在他寫的《精衛》一詩中可見表明其心誌：“我願平東海，身沉心不改。大海無平期，我心無絕時。”
英軍攻破鎮江後，大肆劫掠。所過之處繁華變為瓦礫，安樂變成驚恐，老百姓也組織起來反抗，一段時間內，翁心存一家所寄居的周圍村莊常常是槍聲大作，火光衝天，哭聲、喊聲、叫聲、槍聲響成一片，而翁家一門老小，都是沒有作戰能力的人，常常被嚇得瑟瑟發抖，婦女們手裏常握一把剪刀，準備到最後時刻自殺，兒童們則緊緊圍在大人周圍。萬幸的是，英軍沒有來他們居住的這個小地方。這些都在翁同和幼小的心靈裏留下了深深的烙印。
1842年8月，清政府與英軍簽訂了《南京條約》，英軍退出長江。九月，翁氏一家又回到了老家。但經過這次驚變之後，翁家大女兒、媳婦、母親相繼生病，不久，又相繼去世。翁氏一家一年之內，連遭三劫，彩衣堂一時間籠罩在極度痛苦的氣氛中。同和目睹此慘境，肝腸寸斷，終於害了一場大病。鴉片戰爭給同和帶來的種種災難，相信在他一生中永遠都不會忘記。翁同和的少年時代就是在這樣動蕩的時代中渡過的，戰爭、逃難接踵而來，目睹了種種家仇國恨，但無論到了什麼時候，父親都對他進行諄諄教誨，引導他向愛國誌士，抗侮英雄學習，這些，無疑對翁同和以後的政治生活奠定了一個良好的基礎。
初為帝師
1845年，翁同和在蘇州應試中名列第三，七月，叔侄二人一同參加院試，雙雙考中秀才，這年，二人都已16歲。之後，翁心存受聘並接任紫陽書院掌院，同和又以第四名的成績入選蘇州紫陽書院，再次成為父親的親授弟子。
紫陽書院之名由紫陽夫子竹溪而得名。它的辦學宗旨是“勿務華而離其實，亦求精而入於虛。”紫陽書院在規模和實力上都比翁心存以前任職的遊文書院大得多了，尤其是它的掌院幾乎無一例外是當時飲譽海內的著名學者。如錢大昕、吳省蘭、俞樾、俞正燮、李兆洛、馮桂芬、劉熙載等。他們主張通經致用，而不隻注重考據科學。如馮桂芬“黜華崇實，去惑存真”，劉熙載主張“所貴於學求盡道”，等等，這些學說與主張，對於翁同和等這些年輕的才子影響巨大。他們也不再是隻讀聖賢書，而是對國事非常關心，“風聲、雨聲、讀書聲、聲聲人耳，家事、國事、天下事、事事關心。”
翁心存在戶部任職時，對官場中司空見慣的腐敗行為是深惡痛絕，他個性耿直，由此為官多年兩袖清風，享有“天下仰真品德”“廉正傳於四海”的美名。
鹹豐十年，1860年，翁心存位高權重，終於由宦海的浪尖被迫卷入到海底。三月的一天，被革職留任，後官複原職。哥哥同書也是幾次蒙獄，同和為營救父親和兄長整日奔走。
翁心存後又幾經起伏，等再次授讀小皇帝同治時，已是年逾古稀，體弱多病了，但為了能夠早日開脫長子同書的冤情，為了能夠博得兩宮太後的歡心，他仍然是強支病體，授讀格外認真。這年的12月26日，心存的身體已經一日不如一日了，突然兩宮太後下了一道懿旨，恩準他的長子同書暫時回到心存的身邊。等他到家時，這位帝師已經氣若遊絲了，他聽說兒子回來了，勉強睜開雙眼，看見長子同書站在自己麵前，他不禁心底有一些安慰，翁同書是雙膝跪地，淚流不止。就在這天晚上，心存闔然長逝。後同書被貶往甘肅，求功心切，繁重的戰事與複雜的鬥爭終於拖垮了這位曾經立過赫赫戰功的武將，不久也撒手人寰，後被追諡“文勤”。同和滿懷悲痛，仔細為他修訂了年譜，並且盡心栽培侄兒。
鑒於父親在弘德殿平素的聲名，而且兩宮太後又特別關注小皇帝的學習，加之聽說同和是鹹豐六年的狀元，待人平和，處事公允，家學淵源極厚，於是兩宮太後特意傳旨，讓翁同和在弘德殿行走。
下詔第二天，翁同和就在醇親王的帶領下入宮晉見兩宮太後。養心殿中慈安、慈禧兩位太後正襟危坐，小皇帝坐在兩太後前的禦榻上。翁同和進殿後即刻叩頭請安。
兩位太後仔細端詳翁同和後慈安太後首先問道：“下跪可是大學士翁心存之子翁同和麼？”翁同和一聽皇後提到了剛剛去世不久的父親，心中一熱，答道：“正是。”
憑著感覺，他知道二位太後對往日盡心盡力輔導同治帝的事跡甚為滿意，不禁心潮澎湃，緊接著說道：“謝皇上賜諡‘文端’。”接著，慈安太後又問到了翁氏家族中在朝為官的翁同書（翁同和的哥哥）和翁曾源（翁同和的侄子）。慈禧太後發話了：“真是父子三翰林，叔侄雙狀元啊！”翁同和趕忙道：“謝太後！太後過獎，愧不敢當！”慈安太後也滿意地點了點頭說道：“翁家父子學問好。這次請你來，主要是想讓你教導皇上。”翁同和叩謝：“謝太後隆恩。臣雖才疏學淺，但蒙皇恩浩蕩，臣定當殫精竭慮、肝腦塗地以報天恩！”