史濟美被特科懲處的消息驚動了國民黨中央。顧順章這次到上海，就是受國民黨特工總部委派調查這個案件的。當年的上海《大美晚報》於6月16日報道這個消息稱：“中央方麵據報後，以此案情節重大，即於昨晚派民訓會顧順章來滬調查一切，顧君業於今晨抵滬，曾於上午9時許往謁局長文鴻恩，旋複往謁吳（開先）市長。”
顧順章幫助國民黨調查史濟美被暗殺案的結局如何，目前還沒有史料幫助我們進一步了解具體情況，本書隻能暫付闕如。
據顧利群說：“顧順章在上海瞞著國民黨方麵秘密托付家人把一份藏匿起來的中共絕密文件加以銷毀。”顧利群還提供了細節：顧順章掃好墓離開上海之前，趁監視他的國民黨特務不在場，特地詢問張長庚和葉其蓁以前在南京交代他們到原居住的地方拿取他藏匿在那裏的中共秘密文件的事辦得如何。張長庚把他拿到藏匿著的文件交給顧順章，顧順章當場把文件全部燒毀。
企圖“另樹一幟”
顧順章是個有野心有抱負的人，自以為憑他從前在中共中的地位、背叛中共之後又為國民黨提供了許多很有價值的情報、幫他們培訓特務，一定能夠受到信任和重用。豈料自己這個願望沒有實現，反而被拘押、軟禁、監控，基本失去人身自由。他不由心懷不滿，滿腹怨恨，另有想法。此次上海之行，他曾秘密會見了在國民黨特工總部上海“行動區”當特務的共產黨自首變節分子，情不自禁地說了一番話。據曾在上海中共中央《紅旗》報秘密印刷廠工作過的叛黨分子、後隨顧順章當了特務的陳蔚如在《我的特務生涯》一書中講：顧順章詳細詢問了這些自首變節分子的生活工作情況後說：“共產黨固然不好，國民黨更壞，但共產黨的幹部都是比較好的，能吃苦耐勞，要革命。你們要耐心工作，我們好好利用這個調查機構來消滅共產黨的組織，另成立新共產黨組織。從現在起要注意聯係自首人，把他們團結在一起。”
“沒有不透風的牆。”徐恩曾等國民黨中統特務本來對中共叛徒是懷有戒心，不予信任的，這正如徐恩曾所說：“用其才，不信其德。”後來擔任國民黨軍統特務頭子的戴笠對中共叛徒亦是“用其才，戒其德。”當然戴笠比徐恩曾開明或高明，他對中共叛徒“可以給以高官，不可以給予要職”，但後者很少給中共叛徒以高官。這也許是軍統能超越中統後來居上的一個重要原因吧。顧順章在上海的這一番高論，不久便傳到徐恩曾的耳朵裏。徐恩曾對顧順章的戒心加重了，由此也對已叛變中共又對中共的機密欲吐又止，不幹不脆，成了階下囚有時還對他陰陽怪氣的顧順章感到非常不滿和惱火。
1933年6月下旬，徐恩曾為了敲山震虎和消除顧順章對叛徒們的影響，特地派他的心腹，調查科總幹事顧建中到上海，先後兩次在中統上海行動區總部和行動股召集特務訓話。顧建中警告說：“有的人野心不死，還在搞陰謀活動。凡是被誘惑的同誌，應該安心工作，特工總部不予追究。”
顧順章企圖另樹一幟，另組一個“共產黨”的想法是有可能的。因為他對國民黨在他叛變後的使用安排與他在中共的地位相比較，落差太大，使他大失所望。他又是一個有野心有抱負的人，不甘沉淪和寂寞。國民黨隊伍中存在著一大批中共變節分子，他們當中有的處境也和他相似，這些人可以作為他另樹一幟的基礎，為他所用。再說那時蔣介石正傾盡全力要“剿滅”共產黨，中共中央內部又出現了王明“左”傾錯誤領導，中國共產黨正處於艱難時期，顧順章想另外組建一個與中國共產黨唱對台戲的所謂“共產黨”，支持蔣介石以便自己撈取地位。蔡孟堅回憶錄《蔡孟堅傳真續集》中的一段話，能佐證顧順章確有另樹一幟的企圖。
蔡孟堅在他的回憶錄中提到：“那一年他因公到南京住在中央飯店，在玩撞球時正好遇到顧順章，顧順章一下子奔過去抓住他的手說：蔡先生，你是我的救命恩人，我建議由我組織新共產黨，將共產黨大員爭取過來，支持中央政府，請你出麵支持我……話未說完，就被監視他的特工人員拖走了。”
顧順章企圖另樹一幟給自己埋下了被殺的禍根。顧順章從上海回到南京後，徐恩曾加強了對他的監視。不久，為了便於監控顧，徐恩曾命令顧順章將家搬到安品街70號。當時，顧順章除了聽命去獄中或拘留地對被捕的中共知名人士進行勸降外幾乎無所事事。他原來的身份和他編寫的《特工叢書》引起了後來成為國民黨軍統頭子戴笠對他的興趣。