由於時間久遠，加上大量神話的色彩，就如中國的三皇五帝一般，我們難以斷定世上是否真的存在過神武天皇這號人物。因此如何解讀“記紀”兩書關於這位開國天皇的描述便成為解答這號人物的關鍵。
神武即位的“辛酉年”，在中國史書上即有“辛酉革命”的讖緯之說，因此即位時間很可能是後人逆推出來的，可信度不高。“神日本磐餘彥尊”為和式的諡號，“神武”則是漢式的諡號，和諡為故有諡號，漢諡則為後世所追贈。至少『古事記』纂成之時，尚未出現漢風諡號。據『釋日本紀』，神武帝以下古代天皇之諡號，為漢學者淡海三船所定。然不知此說之立論證據從何而來。此外，“若禦毛沼命”這名字又帶有五榖神的意義，而橿原乃至大和一帶自古便是重要的穀倉，且此處關於盤餘彥的傳說也十分之多。很有可能這些故事和在一起，便構成神武這傳奇性的開國天皇。
另外，衛挺生“神武天皇開國考”指出神武天皇就是秦朝時被秦始皇派遣尋找長生不老藥的方士徐福，他和數千個童男女隨從在到達日本之後一去不返，徐福更成為後來的神武天皇（日本現有的徐福墓是即附會此一說法而立）。但這種說法無論在時間點上，考古學上都站不住腳，並不為多數研究者所接受。在考古研究中，結合出土文物與“欠史八代”，又提出神武即是崇神天皇的訛傳，其與後來的八代天皇不過是皇室為拉長存在曆史而創造出來的產物之說。在證明這九代天皇存在之前，這種說法不失為一種看來合理的說法。當然，如果不考究故事有多少可信度，我們可以將東征的故事看成大和政權由九州向東推至大和的過程縮影。
明治之後，由於皇權大興，對神武事跡的時間考證也逐漸熱絡：那柯通世提出以前660年為開國之年的說法，之後而衍伸出紀元節這種假想的開國之日。此外，1889年年日本政府在據說他建國地的奈良縣橿原市重建橿原神宮。
這位君主認為當時所傳的史實誤謬頗多，真實的情形常常過了一段時期之後，便走了樣，必須製訂正史。他於是命令了一位二十八歲有照相板記憶力的稗田阿禮，根據史料《帝紀》、《舊辭》等，重加整理，去偽留真，來製訂一部正史，以傳後世。但是經過三十餘年後，稗田阿禮並沒有能完成他修史的大業，而阿禮已經老邁不堪，到了元明女帝時代，不能不另外敕諭一位文筆非常秀麗的太朝臣──安萬侶，來幫忙阿禮共同續寫那未完成的著作，這就是所謂的《古事記》（公曆712年完成）。在古事記之外，天武天皇還創立了一所曆史編纂館，任命了一大批編纂委員，要他們仿效中國的《史記》、《漢書》的纂寫方式，廣搜數據成為一部完備的國家紀錄。
經過整整四十年的工夫，這部巨作完成了，就是現今還流傳的用漢文寫下來的《日本書紀》，公曆720年完成，共三十卷，一、二兩卷是神話，第三卷是日本正史的開始──《神武紀》。《神武紀》是神武天皇本紀，其中最重要的描述，是東征的一役，雖然很像是一篇神話，但敘述的行蹤忽東忽西、忽行忽止，尤其他在不同地區留滯的期間忽長忽短，不像是故意的虛構。據衛博士的考證，根據《神武紀》的記載：一、“可確知神武天皇不生長於日本，乃乘天盤船自高天原飛降者。天盤船謂航海之樓船。‘飛降’謂操縱風帆而來，‘高天原’乃指海外之一地而言。”二、當時日本文化的程度，停留在繩文文化時代，並沒有任何衝擊，能使日本忽然飛躍到青銅的彌生文化。據衛博士的研究：“近年，自築紫至遠賀川口，出土青銅器時代之刀劍戈矛鎔範甚多，與《神武紀》所雲，居‘吉備’數年以蓄兵食之語相應，‘兵’即兵器。神武東征途中先折而西行，停駐遠賀川口多日，因其地為其兵器製造區，故親往視察製造情形，從已出土之兵器而言，其形式與先秦之大陸中原之刀劍戈矛無異，可見神武兵工之技工來自大陸。日本產銅之各地，多在伊豫安藝以東，而當日製造兵器之場所，反集中九州島的西北，去礦場甚遠，顯然當時日本銅礦尚未被發現，不得已乃自大陸齊楚沿海運銅入倭，銅礦笨重，故將其冶鑄集中於日本去齊楚海岸最近之港灣，因而自唐津以至岡田皆成其冶鑄之工業區。”以上說明了神武東征武器的來源。神武是誰呢？衛博士肯定地說，他必然是徐福。
徐福到了日本之後，為了避免秦始皇的追蹤、偵訪，甚至於討伐，他利用了語言的隔閡來保持他的秘密。他禁用當時通用的中國語言，甚至采用了秦始皇的愚民政策，認為人民有了知識之後，便會興風作浪，“以古而非今”了。文字是罪魁，是知識思想最可怕的媒體，所以他根本廢棄了文字，在文字還沒有流布很廣的時候，便扼殺了它。那時其手下還有幾千名由齊楚各地征調而來的童男女，他不授以中國文化，反而讓他們倭化。這時大局已平定，他這批青年戰友，一個個也已長大成人，便讓他們和當地土著男女婚配，創立家業，斷絕他們思鄉的念頭。他為了示範，娶了原始居民木族中的賀茂氏的女兒──媛蹈韝五十鈴媛為正妃，翌年並立她為皇後。他自己在辛酉年即位於橿原宮，稱帝了。以上是衛博士根據《神武紀》，再考證了我國各書類中有關徐福的記載而推斷的，合情合理。顯然的，神武確有其人，確有其事，唯獨有一點不能符合的是神武即位之年。照《神武紀》中明確的記為辛酉之年，為紀元前660年，約當春秋齊桓公葵丘之會一匡天下的時候，距離徐福之生，四百有餘年，所以徐福似乎不可能就是神武。不過神武時代，日本根本尚未紀年。