（三）光譜幹擾
光譜幹擾主要來自光源和原子化器，包括譜線幹擾和背景幹擾。
譜線幹擾包括與分析線相鄰的待測元素譜線，這種情況常見於多譜線元素(如Ni，Co，Fe)；也包括與分析線相鄰的非待測元素譜線，如果此譜線是該元素的非吸收線，同樣會使欲測元素的靈敏度下降，工作曲線彎曲。減小狹縫寬度可改善或消除這種影響。另外，由於空心陰極燈的質量不好或長期沒有使用，造成光源本身有連續背景發射，使檢測靈敏度降低，克服的方法是將燈反接或更換新燈。
背景幹擾包括分子吸收和光散射引起的幹擾。分子吸收指在原子化過程中，生成的氣態分子、氧化物和鹽類分子等對光源輻射產生吸收而引起的幹擾；光散射幹擾是在原子化過程中，產生的固體微粒對光產生散射而引起的幹擾。在原子吸收光譜儀中采用氘燈扣除背景和塞曼效應扣除背景的方法，可消除這種幹擾。
（四）電離幹擾
在原子化過程中，希望得到較多的原子，這時如果原子得到能量失去電子後成為離子，將對光源產生的特征譜線不產生吸收，特別是基態原子的電離幹擾更大，使待測元素的基態原子數減少，使測定結果偏低。消除的方法是降低火焰溫度或加入消電離劑（比待測元素更容易電離的物質），抑製待測元素電離。
四、原子吸收分析測定條件的選擇
最佳測定條件應根據實際情況進行選擇，主要應從以下幾方麵考慮。
（一）分析線的選擇
通常選擇元素的共振線作分析線，因為這樣可使測定具有較高的靈敏度。而有些元素，例如As，Se，Hg等的共振線處於遠紫外區，火焰對其吸收很強烈，因而可選擇這些元素的次共振線作分析線。另外在分析較高濃度的試樣時，為了得到適度的吸收值，有時也選取靈敏度較低的譜線，但是對於微量元素的鑒定，就必須選用最強的吸收線。
（二）空心陰極燈電流
空心陰極燈的發射特性取決於工作電流，根據商品空心陰極燈標有的允許使用的最大工作電流值與可使用的電流範圍，再通過實驗，測定吸收值隨燈電流的變化而選定最適宜的工作電流。選用時應在保證穩定和合適光強度輸出的情況下，盡量選用最低的工作電流。
（三）火焰
火焰的選擇和調節是保證高原子化效率的關鍵之一，選擇什麼樣的火焰取決於具體任務，不同火焰對不同波長輻射的透射性能是各不相同的。乙炔火焰在220nm以下的短波區有明顯的吸收，因此對於分析線處於這一波段區的元素，是否選用乙炔火焰就應考慮這個因素。已知不同火焰所能產生的最高溫度是有很大差別的。顯然，對於易生成難離解化合物的元素，應選擇溫度高的乙炔-空氣，以至乙炔-氧化亞氮火焰；反之，對於易電離元素，高溫火焰常引起嚴重的電離幹擾，是不宜選用的。選定火焰類型後，應通過實驗進一步確定燃氣與助燃氣流量的合適比例。
（四）燃燒頭高度
在測定時必須仔細調節燃燒頭的高度（即觀測高度），使測量光束從自由原子濃度最大的火焰區通過，以期得到最佳的靈敏度和穩定性。對於不同元素，自由原子濃度隨火焰高度的分布是不同的。
（五）狹縫寬度
在原子吸收分光光度法中，狹縫寬度的選擇應考慮一係列因素，首先與單色器的分辨能力有關。當單色器的分辨能力大時，可以使用較寬的狹縫。在光源輻射較弱或共振線吸收較弱時，必須使用較寬的狹縫。但當火焰的背景發射很強，在吸收線附近有幹擾譜線與非吸收光存在時，如測定Ca、Mg、Fe等，就應使用較窄的狹縫。合適的狹縫寬度同樣應通過實驗確定。
對於石墨爐原子化法，顯然還應根據方法特點予以考慮，例如還需合理選擇幹燥、灰化、原子化及淨化階段的溫度及時間等。