三豐派的修持方法仍是打坐，如張三豐《玄機直講》所言：先將身心都安定了，氣息都平和了，始將雙目微閉，垂簾觀照下丹田。心止於臍下為凝神，氣歸於臍下為調息。神息相依，守其清靜自然為勿忘；順其清靜自然為勿助。不即不離，勿助勿忘，萬念俱滅，一靈獨存，即是正念。自然漸漸兩腎火蒸，丹田炁暖，息不用調而自調，炁不用煉而自煉。氣息即和，自然於上中下不出不入，無來無去，即是胎息、真鼎爐。此時真炁自然熏蒸營衛，由尾閭穿夾脊、經玉枕升上泥丸(肘後飛金晶、衝三關)，下鵲橋（鼻竅內上顎處），過重樓（氣管），至絳宮（心宮）而落入中丹田（心下臍上中間一竅），是為河車初動（金液還丹）。但炁至而神未全，我隻微微凝照，守於中宮（中丹田），自有無窮生機。中間若有一點靈光覺在丹田，是為水底玄珠、土內黃芽，又一陽來複（陽光一現、又稱一候），恍如紅日初升，若隱若現，即生鉛火。虛無寂滅，神凝於中，功無間斷、打成一片，是為五行配合。行之一月二月，我神自靜，靜久則炁益生，百餘日真炁漸漸充盈（二候），自然坎離****（心神與腎炁交合，又名腎水與心火****、水火相交）、乾坤會合。一霎時間，真炁混合，自有一陣回風上衝百脈，是為河車真動。身居於內，丹光不離，稱為大周天，也稱行九轉大還。此時一點至陽之精，凝結於中，隱藏於欲靜情寂之時，而有象有形。到此地位，息住於胎，內外溫養，頃刻無差，又稱為十月功夫。實際上靜功在一刻之中，亦有煉精化炁、煉炁化神、煉神還虛之功在內，不隻是十月功夫如此。坐下閉目存神，使心靜息調，即是煉精化炁之功。回光返照，凝神丹穴，使真息往來。內中靜極而動，動極而淨，無限生機，此即煉炁化神之功。如此真炁朝元，陰陽反複，****一番，自然風平浪靜，我於此時將正念止於丹田，即是封固火候。直到真空真靜，或一兩年、或十年百年，打破虛空，與太虛同體，此為煉神還虛之功。陽神放養也像少陽派一樣，需漸放漸收、漸放漸遠。煉功中所見到的各種景象，都不可認他。可見三豐派的修持方法從根本上說仍和文始派一樣，守其清靜自然，但在理論的闡釋上卻借鑒了少陽派的說法。
道家曆來講究男女平等，認為女子隻要根據其自身的生理與心理特征，同樣可以修煉成仙。但由於女子與男子生理結構不同，故修煉方法也有不同，所以又有女丹派。其實女丹派從屬於其它流派，即修煉理論與其所從屬的流派沒有什麼不同，所不同的隻是具體的修煉方法。此外，內丹家還認為，男子外陽而內陰，女子外陰而內陽。男子丹田在臍下一寸三分處，女子丹田在兩乳中間一寸三分處。女子心宮(性)與丹田(命)的距離比男子近，所以女子修煉比男子成丹快。
道家思想起源於黃帝之前的遠古時期，集大成於老子。內丹學是數千年來神仙家在道家理論的基礎上，汲取儒、釋、醫等思想精華，經過無數修煉者的實修實證和總結提煉，而逐步形成的一種宇宙觀、人生觀和修煉體係，是一項開發人體生命潛能和探究人類心靈奧秘的人體係統工程。它以人體自身為研究和修煉對象，以達到人和宇宙的自然本性相契合的仙人境界為目標，把老子的道家哲學拓展為修煉方法，為修煉者打通了一條通往仙人境界的隧道，也為普通人提供了一種防病治病、養生長壽的行之有效的保健方法，是中國曆代神仙家苦苦探究宇宙自然法則和人體生命科學的智慧結晶，是中華民族的文化瑰寶。