鄭貴妃心有不甘，就指使爪牙再想些辦法。於是又想出一個“待嫡”之說，要萬曆加以宣諭。強調立嫡，因為所有的皇子都不是嫡子，也都沒有什麼當立為儲的特權。可這待嫡之說又很快被眾議駁倒，因為立嗣雖應以嫡子為先，但卻無必授嫡子之說，而是“有嫡立嫡，無嫡立長”，皇長子之所以不同於諸子，正是由於他是合於“無嫡立長”這一條的。這時候私下已開始有人議論，說待嫡之說實在不通，就是當今的萬曆皇帝亦非嫡子，所以這一說還沒等公議，也就很快流產了。一計不成，又生二計，這些人轉眼又想出了一招，要鄭貴妃請求萬曆，來個“三王並封”。
所謂“三王並封”，就是在建儲之前，先把皇長子朱常洛、皇三子朱常洵和另一個皇子朱常浩三人都先封王。隻要三人同日封王，彼此都別無二致，下一步就好另做手腳了。鄭貴妃於是讓萬曆交與閣臣擬旨，就在擬旨之時，外麵又早風聞此事。大家細細一研究，認為這又是鄭貴妃為抑製皇長子布下的一個陷阱。經過閣僚的反對，這招又不靈了。
就這樣彼此你來我往互相較量了無數個回合，皇長子朱常洛已長至20歲，皇三子朱常洵也已年至16，但都還沒有成婚。萬曆此時也被搞得精疲力盡，終於在公元1601年冊立皇長子朱常洛為皇太子，並於第二年為他完了婚。鄭貴妃在這一重大回合中終於慘敗。
皇長子雖然已被冊立了，可幕後的鬥爭仍在繼續。鄭貴妃和她的父親鄭承憲、伯父鄭承恩、哥哥鄭國泰比以前更起勁地在暗中搬弄是非，挖空心思要把已被冊立的太子給廢掉。他們又決定利用“妖書”一案，挑起事端，借以擴大影響。所謂“妖書”一案，還是在皇長子朱常洛被冊立以前發生的一件案子。那時候有個刑部左侍郎叫呂坤，在他任按察使出巡山西時，寫了一本名叫《閨範圖說》的小書，書中所載是曆代一些有賢德淑名女子的圖說。恰巧內監陳矩奉詔在外收書，這本小書也在被收之列，運進宮中。萬曆偶爾翻見到此書，也就把它賜給了鄭貴妃。賜者無意，可受者有心。鄭貴妃自己又另外加上了十二個人的圖說，並且為之作序，交給她的伯父鄭承恩拿去刻版成書，又印了一些散發以擴大影響。給事戴士衡因為和呂坤有仇隙，便借這件事上疏彈劾呂坤假手承恩向鄭貴妃進獻此書，借以諂媚，勾結內宮，包藏奸詐。這時突然有人給《閨範圖說》作了名為《憂危竑議》的跋，流傳於世。跋文中說，呂坤撰《閨範》一書，以漢明德馬皇後為首，是由於那馬皇後乃是從宮女逐漸被晉封為皇後的。他的用意，很明顯是在向鄭貴妃獻殷勤。鄭貴妃之所以要刻此書其深意也實在於此，即為自己的兒子能立為太子找個先例，加以宣揚罷了。跋文還在最後說明了該文取名的含義所在，它提到呂坤曾上過名為《憂危》一疏，其疏中可以說無事不談，但偏偏不談論當時最為世人矚目的立儲一事，因此呂坤的用心，就此可見一二了。這篇跋文明裏是衝著呂坤的，但明眼人一看便知，其鋒芒是直接指向鄭貴妃的。所以鄭貴妃及她的家人同夥一致認定，作此文者必定是出於彈劾過呂坤的戴士衡，或曾彈劾過鄭貴妃的全椒縣知縣樊玉衡二人之手。鄭貴妃於是通過萬曆之手立即貶處了二人，才算罷手。
這事本來已算了結，不知是好事者還是鄭貴妃的爪牙所為，又拋出一篇名叫《續憂危竑議》的文章，成了千古不解之謎。但因此案卻又有很多人遭受了飛來橫禍。這篇續議名義雖似老調重彈，而意指卻已全非，文章核心是說太子雖然已立，但在不久的將來一定會被廢掉。因為皇上是被逼無奈的情況下，不得已勉強冊立太子的。這篇文章是假托一位叫“鄭福成”的人與來客對答的方式而寫成的。那時候皇三子朱常洵已被封為福王，從這一取名，一望便知，是暗喻鄭貴妃的愛子福王必會成功之意。文中特意舉一例證，來證明確有其事，萬曆曾經特諭一名叫朱賡的入閣為內閣大臣，這個朱賡的“賡”字，就是“更”的意思，因萬曆忽然有此一命不是含意很深嗎？這是向世人暗示要更換太子了。大學士朱賡因文中牽扯到了自己，就尋到這篇文章讓萬曆過目，以明心跡。萬曆閱過此文，不勝惱怒，立刻嚴令錦衣衛，一定嚴加偵緝，務必使主犯歸案授首。此案一出錦衣衛便假公濟私，借以官報私仇，屢興大獄，使好多人，上至朝臣下至百姓都無辜受害，死於非命，最後此案竟不了了之。