說。誠恐訛言易滋，於大局甚有關係。現在來台洋人雖已悅服，但江、浙大幫洋船尚未南歸，不可不防患於意外。今既有所聞，不敢不據實上陳聖鑒』。又奏雲：『前此僥幸成功，實由仰承聖訓，先事指示機宜；又得文武。員弁、紳士義民人思敵愾，憤切同仇。且督、撫臣深悉海外情形，屢次令臣等便宜行事，不為遙製。是以臣等不避嫌疑，遇事徑行具奏。故能不失機要，境土安全。即正法之夷，自上年八月及本年正月俘獲，皆羈留久之，迨該逆連犯乍浦、吳淞，始奉旨正法。誠以海外奸民屢次勾通滋事，眾至百數十人，久恐生變。彼時尚未就撫，不得不除內患，仍留其頭目，未肯全誅。臣等仰體皇上格外之仁，安敢濫殺。敵未就撫，兵商皆我仇讎；況騷擾有據，前後奏牘具在。祗以上崇國體、下固人心，張我軍威、作我士氣，乃蒙聖主俯鑒海外孤危，內安外攘之難十倍內地，不惟臣等及全台文武屢邀寵恩，迥逾常典；並以台地人心浮動之區，紳士、義民能知大義，每於賞勸獎勵之中，特加優異。聖謨廣遠，燭照遐方，所以鼓士氣而勵戎行，迥非臣下所能企及。臣等力小任重，本深以為懼；台灣之賞愈厚，則英人之忌愈深。觀該酋示中有雲：『中華之辱，莫甚於此』；其情亦可見矣。廈門與台灣對峙，洋人在廈設立碼頭，商船往來貿易；臣等在台，實犯彼之大忌。今偽示稱，請大臣代奏伸冤；諒此虺蜮之情，斷不能逃聖鑒。而臣等密邇仇讎，彼必借口而來滋擾；縱使防禦周詳、人心鞏固，第方今受撫之初，豈可以一隅致礙大局！伏乞皇上天恩，將臣等開缺，即日撤回，聽候欽派大臣到台查辦，俾台灣免生兵釁。至台灣各口要隘設防兵勇，前已酌量抽減，以節經費；今夷即與台灣為難，不得不仍行嚴備。並求迅賜簡放鎮、道，以重地方而專職守』。時諸大吏慮兵端再啟，各據洋人遞詞入奏。耆英竟劾台灣鎮、道冒功，達洪阿、姚瑩遂罷。