2000年，溫州市工商聯針對所主管的行業商會，專門出台《關於加強和規範行業商會工作的通知》，在《溫州市行業協會管理辦法》基礎上，細化了對行業商會的管理內容。這主要包括四個方麵：（1）加強行業商會換屆管理，包括換屆程序、理事會成員的任職條件和理事會產生程序；（2）加強行業商會聘用人員的管理，包括專職秘書長的聘用與管理、其他工作人員的聘用與管理、聘用人員的工資、福利待遇和社會保險；（3）加強財務管理；（4）建立和完善重大事項彙報製度。《通知》強化了主管單位的職能，加強了主管單位對行業協會的管理。換屆不規範導致寡頭化問題，人員聘用不規範導致日常事務混亂，財務不規範導致財務危機和背離非營利原則等三項失範行為，在行業商會發展中最容易出現，亟待規範。《通知》在這些問題上製定了更加細致的規則，使對商會的監管更加製度化。
2001年，溫州市經委出台《關於組建、規範和完善溫州市30個行業協會應（商會）的實施意見（試行）》。意見指出，對列入組建、規範和完善的30個行業協會，（1）健全組織機構，包括行業協會領導班子建設、會長選拔、秘書長和專職人員的聘任、黨組織的建設等；（2）健全行業自律機製和規章製度，包括行業協會要製定規範的章程和行規行約、建立健全財務管理製度和會計核算辦法、規範工作製度和辦事製度、創辦會刊等；（3）加強自身建設，拓展工作範圍，包括行業協會要組織會員參加政治活動、社會活動和經濟活動；協助政府做好行業管理工作，真正在政府與企業之間發揮橋梁與紐帶作用；加強行業協會班子的理論學習，以適應新形勢的需要。這些規定不僅要求行業協會完善運行機製，還擴展了它們的職能。
2005年溫州市政府辦公室出台《溫州市人民政府辦公室關於進一步促進行業協會（商會）規範化發展的若幹意見》，其中對規範行業協會運行提出七點意見：（1）提高認識，明確行業協會（商會）發展的指導思想與工作目標：指導思想是逐步建立政府與行業協會（商會）之間“授權與合作”、“監管與平等”的新型關係，努力建立行業協會（商會）與產業發展的良性互動機製；發展目標是經過3-5年努力，進一步優化行業協會（商會）的布局與結構，形成行業協會（商會）良好的運行環境和機製，建立與溫州的產業結構及城市特點相適應、市場化運作、規範化管理、功能完善的行業協（商）會體係。（2）明確職責，創造行業協會（商會）規範化發展的良好環境。民政部門要按照有關法律法規加強對行業協會（商會）的登記管理，工商、稅務、質監、環保等部門要支持行業協會（商會）開展各項行業自律活動，其他相關部門要按照各自職責，做好促進行業協會（商會）發展的服務工作。嚴格按市場化方式推進行業協會（商會）發展，堅持實行“政會分開”，即行業協會（商會）工作機構不得與政府部門合署辦公，在人、財、物等方麵與政府部門完全分開，國家機關工作人員一律不得擔任行業協會（商會）的領導職務。（3）製訂規劃，優化行業協會（商會）的布局和結構。堅持“一業一會”的原則，通過建立健全行業協會（商會）進入和退出的競爭機製，推進現有行業協會（商會）的結構調整、優化和提升。（4）擴大覆蓋麵，提高行業協會（商會）的行業代表性。各行業協會（商會）要鼓勵本行業企業積極入會，不斷提高行業企業的入會率。（5）提高素質，加強行業協會（商會）規範化建設。進一步推進行業協會（商會）民主化建設，行業協會（商會）的籌建、領導機構的產生、重大事務的決策必須遵循民主原則和按章程行事；進一步加大對行業協會（商會）工作人員特別是秘書長的培訓，優化行業協會（商會）工作人員結構，增強行業協會（商會）的凝聚力；行業協會（商會）不得通過製訂行業規則或者其他方式壟斷市場，限製會員活動。（6）完善職能，充分發揮行業協會（商會）的作用。繼續完善和落實《溫州市行業協會管理辦法》所賦予行業協會（商會）的16項職能，結合貫徹《行政許可法》和行政審批製度改革，把能夠由行業協會（商會）行使的管理職能盡快轉移給行業協會（商會）。同時發揮行業協會在職稱評定、安全生產、技術標準製定、行業發展規劃、品牌和信用建設、行業維權、信息和技術交流以及應對貿易壁壘等方麵的作用。（7）加強考核，建立行業協會（商會）激勵機製。加快建立行業協會（商會）的考核機製和評價體係，對行業協會（商會）的組織機構、製度建設、業務開展等方麵進行全麵考核，優選出一批組織健全、製度完善、業績突出、具有示範性作用的行業協會（商會），並給予扶持與獎勵。這七點意見內容全麵而具體，既是對行業協會（商會）既有職能的落實和深化，又是對行業協會發展的規範，它既致力於推進行業協會（商）會參與行業治理和社會管理，又關注和限製行業協會的權力越位，還為完善行業協會的評價機製提供了指導性意見。
目前，溫州市經貿委正在製定《溫州市工商領域行業協會評價管理暫行辦法》，其征求意見稿已經發表。《辦法》將主要用於評價行業協會的規範化建設和業務活動，其中規範化建設的評價指標主要為組織建設和製度建設等方麵，業務活動的評價指標主要有行業自律、規劃調研、信息交流、行業培訓、品牌建設、節能減排、技術創新和公益活動等。評價結果分為四等：優秀、達標、基本達標和不達標。對於優秀、達標的行業協會，經貿委將分別予以6-10萬、2-5萬元獎勵；對於基本達標的行業協會，要求整改提高，力爭達標；對於不達標的行業協會，要求限期整改。對於連續兩年不達標的行業協會，督促其與相近的行業協會合並重組或予以撤銷。製定這一評價體係的意義在於，在“一業一會”的非競爭體製下，政府部門能夠通過評價活動來促進行業協會有效地履行職能，通過行政手段淘汰不能真正發揮作用的行業協會，實現以評價促規範。
根據浙江省政府、省委組織部和省發改委《關於推進行業協會改革與發展的若幹意見》（浙政發〔2006〕57號）、《關於現職機關工作人員不得在行業協會兼職的通知》（浙組發〔2006〕49號）和《關於浙江省行業協會與行政機關脫鉤的意見》（浙發改〔2007〕92號）等文件要求，2007年，溫州市發改委和民政局製定了《關於溫州市行業協會與行政機關脫鉤的實施意見》，並成立了以副市長任組長的行業協會與行政機關脫鉤工作領導小組，對現職機關工作人員兼任職務、與行政機關合署辦公和會計合賬的三類行業協會進行脫鉤，要求做到人員分離、機構分設、財務分開、職能分開和編製分開，脫鉤後的行業協會要在名稱、會員組成、組織機構和負責人、管理製度等方麵進行規範。經行業協會自查、業務主管單位核實和登記管理機關審查，確定溫州市應脫鉤行業協會116家，其中有公務員兼職的84家。2008年7月，這些行業協會與行政機關的脫鉤工作已全麵完成，155人次兼職公務員退出行業協會。其中，44家與行政機關合署辦公的行業協會實現了機構分設，1家與行政機關會計合賬的行業協會實現了財務獨立。
由上可見，伴隨著地方政府改革和民營經濟發展，民間商會在參與獲得政府賦權，不斷發展。政府在賦權的同時對民間商會予以規範，從而形成了“參與→賦權→規範→發展”的良性循環。