在平複尉遲迥的叛亂中，高熲展現了他的軍事才能。
前麵說到楊堅獨攬大權後，遭到了許多人的反對。其中首先公然起兵造反的是尉遲迥、司馬消難、王謙等人，也尾隨其後。一時間天下騷動，大有山雨欲來風滿樓的架勢，形勢十分危急。楊堅派韋孝寬率軍迎敵，不料因為部將們有異心，軍心動搖，沒有人向前奮勇殺敵。楊堅想派一位既忠心耿耿，又具備軍事才能、有魄力的人去做監軍來穩定局勢。他先後挑選了崔仲方、鄭譯、劉訪，不料這三人因為沒有達到個人目的，對楊堅憤憤不平，以種種理由拒絕出麵。這時恰好一位叫作李德林的大臣在分析了情況後，認為應該派一個既是心腹，又明於事理，而且能夠隨機應變，向來為大家所信服的人趕赴軍中，觀察形勢，探察內情。這樣即使有人圖謀不軌，也不敢輕舉妄動。誰才是李德林說的這樣的人呢，楊堅馬上就想到了高熲。高熲見到這樣情形，便自告奮勇，願意擔當這樣的重任。他當即銜命出發，連家都不回去，隻是派人向他的母親告別。高熲到達軍中後，果然軍心穩定士氣大振，形勢迅速改觀。韋孝寬的軍隊停頓在沁水（今沁河，在山西省東南部）的西邊，向敵人袒露出一種膽怯、觀望的架勢。高熲則命令造橋渡河，表現出一種進攻的態勢。他估計到敵人一定會從上遊放火燒橋，就提前做好防備。當敵人駕駛大伐企圖放火的時候，高熲早就在水中放置了“木狗”，使得敵人無法前進，隻好放棄了原計劃。當大軍渡河後，他又沿用古人破釜沉舟、背水列陣的故事，燒掉新造的橋，以示決一死戰來鼓舞士氣。隨後大軍快速地深入敵境，高熲與宇文忻、李詢共同商討，設定計策攻破敵軍。當時尉遲迥據守在鄴城（今河北省臨縣境，漳水之南），軍威尚盛，士氣高漲，如果這時進攻，就是硬碰硬，即便打贏了，也會損失許多人馬。那時，兩軍對陣打仗，旁邊往往有許多老百姓觀看。高熲便讓宇文忻揮軍攻入旁觀者人群，引起人群大亂。宇文忻乘機大呼：“敵人打敗了！”於是尉遲迥軍大亂，高熲、宇文忻等人乘勢輕而易舉地攻入了鄴城。在這次平複尉遲迥的戰鬥中，高熲憑借出色的軍事才能，迅速扭轉形勢，反敗為勝，為隋朝的穩定立下了大功。
高熲這種“天生的突出才能”在當時是有目共睹的，史書中也多次提到。《北史》卷72這樣評價他：“高熲有文武大略，明達政務。”文帝時的貝州刺史裴肅也曾經派使者給文帝上書說：“高熲因為天生的突出才能，又是開國元勳，佐命為大臣，受到人們的妒忌以至於被廢黜不用。希望陛下記著高熲的大功，忘掉他的小過。”
（《資治通鑒》卷179）薛道衡甚至因為讚賞高熲的才能而獲罪。前麵提到高熲製定新的律令，並且及時實施，收到了很好效果。到了隋煬帝的時候，新的律令卻總不能落實，薛道衡看到了，這直截了當地說：“假使當初高頻不死，新律令早就會決定下來，而且頒布實行了。”
因此得罪了煬帝，被勒死了。
忠心耿耿輔佐兩代君主
高熲是一個有天生的突出才能的人，受到大家的敬重，他的忠心更是讓人擁戴。高熲當朝執政將近二十年，朝野上下都非常敬重他，對他沒有異議。國家的富庶，是高熲努力的結果。他被殺，天下沒有不傷感的（《資治通鑒》）。他盡心盡力輔佐了文帝楊堅、煬帝楊廣兩代君主。