從嚴治校
為了辦好學校，吳玉章堅持學校管理從嚴。他的這一思想，早在20世紀初就已形成。他認為，一所學校辦得好壞與否和是否嚴格管理有很大關係。學校培養人才的規格以及教學質量的高低，都與學校管理有密切的聯係。經過長時期的探索，吳玉章在學校管理上有以下幾條經驗：第一，他認為學校要有周密的計劃，進行科學管理。吳玉章認為，學校要培養符合時代要求的人才必須要有嚴密周到的計劃，因為計劃具有導向和督促的職能。辦學校如果沒有周密的計劃，就等於是沒有目的，學校是不會辦好的。在任人民大學校長期間，他要求每一專業都要有詳細計劃，包括某一門課由哪一位教師給哪一個班級在什麼時間地點上課的課程表，也要準確無誤地製定出來。同時，其他環節也要配合好，以保證教學有條不紊地進行。在這裏，他特別強調後勤保證的重要性。每年開學前，他總是帶上有關幹部到處檢查，教室是否整潔，燈光亮度夠不夠等，都要檢查到，從而保證按時開學，準時上課。
第二，他認為學校要有嚴格的組織紀律和管理製度。要製定必要的合理的規章製度，教育師生自覺遵守。吳玉章認為“嚴格管理學校的重要方麵就是強化紀律”。學校沒有紀律約束，就像一部機器鬆了螺絲一樣，運轉不靈，長期下去就會垮台。他還認為，學校就像一個樂隊，如果樂隊成員不按照樂譜演奏，不聽指揮，就無法奏出和諧優美的樂曲來。為了保證學校的正常秩序就得製定各種規章製度，約束各種無組織無紀律的行為。規章製度是從嚴治校的保證和措施，是賞罰嚴明的依據，是激勵教學的動力，是學校不可缺少的管理環節。
吳玉章在人民大學第一次學生大會上就規定，學生要按時上課，按時作息，不允許有任何自由散漫和無組織無紀律的現象發生。由於學校要求嚴格，獎懲分明，大家自覺遵守規章製度，學校辦得生動活潑，秩序井然，保證了教學計劃的順利實施。
吳玉章對幹部要求嚴格，對缺點錯誤從不放縱，有時甚至批評得很嚴厲。但他又很愛惜人才，愛護幹部，把人才當成辦學的寶貴財富。他總是抱著與人為善和“治病救人”的態度，熱情幫助，使人心悅誠服。他關心他人比關心自己為重，十分關心幹部的生活和健康狀況，親自去食堂檢查夥食質量，並規定醫生到教工宿舍進行巡診的製度。
他在耄耋之年，仍孜孜不倦地讀書和研究學問。他不但寫出了《人民教師必須學習馬克思列寧主義、毛澤東思想》、《為貫徹提高教育質量的方針而鬥爭》、《文字必須在一定條件下加以改革》等一批學術性文章外，還整理出版了《曆史文集》，寫出了《辛亥革命》、《從甲午戰爭到辛亥革命的回憶》等重要論著，為教育學和曆史學的研究開拓了新的道路，為我國文化寶庫留下了一份寶貴財富。