直奉戰爭曆時兩個多月，以奉張大勝結束，直係主力被殲，直係軍閥自此由盛而衰。
就任執政，重掌權柄
隨著吳佩孚戰敗南下，直係勢力在北方覆滅。這一切都在段祺瑞的算計之中。他很高興地看到，自己聯奉反直的計劃終於獲得了成功，不禁為自己高明的算計得意不己。同時他也知道，自己政治生涯的第二個春天馬上就要到來了。不過，多年的曆練告訴他，不能高興得太早。
首先是計劃中的一些細節發生了變化。原計劃中奉軍是不能入關的，但是張作霖擊敗吳佩孚後，卻沒有遵守這一約定，直接將軍隊開到了天津附近。這是與馮玉祥原來的打算相反的，他的目的就在於取得華北直隸等地為地盤。現在奉軍大舉入關搶占地盤，就使得他的打算落空了，北方出現了奉係和國民軍兩大勢力對立的局麵，所以段祺瑞就不得不考慮奉係張作霖的態度了。對於馮玉祥邀請他為國民軍大元帥的電報，他也是東扯西拉，不說正題。另外，南方各地督軍們是個什麼態度他也吃不準，因此怕把自己陷於被動。
出乎馮玉祥預料的，北京政變後的局勢對他來說日趨惡化。張作霖非常討厭馮玉祥，他曾對人表示說： “馮玉祥替咱打仗，那是120萬小洋錢買的他，他不能主張國事。”奉係其他將領認為馮的野心又大，又會造作，是一個很難相處的人，但張氏父子和奉軍一般高級將領對段都很尊敬，把他看作是北洋元老中最有希望的人。所以，張作霖考慮要聯段製馮，他也宣布擁段做聯軍統帥，但考慮到孫中山的聲望，又於1924年10月30日致電孫中山，也請他北上。
馮玉祥在與張作霖、段祺瑞周旋之時，感到自己實力不足，迫切希望能拉到一支盟友，思前想後，隻有孫中山的思想與自己接近，於是在政變後，馮玉祥立即邀請孫中山北上共商大計。馮玉祥還順便幹了件大事：他派鹿鍾麟把溥儀驅逐出宮，廢除其帝號，並修改民國初年對清室的優待條件，算是“把皇帝統治的最後一點痕跡也鏟除了”。對此，段祺瑞很是不滿意，甚至拍電報去責備馮玉祥，馮玉祥知道段祺瑞不滿意他的行為，’但他卻不認同段祺瑞的思想，他曾經調侃說： “我把皇帝趕走，礙著你什麼事了？是不是段先生曾經當過前清的大臣，過去老給皇帝磕頭上了癮了？”段祺瑞對此不滿，可卻有人大聲喝彩，那就是號稱民主鬥士的孫中山，他堅持認為馮玉祥此舉算是斬草除根，將來看還有誰來複辟。
孫中山在11月4日分別回複張作霖、馮玉祥，同意即刻北上。段祺瑞本還在觀望南方各省的態度，得知孫中山要北上的消息，馬上緊張起來，電促馮玉祥、張作霖到天津開會，共商收拾時局的辦法，這就是“天津會議”。馮玉祥接到段電後未即啟程，準備等孫中山到津後再去，以免顯得人單勢薄。
但段卻派人到京催促，馮玉祥不得不在11月9日啟程赴天津。他是隻帶了副官、馬弁幾個人到天津的，張作霖卻是等到他的兩師人馬到津後，才和盧永祥一塊抵達天津（此時的盧永祥看到直係戰敗，便從日本回國，投奔了張作霖）。
到了天津，段祺瑞宴請張作霖、馮玉祥。為了將他們的關係拉近，便於自己以後執政時少一些麻煩，他特意將馮玉祥的功勞大大誇了一番。沒想到張作霖一下子站了起來，對他說： “我們起義是為了國家，這是當兵的分內之事。但起義和收買完全是兩回事，收買過來的人不能參與國家大事的討論。”說完，頭也不回地走了。
這話明顯是衝著馮玉祥來的，措手不及的馮玉祥非常尷尬，段祺瑞也沒想到張作霖這麼不給麵子。畢竟馮玉祥是自己一手拉過來的，他張作霖不認賬，老段可不能忘恩負義，於是馬上勸馮玉祥，好話說了一籮筐。會後又拉著馮玉祥去張作霖的下榻處拜會，張作霖礙於段祺瑞的麵子，不好講馮玉祥怎麼樣，隻好說了幾句場麵話，算是讓馮玉祥有了個台階下。