亞健康對人體而言有以下幾大危害，從輕到重依次表現為：
1.對工作效率、生活及學習質量有明顯影響。
2.大部分的亞健康會與生物鍾互相作用，加重生物鍾的紊亂。具體表現為睡眠不好，身心疲勞，繼而引發慢性疲勞征合症。如果從事的職業是駕車或者體力勞動，甚至會危及生命安全。
3.亞健康不僅表現在生理，也表現在心理，兩者互相影響，惡性循環，如果置之不理，很容易造成精神疾患。
4.如果亞健康得不到及時治療，慢慢會發展成惡性腫瘤、心腦血管疾病或糖尿病等重大疾病。而這些疾病是威脅人類生命的頭號殺手！
5.亞健康會造成早衰，甚至引起突發急病導致所謂的“過勞死”。
從某種程度上說，亞健康比疾病更可怕。因為亞健康最嚴重的後果是猝死，近年來這樣的例子在全世界屢見不鮮。由於亞健康不斷在人體內進行慢性消耗，身體的能量、能源經常入不敷出，外表看來似乎還可以，實際上已是外強中幹。如果長期過度勞累，人就處在接近油盡燈枯的狀態，再加一點壓力就被吹滅，過勞死就是這樣發生的。
還有一種猝死更可怕——心性猝死，即人的心髒會因為突然沒有血液輸出而死亡。亞健康者的植物神經功能常處在不穩定狀態，而嚴重的植物神經功能紊亂，可以導致心電功能紊亂，進而導致心律失常或者紊亂。當這種心律失常嚴重時，就使得心髒進行一種無效地、無節律、無規則地亂動，這種心跳根本無法輸出血液，因此幾乎與心跳完全停止一樣。而心髒無血輸出，人就進入死亡狀態。