為了解決無資料問題，朱輝領導技術人員從引進的蘇製K－13導彈著手，開始翻譯、消化隨產品引進的有限資料，並對產品進行測繪分析，整理出技術資料190餘份，對摸透設計思想、了解設計原理起了很好的作用，也為後來的自行設計奠定了理論基礎。為了解決無設備問題，初創時期建立了14 個簡易實驗室，購置通用儀器設備近1000 台，研製了非標設備近400台，基本能滿足當時導彈生產檢驗的需要，隨著霹靂3，霹靂5甲、乙，霹靂4甲、乙等型號相繼上馬，要求試驗逐漸由生產檢驗性轉向為自行研製服務，朱輝又領導科研人員摸索了許多新的試驗方法，設計了不少新的試驗設備。
朱輝深知作為一個研究所，發揮科技人員的積極性極其重要，盡管當時國家經濟困難，但他仍然想方設法，盡量給科研人員創造一個基本的工作、生活環境。廣大科技人員也深有感受，對朱輝十分敬佩。特別是朱輝常說的“是金子總會發光的”、“雪地裏埋不住珍珠”鼓勵科技人員的話，在職工中產生深刻影響，對發揮廣大科技工作者的積極性起了很大作用。
朱輝作風嚴謹，工作細致，嚴格要求，無論是科研計劃、機構設置、規章製度建立，還是實驗室的建設，他都要仔細審核。正因為這樣，有關人員要給朱輝彙報工作時，都會精心準備。也正是朱輝的表率作用，對研究所的作風建設發揮了重要作用。
在朱輝的領導下，到1967年底航空兵器設計研究所人員從成立時的200多人增加到1900多人，研究室從4個發展到11個，逐步籌建起有400多人的試製工廠和14個簡易實驗室。固定資產原值由成立時的7萬元增加到近1400萬元。參加了霹靂1、霹靂2空空導彈的仿製，進行了霹靂2A空空導彈的改進，組織了美製F－4B飛機火控係統和“麻雀”ⅢA空空導彈及“響尾蛇”1C空空導彈殘骸的測繪分析，開始了霹靂3、霹靂4、霹靂5等重要空空導彈型號的設計研製，開展了機載火控係統、航空火炮、機載雷達等的仿製和自行研製工作。通過仿製和自行研製，學習摸索出了一套科研、試驗、試製和外協等方麵的管理辦法，並製定了相應的管理製度。
1973年10月朱輝調往沈陽，任601 所革命委員會副主任、所長。1982 年離休，2001年10月去世。