呼吸道的第二道“關口”是氣管、支氣管。
肺部的支氣管，如同樹枝一樣，由氣管到主支氣管，再到分支氣管乃至肺泡，其氣道內徑逐漸由大變小，而支氣管數目由少至多，就好像一棵大樹，隻不過是樹幹在上，樹枝朝下而已。
保持正常形態和功能的支氣管，具有防禦異物和病菌入侵的功能。通過咳嗽或支氣管黏膜分泌免疫球蛋白，可使進入氣道內的病原微生物被殺滅，或經咳嗽清除出去。支氣管黏膜表麵，鑲嵌著分泌黏液的杯狀細胞和約有200根微細纖毛的纖毛上皮細胞。在健康狀態下，杯狀細胞分泌的黏液覆蓋在纖毛上，可粘住空氣中較小的顆粒塵埃。纖毛在那裏不停地向上擺動著，每根纖毛每分鍾約擺動1500次，醫學上稱為纖毛運動。它如春風吹動麥苗形成陣陣麥浪那樣，連續向著一個方向推動，把進入下呼吸道的塵埃和分泌物，一步步推向咽部，最後被吞下或咳出。
外界的各種刺激，如吸入寒冷空氣、吸煙、酗酒等，均可抑製纖毛運動，甚至破壞纖毛柱狀上皮細胞，即破壞下呼吸道的防線。所以，應盡量避免上述因素的刺激。
呼吸道的第三道“關口”是肺泡巨噬細胞，它們是肺髒的“近衛軍”。
肺泡巨噬細胞來自肺部的毛細血管，分散在大量肺泡內。當有害物質——微生物、塵粒等突破上述各個防線到達肺泡時，大量肺泡巨噬細胞能以驚人的速度將其吞入，並帶著這些吞噬物向上，遊到細支氣管的黏膜層跟著黏液排出。但值得注意的是：缺氧、吸煙、服用免疫抑製類藥物(如激素)等，均可降低肺泡巨噬細胞的吞噬和殺菌作用。因此，也要注意避免上述因素，以保持呼吸道的健康。