七、中宗軍政 獨委元忠
公元705年，太子李顯即位，是為唐中宗，恢複唐朝，改年號為神龍元年。沒幾天，重病的八十二歲的武則天逝世。唐中宗即位之日，即“驛召元忠，授衛尉卿、同中書門下三品”，即恢複元忠為宰相。十天後，又“遷兵部尚書，知政事如故”，意思是仍然是宰相。當時武則天已死，唐中宗做皇帝人稱“快活天子”，“多不視事，軍國大事，獨委元忠者數日”。不久，中宗又任命元忠為中書令（宰相），加授光祿大夫，累封齊國公，監修國史。神龍二年（706年），魏元忠與武三思、祝欽明等八人撰寫《則天皇後實錄》共二十卷，唐中宗稱善，賜元忠物千段，仍封其子衛王府諮議參軍魏升為任城縣男。景龍四年（710年），中宗任命元忠代唐休璟為尚書右仆射、兼中書令，仍知兵部尚書事，監修國史，獨攬軍政大權。此時的魏元忠，“當朝用事”，“特承寵榮”，在晚年達到了極點。但他也因不能自控作出了一件不應該的事，他請歸鄉拜掃祖先墓，中宗特賜錦袍一領、銀千兩、千騎四人充其左右，並下手敕：“衣錦晝遊，在乎茲日；散金敷惠，諒屬斯辰。”可是，元忠至鄉裏，卻把銀子私藏起來，沒有賑施。盡管如此，在他回京時，中宗本人還親自到白馬寺迎接慰勞，可見唐中宗對魏元忠給予多大的“恩遇”。
八、誅武三思 宰相喪子
在魏元忠生命的最後兩年，還經曆了幾件大事，首先就是誅殺了武三思而自己卻喪失了長子。唐中宗對元忠還是十分信任，遷為左仆射，“餘並如故”。而元忠嫉妒武三思專權，於是，在景龍三年（709年），他與節湣太子、左羽林大將軍李多祚等人起兵誅殺了武三思，接著太子率兵欲廢韋後為庶人，正遇上元忠的長子太仆卿魏升守宮門，元忠左右為難，結果，魏升被亂兵所殺喪命，七十歲的老宰相痛失長子。
九、終遭陷害 冤死涪陵
雖然唐中宗因為元忠“有平寇之功，又素為高宗、天後所禮遇”，因此，對他“不以升為累，委任如初”。但是，武三思的餘黨為給三思複仇，接連陷害元忠。先是三思餘黨兵部尚書宗楚客和侍中紀處納等人串通，誣告元忠及兒子魏升與太子“同謀構逆，請夷其三族”，中宗沒有答應。魏元忠很不自安，於是請求“致仕”回家，但中宗還是下旨，解除左仆射，但“以特進、齊國公致仕於家，仍朝朔望”。宗楚客等不甘心，又讓右衛郎將姚庭筠為禦史中丞，令他來彈劾元忠，中宗無可奈何，下令貶元忠為渠州司馬。宗楚客仍然不肯罷休，又先後讓侍中楊再思、中書令李嶠、給事中冉祖雍、禦史袁守一等人接連不斷地上奏告元忠，中宗隻好又改遷降元忠為思州務川尉。就這樣，景龍四年（710年），三朝老宰相魏元忠行至涪陵，悲憤而死，終年七十歲。唐中宗下詔，追贈元忠尚書左仆射、齊國公、本州刺史，仍令所司給靈輿送至鄉裏。唐睿宗李旦即位後，下詔元忠陪葬定陵。景雲三年（712年），又降製：“故左仆射、齊國公魏元忠，代協人望，時稱國良。曆事三朝，俱展誠效。晚年遷謫，頗非其罪。宜特還其子著作郎（魏）晃實封一百戶。”開元六年（718年）唐玄宗又降旨，給魏元忠“諡曰貞”。中宗、睿宗、玄宗三朝皇帝為魏元忠平反昭雪，給予了公平的評價。