在托萊德、巴裏阿多裏德，在塞維利亞，神父們都給送上了柴堆。這其中有奧古斯丁·德·加查拉，皇帝和國王的欽定傳教士。這一例外的審判的確很具震懾力，令不少領主都感到後怕。還有保羅·奧拉維德斯，雖然他貴為塞維利亞的市長，也照樣被燒死了，我們在下文中還將有所涉及。
在國王的直接命令下，西班牙的宗教裁判所不僅可以審判異端邪說，同樣可以審判所有“違背常理”的罪行，比如說犯貓褻罪的、誘奸罪的——不管他是不是神父，可以審判強奸犯、褻續神明者、教堂的小偷、高利貸者、殺人犯，甚至是叛亂者，當然，還有巫師和煉金術士。
西班牙宗教裁判所的最高領導者稱為大所長，接下來是最高委員會成員和領主，執行一種高等監察的職責，再下來是稅製長官，亦即宗教裁判所訴訟人，有四十五位，負責在王國各地提起訴訟。新世界殖民軍把成千上萬的土著人送上了柴難，而如果願意皈依者則可判處絞刑。
西班牙宗教裁判所的第一個大所長是多明我會的托瑪斯·托克馬達，非常險惡地主持了十四年的聖殿儀式，可謂是恪守職責，僅於1487年3月10日在托萊德舉行的火刑判決儀式上就將一百二十人送給了世俗法庭。比較合理的估計認為他總共把八千多人送上了柴難，此外，他還將九萬四千人處以其他的刑罰致死。
對於現代曆史學家來說，這些數字似乎有些言過其實了，但是他們也認為，托克馬達至少燒死了三千人。
他的確結下了深仇大恨，於是不得不三赴羅馬，在教皇麵前替自己辯解。一路上，西班牙的國王派了五十名騎兵組成的騎兵隊和兩百個步兵保護他。也正是他，1492年奉費爾迪南和伊莎貝爾之命將猶太人驅逐出西班牙。
西班牙的宗教裁判所實在是太可怕了，以至於陸續遭到了教皇們的反對，西克斯特四世、保羅三世、保羅四世、皮耶九世、格雷瓜爾八世、亞曆山大六世都對此表示了極大的憤慨，1519年，雷翁十世甚至將托萊德的宗教裁判所逐出教會。但是這些宗教裁判所一直得到國王的支持，所以依然得以在教皇反對的情況下繼續存在下去。
某些“克馬德羅斯”——西班牙語裏這樣稱呼燒死異端分子的地方，不用柴火而是用爐子，有點像墨西哥用於對付印第安人的東西。塞維利亞的“克馬德羅斯”有四個爐子，形似中空的斷頭台，用石和磚砌成，每個爐子上都豎著一座雕像，是《聖經》裏的四個預言家，也是中空的。把犯人塞進中空的雕像後，再在斷頭台裏點上火，“這樣犯人可以緩慢燃燒致死，非常可怕”。
17世紀的查爾斯二世則很鍾情於老式的焚燒法。他本人經常出席火刑。為了取悅於這位王儲，宗教裁判所發明出了“皇家柴堆”，披金掛銀，並輔之以緞帶和花環裝飾，排場相當大，最後仍然付之一炬。
還有18世紀，即便在這個時代也不能堅持“新觀念”。保羅·奧拉維德斯，博學多才，周遊列國，算得上是那個時代最有教養的人之一，被任命為塞維利亞的市長。宗教裁判所想對他下手，果然還是得逞了，罪名是他與外國的伏爾泰、盧梭等大思想家頻繁接觸。該訴訟案指控他犯有“形式異端”的罪，證據就是他的一幅刻有維納斯和丘比特的銅版畫。他於1750年前後被燒死。
雖然在18世紀，宗教裁判所已經不再具有多少權力了，但是一直到1808年，法國才暫時取消了這種陰暗的製度。但是到1814年，它竟然又死灰複燃，直到六年以後，才得以徹底銷聲匿跡。民間傳說宗教裁判所燃起的柴堆是漫漫黑夜裏的西班牙推一的光明。zhan有西班牙聖殿所有資料的曆史學家洛朗特肯定道，這類法庭在行使其職責的三個世紀的時間裏，僅在西班牙一國就處死了三萬兩千餘人。
英國沒有宗教裁判所，斯拉夫國家也一樣，於是異端邪說盛行一時。事實上，說“教會分裂”顯然比“異端邪說’更確切一些。
亨利八世脫離了羅馬教會，因為他沒能從教皇手上得到能夠證明他和卡特琳·達拉貢婚姻無效的聖諭，他要娶安娜·波倫為妻。他宣布自己為英國教會“惟一的至高無上的首領”。於是這一回，輪到天主教徒罹受火刑的折磨了。
“在亨利八世統治期間，”《英國改革史》一書的作者高爾貝特寫道，“王宮實際上變成了真正的人肉店。”後來天主教徒在蘇格蘭燒死了幾大車的改革派教徒，以此為報複。同樣的，在亨利八世之女瑪麗·教多爾統治時期，她又重新恢複了天主教的地位，這回輪到新教教徒上柴堆了。