2004年，莉莉進入校級管理層，出任新國大分管教育的副教務長。從2004年1月至2007年11月，她負責管理新國大的注冊辦公室、招收處、學務辦、教育發展中心和教育技術中心的各種事務，同時協助教務長製訂教育發展方向和戰略政策，確保新國大一如既往地保持高端學術標準和優良教育質量。2012年10月，她出任新國大主管學術與人事工作的副教務長，負責聘用和培養教學研究人員，合理配置學校資源。
對於她所從事的教學管理工作，莉莉謙和而又客觀地評價道：“我一直勤奮工作，幫助我校在教育事宜至人事工作多個領域建章立製，無論他們了解與否，這其中有很多規章製度影響了我們全體同人和所有學生的生活。”
在對外聯絡和國際化戰略合作方麵，莉莉於2007年10月至2013年11月擔任新國大副校長，主管“大學與環球關係”事務。莉莉熟知新國大成立一個世紀以來一直是新加坡最為優秀的綜合性大學，並深為母校取得的成就而自豪。然而她更充分意識到進入21世紀以來，伴隨著日益加速的全球化進程，新國大不得不麵臨國內、國外同行的雙重競爭。在她看來，與其被動守成，不如積極主動地應對挑戰，借鑒和學習國外高校的成功經驗，尋找環球戰略合作夥伴，以繼續保持新國大的優勢地位。在任期間，她領導國際關係辦公室和合作關係辦公室的同事們製定了多個國際化戰略項目，並在全校推廣實施，借此引導該校在戰略發展進程中成為全球領先的高等學府。她說：“我從事行政工作多年，為眾多項目作出了自己的貢獻。記憶最深刻的是我為籌建新加坡第一所與耶魯大學合辦的人文藝術學院所作出的開創性努力。盡管耶魯-新加坡國立大學學院還沒有完全建成並開始運轉，但是看到我五年的辛勤勞動產生了結果——這所求學機構即將迎來聰明的年輕學子——還是令人十分愉悅的。”
莉莉最引以為豪的耶魯——新加坡國立大學學院是亞洲首個仿照美國高等院校的人文學科教育體係而開設的人文教育學院，旨在為社會培養極具潛能的領導人才和高素質的世界公民。它也是耶魯大學在美國本土之外設立的首個亞洲分院。耶魯大學校長理查德·萊文認為，之所以選擇在新加坡設立該院，是“我們希望建立一種令人興奮、很多亞洲國家都感興趣的模式，因為它在解決全球複雜問題上有寬廣的視野”。
就新加坡國立大學而言，成立耶魯新加坡國立大學學院的動因始自2007年，新加坡國際學術谘詢團首次建議國家通過與耶魯等國際知名學府的合作，建立人文學院，培養高素質的畢業生。作為新國大的校方代表，莉莉受邀出席國際學術谘詢團的記者招待會並作發言，她希望該學院的成立能在亞洲乃至全球的人文教育創新中起到催化劑的作用：“我相信谘詢團意識到，成立人文學院，將使本地高等教育更為多元，對新加坡而言，這是具有戰略意義的。”此後，耶魯新加坡國立大學學院的籌備組建成為莉莉工作的重中之重。從學院的辦學模式、合作方的選擇、經費預算、課程開發、教職人員的聘用、向潛在學生的推廣策略……事無巨細，莉莉殫精竭慮，認真細致地處理好每件事務。曾經一度，新國大校方高管對耶魯新加坡國立大學學院的辦學模式意見不一，同時還對校址選擇猶豫不決。為此，2010年，莉莉帶領工作組前往美國，實地考察了耶魯大學等多所高等院校，經過反複思量，向時任校長施春風提交了考察報告，指出最適合新國大的國際辦學模式是與一所規模較大的研究型名校合作。同時建議在新國大的校址之外成立一所獨立的人文學院，為學生提供全寄宿製教學環境，方便學生與同學、授課老師、教授共同學習。
2011年4月耶魯-新加坡國立大學學院啟動儀式正式開始，新加坡總理李顯龍出席啟動儀式並發表講話，希望“耶魯新加坡國立大學學院能給予新加坡的高水平學生另外一種選擇，讓他們得以在國內而非遠赴國外攻讀學位”。2011年11月至2012年6月，莉莉除了繼續擔任新國大副校長，還同時兼任耶魯-新加坡國立大學學院代理常務副院長，負責學院成立的事宜。2012年5月，學院成立了領導班子。2012年7月，學院舉行了破土動工儀式。
2013年8月27日，耶魯新加坡國立大學學院舉行了開辦儀式。首批招募的155名學生將在求學前兩年的時間裏學習一些通識課程，並在第三學年集中學習專業課程，他們可以從包括都市研究、生命科學和經濟學在內的14種專業中加以選擇。該學院大多數的課堂人數限定在18人以內，教學方法是采用研討班形式來進行，課堂活動注重批評性思維的培養和教學上的互動。此外，該學院借鑒了耶魯大學的住宿模式，為學生提供與學習、生活、社會交往密不可分的良好氛圍。在課程設計方麵，該學院不僅接觸經典的西方哲學，還將研習中國哲學家孔子、孟子等極具東方元素的哲學思想。身為該學院的代理副院長，莉莉希望創立一種既不過於注重、又不完全脫離西方模式的新型人文學科教育模式。
生命真是一個奇跡，一朵小小的、看似嬌柔的茉莉花也能為春天帶來一抹新綠，為世界留下一縷馨香，為人間留下一絲甘甜！然而，正如中國文學家冰心所言：成功的花，人們隻驚慕她現時的明豔。是她的芽兒，浸透了奮鬥的淚泉，灑遍了犧牲的血雨。人如其名，江莉莉教授貌似纖弱，卻擁有十足的韌性和力量，經年累月，依憑自己的努力和勤奮，用行動搭建起邁向成功的階梯，一步一個腳印，打造出一方完美的三維空間，塑造出如夏花般燦爛的人生景觀。