憲宗看了這個奏章，不覺大驚失色。他一輩子都崇佛道，好方術，對這種自然現象發生所做的附會解釋尤其篤信。他害怕如果做出改易儲位的忤逆天意的舉動，各種災難禍害就會接踵而至。他連忙到寺廟掛袍行香，祈求上天原諒他的過失，並下旨說：“東宮太子之立乃天意，不可違背。任何人不得再提改易儲位之事。”
改易太子不成，萬貴妃無法咽下這口惡氣，卻又無可奈何。她知道有朝一日憲宗歸天，太子即位，是不會饒恕她和她的家族們及她的黨羽的。她變得心情低沉，鬱鬱不樂，囂張之勢有所收斂。
公元1487年春，萬貴妃的心情越來越壞，動輒發脾氣，由於她肥胖臃腫，一發起脾氣來就呼吸急促，好半天喘不過氣來。這天，一個宮女因一點小事觸怒了萬貴妃，盛怒之下，她操起驅趕蚊蠅的拂塵猛力地朝宮女狠打幾下，氣喘之下，一口痰堵在嗓子裏，氣絕身亡，卒年59歲。出外參加慶成宴而回的明憲宗聽到寵妃暴薨的消息，急忙趕到安喜宮，放聲大哭，他撫摸著萬貴妃的屍體，邊哭邊歎：“萬侍長去了，朕怎麼能再久留於世呢！”為了表示對萬貴妃的痛悼，他下旨輟朝7日以示哀悼，並按皇後禮葬萬貴妃於昌平天壽山西南的蘇山，贈諡號為“恭肅端慎榮靖皇貴妃”。
萬貴妃之死，對憲宗是一個極大的打擊，還不滿四十歲的他竟因哀傷過度，一病不起，也於當年八月二十二日死去。曆史上貴妃專寵不乏其例，但像明憲宗這樣終生寵愛一個比自己年長19歲的女子，則是絕無僅有的。
明憲宗去世後，太子朱祐樘即位，史稱明孝宗。曆經磨難的明孝宗深知匡時糾弊的必要，即位之初就懲治了靠依附於萬貴妃而進身的貪贓枉法、奸佞無恥之徒。他命令把李孜省謫戍邊衛，旋又下旨把他捕入大獄，最後拷死於獄中；僧人繼曉也被逮捕法辦，後來被處死；太監梁芳、韋興等被充南京淨軍，至死未再複用。大學士萬安一看勢頭不妙，慌忙改弦更張，逢人便辯解說：“我與萬家並無親緣，我與萬家已經很久沒有來往了。”後來孝宗無意中翻得一小篋奏疏，裏麵全是講房中術的，每疏末尾處都署有“臣安進”。孝宗閱後怒不可遏，立即派已被重新召回的、忠厚耿直的司禮太監懷恩提著篋子去內閣質問萬安：“這難道是你大學士應該上的奏疏嗎？”萬安嚇得魂飛魄散，跪在地上不敢作聲。懷恩又將科道彈劾他的奏疏讀給他聽，讓他辭職。可萬安跪下哀求並無去意，懷恩隻得摘其牙牌說：“請公去矣。”萬安這才倉皇索馬回府，請求回鄉。
朝廷憎恨萬貴妃的人十分多，許多大臣紛紛奏章列舉萬貴妃殘酷惡毒、殺人害命，以及其兄弟的驕橫霸道。禦史曹璘上疏要求孝宗拆掉萬貴妃的墳墓，削奪她的諡號，並治萬貴妃家屬的罪。山東魚台縣丞徐瑣上疏說，紀太後之死係萬貴妃所為，請求逮捕當時的太醫和萬氏眷屬曾出入宮禁者，究問紀太後的死因。還有的大臣借孝宗頭上一直有的禿疤想激怒孝宗，治萬貴妃家屬的罪。但孝宗僅據事實降了萬貴妃兄弟的職，降萬喜都督同知為指揮使，降萬通、萬達都指揮同知為副千戶。僅此而已，並未做過多處理。孝宗的孝悌觀念很強，他正是因為孝敬父母才被後人稱為“孝宗”的。孝宗下旨說，如果追究萬貴妃的罪過，就會違背先帝（明憲宗）的意願，他不能做不孝之事，對於有關萬貴妃的事情，也就不再追究與過問。
姓名：張氏
生卒年：不詳
婚配：明孝宗朱祐樘
封號：皇後
封後時間：公元1486年
公元1486年，太子朱祐樘已長大成人。昌國公的女兒張氏因姿色出眾、知書達理被選為太子妃。同年，孝宗即位，她也被冊封為皇後。
明孝宗和張氏的感情非常好，常常形影相隨，談笑風生，恩愛無比。他們倆人關係如此親密，除了張氏的溫柔體貼外，孝宗坎坷的身世也是一大原因。孝宗自幼生活在宮中險惡的環境裏，後妃們爾虞我詐的爭鬥，使他看透了世態炎涼，過早地成熟起來。他剛生下來，就因怕受到萬貴妃的迫害，而由太監張敏偷偷地藏在安樂堂內撫養，一直到五、六歲，還未起名宇，更不知自己的親生父親是誰。直到公元1475年，張敏才把真相告訴了憲宗，憲宗才將孝宗立為皇太子，並起名為朱祐樘。然而，他的生母紀氏馬上就被萬貴妃害死了。此後，一直到他長大登基，他始終是在提心吊膽中度日，他的感情沒有寄托，內心十分孤獨。所以，他登基後，和張氏互敬互愛。張氏了解了孝宗的身世，對孝宗更加體貼溫柔。她不僅親自照管皇上的起居飲食，還與皇上一起分擔國事憂愁，加上她本人聰慧伶俐、知書達理，二人的感情是越來越深，後宮裏的美女成群，但孝宗平生所愛始終隻有張氏一人。閑暇之時，他總願和張氏共同度過甜蜜的時光。在曆代皇帝中，像孝宗這樣對愛情專一是絕無僅有的。