十月，南京皇城宮殿改建完工。
明太祖洪武十一年（1378年） 五十一歲
正月，下詔改南京為京師，罷北京，仍稱開封府；封立第二批皇子為蕃王。
三月，令吏部考核入京朝覲之布政使和知府等官員。
四月，北元皇帝愛猷識裏達臘病死，脫古思帖木兒即位。
十一月，令沐英、王弼率軍討伐西番的叛亂。
明太祖洪武十二年（1379年） 五十二歲
二月，令李文忠前往河州、岷、臨洮、鞏昌等地督辦防務。
七月，令李文忠掌大都督府事。
九月，沐英大破西番叛逆；占城使者入貢，中書省未及時奏報，朱元璋“盡囚諸臣，窮詰主者”。
十二月，汪廣洋坐事貶海南，旋又賜死。
明太祖洪武十三年（1380年） 五十三歲
正月，胡惟庸、塗節大臣等以“謀反”罪被殺，“胡惟庸黨案”發，罷中書省，廢丞相，提高六部官秩；改大都督府為中、前、後、左、右五軍都督府；詔令設置軍器局。
二月，詔令郡縣舉薦聰明正直、孝弟力田、賢良方正、文學之士及精通術數者入京授官。
三月，沐英進軍亦集乃路，擒獲故元國公脫火赤；燕王朱棣就藩北平。
四月，下詔蠲免全國田租。
五月，下詔罷禦史台。六月，置課院官，當年複革除。
九月，置“四輔官”；宋濂因其長孫坐“胡黨”罪株連下獄；朱亮祖父子坐罪被鞭死。
十二月，各地薦舉人才至京八百六十餘人，被授予各種官職。
明太祖洪武十四年（1381年） 五十四歲
是年，全國統計共有一千零六十五萬四千三百六十二戶，人口五千九百八十七萬三千三百零五人；全國官、民田共計三百六十六萬七千七百一十五頃四十九畝。
正月，令全國郡縣編製賦役黃冊；令新授官員薦舉人才。
二月，下詔核實全國官田。
四月，徐達、傅友德、沐英等攻下全寧。
五月，宋濂於貶謫茂州的途中自縊於夔州。
九月，設置中都留守司；令傅友德為征南將軍，藍玉、沐英為左、右副將軍，率師征伐雲南。
十月，詔令禁止瀕海民私通海外諸國。
十一月，趙庸率部鎮壓廣東曹真等起義。
十二月，傅友德大敗元兵於白石江，隨即攻克曲靖。
明太祖洪武十五年（1382年） 五十五歲
正月，元梁王把匝刺瓦爾密在普寧自殺，藍玉、沐英攻克昆明；朝廷設置貴州都司；趙庸鎮壓東莞縣民起義。
二月，朝廷設置雲南都司和雲南布政司。
閏二月，藍玉、沐英攻克大理，設置平緬宣慰使司，以土酋思倫發為宣慰使，
四月，設置僧錄司、道錄司；設置錦衣衛；定全國學田之製。
五月，新建國子監完工。
七月，詔罷“四輔官”。
八月，恢複科舉取士，三年一次，以為定製；馬皇後卒。
十月，設置都察院；趙庸鎮壓廣東“鏟平王”起義。
十一月，設置“殿閣大學士”。
明太祖洪武十六年（1383年） 五十六歲
是年，為朝貢諸國頒發勘合，自此實行朝貢勘合製。
三月，召征南師還京，留下沐英鎮守雲南。
明太祖洪武十七年（1384年） 五十七歲
正月，令湯和“巡視閩浙城池”，防禦倭寇。
二月，貴州宣慰使奢香率土官入朝，朱元璋令其開辟驛道。
三月，李文忠“暴卒”；下詔大赦天下。
七月，下令禁止內官幹預外事，敕令外朝諸司不得與內監發生公文往來。
八月，黃河開封段決堤，蠲免河南諸省逋賦。
十二月，蠲免雲南省逋賦。
明太祖洪武十八年（1385年） 五十八歲
正月，在藏區置俺不羅行都司。
二月，魏國公徐達病死。
三月，“郭桓案”發，中央六部及各布政司官員牽連被殺者達數萬人。
六月，下令各府、州、縣主官三年入京朝覲一次。
七月，五開蠻夷首領吳麵兒作亂，命湯和、周興會同楚王前往平叛。
十月，《禦製大誥》成書，頒示天下；明軍攻破古州，吳麵兒起義失敗。
十二月，百夷首領思倫發反叛，沐英率軍征討。
明太祖洪武十九年（1386年） 五十九歲
是年，令戶部核查全國田畝。
正月，令湯和與方國珍之侄方鳴謙備倭海上。
三月，《禦製大誥續編》書成，頒示全國。
四月，詔令實行工匠輪班製。
六月，詔令有司撫恤慰問全國老者。
十月，林賢案發，遂與日本斷交。
十二月，《禦製大誥三編》書成，頒示全國。
明太祖洪武二十年（1387年） 六十歲
是年，完成全國田畝核查和魚鱗圖冊的編製。
正月，令馮勝為征虜大將軍，傅友德、藍玉為副，征伐北元遼陽行省左丞納哈出。
四月，令周德興築福建瀕海城池，備邊防倭。
六月，馮勝統兵越過金山，迫降納哈出。
閏六月，馮勝還師，濮英率三千精騎殿後，遭遇伏擊，三千明軍全部戰死，濮英被俘，自殺殉國。
七月，下詔奪馮勝大將軍印，命藍玉代之，召馮勝還京。
九月，詔令藍玉為征虜大將軍，唐勝宗、郭英為副，北征蒙古；置大寧都司。
十月，將馮勝罷官安置中都鳳陽。
十二月，《禦製大誥武臣》書成，頒示全國。
洪武二十一年（1388年） 六十一歲
正月，改大寧都司為北平行都司。
三月，沐英擊敗百夷酋長思倫發。
四月，藍玉在捕魚兒海擊敗北元皇帝脫古思帖木兒，後者西逃，俘獲數萬人。