次年，發生了一件更為驚駭的大事。
侯生盧生二人，被人引薦進入鹹陽宮後，以其高超的見（忽）解（悠），為始皇帝所重。始皇帝除了經常麵對麵請教仙道之外，還屢屢表現出求藥之意願。二生在無可奈何之下，向始皇帝提出了許多物質上的要求，並保證一年成丹，可令人舉霞飛升。
至今時間已不足三月，二生心急如焚。恰在此時，始皇帝因身邊有人泄露其言語給丞相李斯，大怒，將當日在場諸人盡數處死。
二人更是惶恐，知曉若是屆時不能拿出仙藥，或者仙藥不具備當初承諾之功效，二人必死無疑。遂相商逃離。
侯盧二生得始皇帝重視，出入禁宮並無阻礙，且輕易而得通行天下之文牒，逃走不難。然而，二生酸腐虛偽，為表示不是自己煉不出仙藥，就在鹹陽城中以重金串連一些不得誌的方士，散布始皇帝虛偽不德、以刑殺為威、貪戀權勢諸語，言其德“未可為求仙藥”。侯盧二生一夜騰達為眾方士所知，被這些方士視為得寵的不二法門，許多人一直留在鹹陽中碰運氣，但長期未能得到好處，早對始皇帝有了怨言，於是受二生重金，在相約時間散布流言。
侯盧二生走後，始皇帝命禦史追係二人。待流言傳開，始皇大怒。
“朕原本用心厚待，未想此二人如此腹黑，誹謗於我。我雖求仙，但徐市費厚而效薄，我何時曾責於爾等？今誹謗於我，示我無德，孰不可忍。”
始皇命禦史將傳出流言的諸生係案而問，經審訊，共有460人與此流言有關，經廷尉再審無誤，始皇帝令將460人皆坑殺於鹹陽。
離軒在案問眾生後，即向始皇帝報告此事，建議隻殺受侯盧二生重金之數人，其餘人等不再追究。始皇不許。
離軒告知扶蘇，扶蘇急諫始皇：“如今天下初定，還需以德取信於民，諸生雖妖言以亂黔首，但畢竟以孔門自居，若全殺了，恐遭天下非議。”
始皇大笑道：“朕之功過德行，何需天下議之。汝不必多言。”
扶蘇道：“陛下三思，若盡殺諸生於鹹陽，豈非為侯盧二生指陛下無德證之？”
這是直指始皇此舉無德了，始皇大怒，拂袖讓扶蘇退下。次日下旨，令扶蘇至西北蒙恬軍中監軍。
離軒為扶蘇送行，見扶蘇憂心忡忡，知曉扶蘇至孝，為自己觸怒始皇而憂，勸慰道：“陛下使公子監軍，雖是遠離朝廷，實是對公子厚愛，並未不滿於公子，勿須憂心。”
扶蘇不解，離軒道：“蒙恬三十萬邊軍，乃大秦精銳之師，尤甚於趙佗六十萬大軍。公子未有從軍之履曆，陛下此舉，乃是令公子掌控大秦精銳，以利於日後……”始皇尚在人世，離軒不便明指，此為大逆不道，是以及時住口。
不過，扶蘇聽懂了其言，知曉始皇並未真正對自己不滿，稍稍心安，一路北上。未料此去兩人竟成永別。
連續兩年間發生的這兩件大事，史上合稱焚書坑儒。