吳玉章作為教育家，從在日本留學時撰寫《勸遊學書》起，直到晚年任人民大學校長，他的革命活動無一不與教育連在一起。在社會變革的各個時期，他以教育為陣地，為革命培養了大批人才。新中國成立後吳玉章主要從事教育工作，他倡導理論聯係實際的學風，建立了比較完善的學校管理方法。
理論聯係實際
吳玉章強調高等教育必須要堅持理論聯係實際，反對機械搬用外國經驗。他特別重視教育的實際性，強調教育工作要與社會發展變革相適應。他把教育與實際相結合作為教育的一項基本原則。他認為教育結合實際，是切除時代弊端的良方，是促進社會進步的途徑。他提倡教育與實際相結合主要體現在兩個方麵：其一，根據時代的特點，采取多種形式為社會變革培養急需的人才；其二，在教育的過程中具體貫徹與實際相聯係的原則。在理論聯係實際方麵，吳玉章身體力行，努力實踐。中華人民共和國成立後，黨中央和中央人民政府國務院決定創辦中國人民大學，任命吳玉章為校長。黨中央為人民大學規定的教學方針是“理論與實踐相聯係，蘇聯經驗與中國情況相結合”，任務是為新中國培養各種建設人才。吳玉章遵循上述方針和任務，集新舊教育和中外教育之精華，從中國的實際情況出發，又考慮到國家建設的遠景和科學發展的趨勢，建立了以經濟管理為主的科係，以後增加了政治理論各係，最後增加了文史各係，使人民大學逐步形成了社會主義經濟建設所需要的、比較完備的專業教育體係，發展成為綜合性的社會科學大學。在學習蘇聯經驗方麵，建校之初，他曾提出要係統地全麵地學習蘇聯，反對狹隘的經驗主義，以便迅速建立各門課程的體係，適應教學的需要。後來，他發現學習蘇聯有生搬硬套的情況，課程內容結合中國實際情況不夠，又及時提出注意和克服教條主義的問題。同時，報請中央批準，各專業與有關業務部門和工礦企業對口掛鉤，並形成製度。結果，使人民大學的各門專業，逐步建立了中國化的課程體係，較好地適應了教學的需要。
強化師資建設
吳玉章一貫認為，一個學校辦得好壞，關鍵在於教員的素質。他在教育實踐中，總是把提高教育質量放在重要的位置。他認為學校是傳授知識的地方，不同於一般的公共文化場所和企業，必須建立一支高素質的教師隊伍，始終注意教師隊伍的建設。為了培養教師，他要求教育者應首先受教育。教師要學好馬列主義、毛澤東思想，努力提高政治覺悟，樹立為革命和建設而育人的觀點。同時要求教師刻苦鑽研，精通業務，以自己的淵博學識和高尚的品德，傳授並影響學生。
他在強調教師主導作用的同時，提倡尊師愛生，教學相長。一方麵他要求學生尊敬老師，向老師學習，學習他們的治學方法，吸取他們傳授的知識；另一方麵他要求教師也要尊重學生，向學生學習，而且教師還應當鼓勵學生超過自己，要讓學生青出於藍而勝於藍。師生要密切聯係，相互取長補短，共同提高。
為了培養教師，吳玉章常常親臨教學第一線，為師生們上課，以自己的實踐經驗來指導全盤教學工作。直到逝世前幾年，他還舉行辛亥革命、第一次大革命等講座，甚至還教漢語拚音方案。在吳玉章的帶動和培養下，人民大學逐步建立了一支質量較高，能夠勝任教學工作的教師隊伍，較好地完成了教學任務。