清初，由於戰爭的需要，八旗旗主們都有著非常大的權力。他們對皇室來說，大多都是親王，皇帝對他們特別優待，對旗內官兵，他們則是主子，官兵們猶如旗主的私人財產。而且旗主實行世襲製，所以這份財產可以傳給子孫。這就像獨立王國一樣。雍正皇帝登基後，認識到這種製度顯然對皇權的集權統治十分不利，因此，他采取了一係列措施，對八旗旗務進行了大刀闊斧的改革。
□用都統事務代替旗務
雍正皇帝繼位之初，承襲康熙皇帝遺策，任用自己的親信、兄弟和王公管理八旗事務，如任用康親王崇安管理正藍旗三旗事務，任用皇十七弟果郡王允禮管理鑲紅旗事務。雍正皇帝自以為這樣任用親信、兄弟和王公管理八旗事務能平安無事，但他在對管主的使用中，很快發現管主、皇帝及八旗內官員存在著很大矛盾。管旗務的諸王因身份崇高，還影響皇帝對旗民直接統治的權力，而管主又同都統等官員職權難分，往往互相摩擦，不免要常常耽誤公事，於是雍正帝采取了一係列措施，改革旗內事務：
雍正六年（1728），雍正皇帝當機立斷，減少管主，取消了信郡王德昭、崇安、錫保等人管理旗務的權力。
七年（1729），雍正皇帝任命莊親王允祿管理鑲白旗滿洲都統事務。
九年（1731），雍正皇帝又改命莊親王允祿管理正紅旗滿洲都統事務。
十年（1732），雍正皇帝任命平郡王福彭管理鑲藍旗滿洲都統事務。
雍正皇帝任用莊親王允祿、平郡王福彭是管理都統事務，與管理旗務大不相同。管理旗務，管主是八旗都統的太上皇；對管主，都統得俯首貼耳，唯命是從。而管理都統事務，本身相當於都統，或是兼職都統，即使高於都統，在管理八旗旗民上也高不到哪兒去。都統是八旗的軍政長官，是一種職務，負責掌管八旗的政令施行，戶口的稽查，旗人的教養訓導，官爵的薦任，軍糧器械的征收以及協助皇帝管理旗務。他們由皇帝臨時任命，不能世襲，與所在旗之旗民是官民關係，而不是主從關係。允祿是雍正皇帝的第十六弟，又以親王的身份管理都統事務，表明皇子、親王在八旗中地位的降低，表明管主被取消。雍正皇帝將旗務的控製權也掌握在自己的手中。
到雍正皇帝統治時期為止，清代管理八旗事務人員經曆了三個階段的變化，即從旗主到管主，從管主到宗室貴族管理都統事務。每一次變化，都是旗內主從關係的進一步削弱，旗主不再具有原先的旗內自主權，皇帝將它剝奪得一幹二淨了。這三部曲是皇權在八旗內（最主要是下五旗）強化的過程，而雍正皇帝利用宗室貴胄管理都統的辦法，正是八旗（尤其是下五旗）私屬關係的終結。這是八旗製度內皇權、旗主權彼消此長過程的主旋律，圍繞著這一主線，雍正皇帝還采取了許多行之有效的相應措施。
□取消八旗都統“主”
八旗都統，清文為“固山額真”，而“額真”在滿語意為“主”的意思。雍正元年（1723），善於察言觀色的給事中碩塞條奏道：“額真二字，所關聯的含義頗深，不是臣下可以隨便使用的。”請求皇帝禁止臣下使用，並另行改名。雍正皇帝欣然接受這一建議，命令將“固山額真”改為“固山昂邦”，意為總管，即漢文的都統；又將“伊都額真”改為“伊都章京”，意為領班。臣下不能稱“主”，天下隻能尊奉一個主人——皇帝，以此而達到正名分、崇君王的目的。“固山額真”，是努爾哈赤建立八旗製度時的老名稱，而這一名稱的廢止相距時間兩甲子一百二十年，在雍正皇帝以後的都統早已不複存在旗主之意，從意識形態上革除了旗主僅剩的一縷痕跡，從而也標誌旗主權力的實際喪失。