朱元璋見朱標過於柔弱，倒是四皇子燕王朱棣聰穎勇武，有些像他自己，曾打算把太子朱標廢掉，立朱棣當太子，跟幾個大臣商量，大臣們都認為廢長立幼，不合宗法，都不同意。但朱標知道後，明白父皇不喜歡自己，終日惶懼不安，於洪武二十五年因病去世。太子朱標死後，朱元璋依據宗法原則，便立朱標長子朱允為帝位繼承人。明太祖是農家出身的，對農民生活多少有點了解。他即位以後，也注意實行休養生息的政策。他告誡地方官員說：“現在天下剛剛安定，百姓4財力困乏，好像初飛的鳥，不能拔它的毛；新種的樹，不能搖它的根。”他要官員們廉潔守法，不能貪贓枉法，加重人民負擔。以後，他又招集流亡農民，開墾荒地，免除三年的勞役和賦稅；要各地駐軍屯田墾荒，做到糧食自給。他還興修水利，獎勵植棉種麻。所以，明朝初年的農業生產有了很明顯的發展，新建立的明王朝統治也鞏固下來。
神機妙算劉伯溫
劉基，浙江青田人。人們常叫他劉伯溫，伯溫是他的字。他是個很有學問的知識分子。年輕時，他在元朝政府中做過官，看到元朝統治日益腐敗，一場社會大變動即將到來，就辭去官職回到家鄉青田隱居起來。朱元璋帶兵打到浙江的時候，聽到了劉基的名聲，便派人帶著禮物與自己的親筆信，去見劉基，非常懇切地邀請他出山，與自己一同推翻元朝的統治，為天下百姓爭活路。劉基見朱元璋確有成就事業的魄力和氣度，就來到朱元璋的軍營。朱元璋立刻與劉基徹夜長談。當時，朱元璋剛占領應天不久，劉基就替他分析了形勢，勸告朱元璋不必急於稱王，讓劉福通去正麵對付元軍，做自己的軍事屏障；也不要急於吞並浙江的方國珍和江蘇的張士誠。因為方國珍勢單力薄，不足為患；張士誠雖有相當實力，卻在占領平江（今江蘇蘇州）以後隻顧享樂，胸無大誌。而更重要的是要養精蓄銳，準備全力對付西邊的陳友諒。朱元璋聽得心服口服，連連誇獎道：“伯溫先生，你真是我的臥龍（諸葛亮，劉備的軍師）啊！”朱元璋按照劉基的策略部署兵力，鞏固根據地，擴軍備戰。當陳友諒數十萬大軍兵臨應天城（今江蘇南京）下的時候，劉基提出了東邊穩住張士誠，避免遭到東西夾擊的態勢，然後以智取勝的計謀。朱元璋采納了劉基的意見，用智謀挫敗了陳友諒。從此，朱元璋更加信任劉基，說他就像輔助漢高祖的足智多謀的張良。
劉基始終保持著清醒的頭腦，適時地對朱元璋提出明智的建議。朱元璋正式做皇帝後，就大封功臣。那些跟隨他出生入死打江山的文臣武將，有的封“公”，有的封“侯”。比如，李善長封韓國公，徐達封魏國公，常遇春封鄂國公，李文忠封曹國公，康茂才等十八人也封了侯。論功勞，朱元璋要封劉基為“公”，但他堅決不受。以後，又要給他封“侯”，他還是推辭。最後，實在推辭不掉，隻好接受一個三等爵位，叫誠意伯。當時被封了高位的人大都得意忘形，他們很不理解劉基的謙讓。但是，對社會、曆史了解透徹的劉基，早就看透了朱元璋的本質——這是一個可以共患難，卻難以同享樂的帝王，因此，盡量與他拉開距離。到朱元璋當皇帝後的第三年，劉基就請求告病回家，但沒有得到朱元璋的允許。又過了一年，劉基的夫人在家鄉病死，他乘奔喪之機回到老家，再也不出來了。劉基離開朝廷後不久，朱元璋開始大殺功臣。他親手封的那些公侯們，差不多被他殺個精光，隻有劉基等少數幾個人逃過這一厄運。這再次證明了劉基的聰明。
明太祖嚴懲貪吏
明朝建國後不久，官吏貪贓枉法的事接連發生，為了鞏固自己的統治，明太祖朱元璋讓各府、州、縣和衛所在衙門的左邊，修一座小廟，裏麵供土地神；在官衙大堂公座的左邊，懸掛著一個人皮楦滿草的袋子，叫“皮草囊”，相傳全國都是如此。明太祖深知“官逼民反”的道理。他說：“元朝因為寬容放縱貪官汙吏，把江山丟掉了，如今我得天下，若不用嚴刑峻法便不足以矯正積弊！”他規定官吏貪贓80貫錢（每貫1000文錢，約折銀一兩）的便絞死示眾，然後剝皮實草，做成人形袋子，掛在當地衙門的大堂上，以儆效尤。明太祖還頒布了一道命令，允許鄉亭老人（裏甲編製中負責水利興修、風俗教化以及民事糾紛的人）有參議政事的權利。