選擇投資項目是指風險投資公司在大量的風險企業或項目中，篩選出部份有發展前景的項目進行盡職調查與評估，主要工作是取得投資方案、進行篩選和評估。一般涉及三個階段。
第一階段：項目收集，即風險投資公司接受和收集風險企業的提案或投資申請書。
第二階段：商業計劃書的初步篩選，即對商業計劃書進行瀏覽以判斷是否進入下一階段，風險投資公司一般根據其所在風險基金的投資原則，對商業計劃書進行簡單瀏覽，來判斷其是否違背基本原則，一般主要考慮其所處行業、投資規模、發展階段和地理位置。
第三階段：商業計劃書的一般篩選，即對商業計劃書進行細致的閱讀，以判斷是否進入具體項目的評估階段，在這個階段，風險投資公司會對商業計劃書進行詳細的閱讀，以判斷是否值得投資，而商業計劃書的表述、內容和信息量是主要的評閱指標。
商業計劃憶的初步篩選與一般篩選階段的核心內容與目標，都是從眾多的申請提案中篩選出符合風險基金投資原則的項目提案。兩個階段的核心內容、目標、對象均一致，隻是後者更詳細一點。
風險投資公司篩選項目時，首先要考慮投資項目所處的行業領域，其市場、技術情況是否與自己的投資原則一致。一般情況下，風險投資公司篩選時通常隻考慮自己熟悉的領域。因為隻有對投資的風險企業所處的行業有深刻的認識和理解，風險投資公司才能充分利用自己的豐富經驗和良好的網絡關係，為企業在技術、市場與管理等方麵提供增值服務，才能更好地規避技術與市場風險，取得預期的投資收益。其次，風險投資公司企業的發展初期和成長期，其投資風險不同，收益也不同。再者，選擇合適的投資規模，就一般風險基金而言，其投資規模是有上限和下限約束的。
任何一家風險投資公司既不會把所有風險資本集中在少數幾個風險企業上，也不會把資本分散於大量規模過小的風險企業之中。在管理費用與投資風險的權衡中，風險投資公司通常會根據其風險資本的規模大小及風險偏好確定一個適合自身的投資規模。最後，風險投資公司對風險企業的篩選與評估，主要依賴商業計劃書。因此，要求商業計劃書表述清晰，內容真實，信息充足，分析全麵，包括合理周詳的目標與戰略；要求商業計劃書中的信息包括經濟、社會、法律等環境的分析，風險企業所處行業的分析、競爭分析、需求分析、產品市場定位分析、財務分析等，以及企業發展目標、戰備規劃等內容。
3.項目評估階段
風險投資能夠選擇合適的投資機會所依托的就是對風險投資企業或項目的評估與分析，因此風險投資的評估與分析是決定風險投資運作成功與否的關鍵一環。
評估階段是風險投資公司對篩選通過的方案進行詳細分析的階段，並且決定是否投資。評估內容分為兩方麵：一是評估風險企業的總體預期風險和收益，包括評估風險企業或者項目的營利能力、產品與技術特征、市場特征、競爭對手的威脅、抗禦風險的能力等；二是評估風險投資公司能得到的收益，包括進一步評估風險企業的投資規模，並對風險企業或項目進行投資估價，從而得出風險投資的預期收益。具體實施包括如下內容：
首先與風險企業的管理人員會談，考察風險企業、谘詢專家、顧客、市場中介等，獲取相關信息，得出評估結論。通常認為風險企業的管理人員對風險企業的影響十分巨大，因此在風險投資公司決定對風險企業進行投資以前，需要重點評估的是風險企業管理人員的各種能力，如經營管理能力、市場營銷能力、財務管理能力、風險預期能力、產品與技術創新能力等，目的是考察這些人員的能力對風險企業未來發展的影響，並由此做出相應的投資決策選擇。
其次評估風險企業的產品與技術能力。風險投資公司會全麵了解有關企業的核心技術、風險、產品功能特性，也就是對產品和技術的市場運作的可能性進行全麵詳盡的分析。任何一個投資項目或者產品都必須要有足夠的市場規模、市場競爭力與顧客需求潛力，才可能維持企業的生存與發展。
再次對風險企業的財務狀況與投資規劃進行評估。評估企業的財務狀況、當前的股東結構、未來財務計劃的合理性、申請投資金額的合理性、項目的市場價值、回收年限與投資報酬的實現可能性等。
最後對風險企業的估價。在風險投資領域，這也是最為棘手的問題之一。因為這個估價關係到風險投資公司投資所得到的權益以及未來的投資收益。解決這個問題一般分為三步。第一步，對風險企業或者項目、管理隊伍以及未來發展前景進行信息采集；第二步，利用這些信息評估投資風險和預期收益，並進一步估計未來的自由現金流；第三步，運用一種或幾種估價方法，並結合風險、收益、現金流來計算風險企業的價值。