1989年以後，全麵開展了行政區域界線的勘定工作。至2000年底，已勘定省級界線230公裏（尚剩8公裏），占全縣跨省邊界任務的95%；省內跨區界線394公裏（尚剩56公裏），占全縣跨區邊界任務的87.8%；區內縣界348公裏，占全縣區內縣界任務的100%；縣內鄉級616公裏，占勘定任務的100%。其中，1989年，配合省地勘界領導小組工作組，完成了省內勘界——天祝與永登邊界試點工作。1992年，劃定了天祝與景泰縣約40公裏的邊界，並埋設了界樁。
1993～1994年，劃定了天祝與武威（今涼州區）、天祝與古浪邊界。1995年，劃定了縣內鄉與鄉之間界線，並編寫了邊界走向文字說明，邊界線地形圖，3縣交彙點等邊界資料。1996年，劃定了天祝與青海互助縣約55公裏、天祝與永登縣約166公裏的邊界。1998年，劃定了天祝與青海省門源縣74.9公裏、與肅南縣約4.1公裏的邊界。1999年，劃定了天祝與樂都縣邊界35公裏、與互助縣遺留未定邊界20公裏、與永登縣遺留未定邊界184公裏。
（二）邊界糾紛調處
天祝縣與周邊縣市相鄰地區群眾在從事放牧、開礦等生產活動時，往往會發生糾紛。同時，縣內鄉鎮之間也時有邊界糾紛發生。天祝縣以法定線，以過去形成的地圖、文件、協議和解放以來的實際管理狀況為依據，有效調處了邊界糾紛，遏製了事態的擴大，維護了邊界地區的穩定。自1990～2000年，先後調處了旦馬鄉康路村與白羊圈村之間的草原糾紛，縣城區原師部大院、岔口驛軍馬調教場、鬆山炮兵靶場等軍地產遺留問題，華藏寺鎮與永登縣坪城鄉在馬場地區因修水渠而引起的邊界糾紛，縣內祁連鄉與毛藏鄉在大小花石頭地區長達30年的邊界爭議，旦馬鄉與肅南縣鏵尖鄉在仗射溝地區的草原糾紛，華藏寺鎮與柏林鄉在黃草川地區的邊界爭議，石門鄉與永登縣武勝驛鎮在石坡溝等地區因放牧而引起的草原糾紛；安遠鎮與古浪縣古豐鄉在四道車場因放牧而引起的糾紛，鬆山鄉與景泰縣正路鄉在鬆山灘放牧引起的草原糾紛，鬆山鄉與武威地區天祝種羊場在黑馬圈河發生的草原糾紛，鬆山鄉與古浪縣新堡鄉在蕨麻溝地區發生的草原糾紛，安遠鎮與古浪縣黑鬆驛鄉在小嶺子地區因葬墓而引起的爭議，朱岔鄉與炭山嶺鎮在大科什旦腦發生的礦產資源爭議。石門鄉與永登縣武勝驛鎮在麻子溝地區因放牧而搶趕羊隻的糾紛，鬆山鄉同景泰縣寺灘鄉在囊鎖寺地區發生的草原糾紛，柏林鄉與華藏寺鎮在羅鍋峴子、大紅溝鄉與毛藏鄉在老鼠窪邊子、抓喜秀龍鄉紅疙瘩村與炭窯溝村在石樁溝腦等草原爭議，天祝縣與肅南縣在大營盤地區的草原糾紛，鬆山鄉與錢寶鄉在香水溝腦，鬆山鄉鬆山村與黑馬圈河村在萱麻圈窩地帶發生的草原放牧糾紛，祁連鄉與毛藏鄉在黑鄂博掌地帶的放牧糾紛等。2001～2005年，共調處與鄰省、鄰縣及縣內鄉鎮之間、村組之間因放牧、采沙、采金等引起的邊界糾紛20餘起。
四、救災救濟
（一）生產救災
1963年5月，哈溪、祁連區的16個公社、126個生產隊遭受嚴重的洪災；6～7月，全縣有15個公社的77個生產隊遭到冰苞襲擊。縣委、縣政府及時采取措施進行救災，對外出人員，畜群進行清查，對死者家屬和受災群眾進行了安置，給生活困難者發放救濟棉布2.16萬米，棉花1350公斤，口糧款3.2萬元，救濟款2萬元，醫療款5000元。
1966年，發生嚴重旱災，延續8個多月，後遭受雹災。全縣召開了生產自救工作，廣開副業門路，收入44萬多元，發放救濟款5萬元，口糧款2.98萬元，解決了3.24萬戶特重災民和重災戶困難。
1974年，全縣糧食作物受災麵積達16.05萬畝，13.45萬農業人口中8.21萬人口生活嚴重困難。國家拔給回銷糧250萬公斤，口糧救濟款23萬元，重點解決了受災嚴重的2630戶、1.5萬人的口糧問題。縣上廣開副業門路，積極開展生產自救，妥善安排了受災群眾生活。