謝幕演出
這時候，在河南、天津、熱河等地，奉軍、直魯聯軍向國民軍發起了全麵攻擊，國民軍兵力不足，連連受挫，被迫緊縮戰線。
屋漏偏逢連夜雨，山西的閻錫山落井下石，背棄了與國民軍的密約，轉過來襲擊國民軍。國民軍不得不一邊打，一邊分頭向直、奉軍閥求和。
對國民軍一再拋來的橄欖枝，吳佩孚反應冷淡，堅持聯奉討馮，但他手下兩員大將靳雲鄂、田維勤卻主張聯馮討奉。國民軍看到了一線希望，便試圖通過這二人促使吳佩孚放棄往日仇怨，實現舊直係的大聯合，共同對付奉係。
然而，恨透了馮玉祥的吳佩孚始終不肯與國民軍謀和。國民軍努力尋求吳佩孚的諒解，大談釋放曹錕、恢複法統以迎合吳佩孚，這又讓段祺瑞如坐針氈，因為曹錕出來意味著他老段隻能走人了。於是段祺瑞隻好積極與奉係聯絡感情，希望借助奉係的支持維持執政府的地位，這就不可避免地要與國民軍反目。
段祺瑞暗中拉攏原吳光新舊部，後改編為國民一軍第九師的唐之道師，準備利用其力量逮捕鹿鍾麟，與奉軍裏應外合消滅北京城內的國民軍。鹿鍾麟得知計劃，決心先發製人抓捕段祺瑞，準備4月9日夜晚包圍執政府和吉兆胡同段祺瑞的住宅。豈料，這個消息又被鹿鍾麟的部下走漏給段祺瑞的舊部鄧漢祥。鄧漢祥急忙去見段祺瑞，勸他離開吉兆胡同避禍。性格剛直倔強的段祺瑞大為光火，堅決表示不離開。這時曾毓雋也得到要抓段祺瑞的消息，他立刻派執政府顧問日本人大穀猛坐著使館汽車送信給段祺瑞，段祺瑞這才感到事態嚴重。
由於大街上已經戒嚴，段祺瑞當晚在侍從武官衛興武的護送下到段的老同學、同住吉兆胡同的崔某家中住了一夜。為防止國民軍在附近搜查，曾毓雋等連夜發出號外，說段執政已經進入東交民巷桂樂第。鹿鍾麟看到號外後信以為真。夜裏大約九十點鍾前後，鹿鍾麟自己跑到桂樂第見到李思浩。李思浩對鹿鍾麟說：“執政已經休息，有事明天再來好嗎？”因為這是在租界，鹿鍾麟不敢亂來，隻好說： “我來沒有別的意思，不過是表示我對執政的關心和擁護。”
4月lO日，鹿鍾麟發布警衛司令部布告，宣布段祺瑞的罪狀，重點就是兩件事：金佛朗案和“三·一八”慘案。國民軍的舉動就好像又發動了一次北京政變，但吳佩孚對迎合他的這次政變態度冷淡，一直沒有停止對國民軍的攻擊。
4月11日早晨，段祺瑞才真到了桂樂第。進來之前，他特意派人從天津發出執政府、國務院的通電，說鹿鍾麟兵困政府，一切政務無法執行，這個時候以政府名義發出的文件、命令都無效。
同一天，吳佩孚發表談話，要求國民軍全部退出北京，才有議和的餘地；另外，他同時致電奉軍、直魯聯軍將領張學良、張宗昌，要他們按原計劃進攻國民軍。12日，吳本人的軍隊開到了長辛店、盧溝橋一帶後，他的口氣就更硬了，定要國民軍全部繳械。至此，國民軍謀和吳佩孚的希望徹底破滅。而張作霖因為國民軍此前密謀聯合直係對付奉係，對國民軍極為惱怒，因此進攻更加猛烈。
這時候，段祺瑞在桂樂第仍以執政身份處理公務，他親自給張作霖、吳佩孚、孫傳芳、閻錫山等人發電報，表達出希望各方仍推他主政的願望。他派曾毓雋到天津和吳光新碰麵，一道去見張學良。張學良表示奉天對維持現在政權沒有信心，隻能保護段執政安全離開北京。奉方態度如此，直係吳佩孚更是不客氣。至此，段祺瑞的一切努力落空，隻能走人。
4月20日下午2點，在張宗昌兩個營士兵的護送下，段祺瑞率其子段宏業以及親信、老友多人，乘張學良調派的一趟專列前往天津。在天津，段祺瑞通電全國，表示引退下野。為期一年零五個月的臨時執政府從此壽終正寢。
段祺瑞一生在宦海中幾度浮沉，但這一次沉落後，他再也沒能浮起來了。