當年，劍橋大學要給他一個榮譽文學博士學位，理事會中有人反對，說他支持中國1997年收回香港，違背英國利益。展開辯論時，支持者認為，他是中國人，支持中國收回失土是愛國行為，劍橋不能反對任何人合理的愛國行為；中英租借新界條約，租期99年，到1997年期滿，這是任何文明國家都必須遵守的國際行為；劍橋講理性、講守信，不能反對信守條約的行為；劍橋注重學術獨立自由，文學博士是學術性的，不是政治性的。③
① 田家明《劍橋觀禮記》，《明報月刊》2005年10月號。
② 石貝《我的老板金庸》，216頁。
③ 田家明《劍橋觀禮記》，《明報月刊》2005年9月號。
6月22日，金庸獲授劍橋大學榮譽博士，隨即提出申請，請求到該校攻讀博士學位。劍橋最初不接受，因他已是榮譽博士。他的申請差不多花了三個月，費了一點周折才得通過。他已80多歲高齡，名滿海內外，卻執意要去劍橋拿一個博士學位。他說：“求學，並非為了學位，而是感到自己學問不夠。”2003年11月23日，他在香港浸會大學說：“我最喜歡大學生活，我快80歲了，最大願望還是到大學去做學生，從一年級念起。”①
2005年10月1日，金庸入學劍橋大學聖約翰學院，與他同班的有中國學生，也有日本、韓國、新加坡等國的學生。他每周上兩次課，一次兩個鍾頭，從不缺課。剛去劍橋時他租房住，後來花30多萬英鎊在劍河旁買了房子，“那裏的住房升值很快，去年買的小房子，現在已經漲了5萬多英鎊。等我讀完博士，可以賺一筆小錢”。他笑得很開心。
金庸沒有帶車，也沒有在劍橋買車。到了劍橋他很想騎單車上學，但太太不讓他騎，怕他年紀大了出安全問題。他隻好打的去上學，“坐的士就很貴，差不多一百塊港幣一次……”導師很照顧他，有時騎著單車到他的住處來上課。②
金庸的唐代史導師麥大維（DavidMcMullen）教授是道地的“中國通”，不僅普通話說得好，還精通中國的曆史、文學和古漢語。金庸最初提出的選題有武則天、狄仁傑、匈奴與匈牙利人、中國與羅馬帝國之滅亡等，麥大維都沒有同意，最後提出唐朝皇位繼承製度與唐朝衰亡的關係，麥大維認為可以考慮，學位委員會也通過了。
2006年，金庸完成碩士論文《初唐皇位繼承製度》，從2007年起修讀曆史學博士。這年11月25日，他終於卸下“浙大人文學院院長”的頭銜，但浙大還是要他擔任名譽院長，當晚頒發了聘書。
金庸真正在劍橋讀書的時間差不多兩年。他總是說：“我覺得學問不夠，也是自己的生活中、人生中的一個缺陷。”所以，80多歲了他還要去拿學位，彌補這個缺陷。2009年，他成為中國作家協會會員，隨後成為中國作協名譽副主席。早在1998年，鄧友梅、陳祖芬就要介紹他進作協，他沒答應。
① 《快樂的君子——王蒙，金庸與香港大學生暢論人生》，《明報月刊》2004年1月號。
② 《時代周報》2009年1月12日。
2010年9月，金庸完成博士論文《唐代盛世繼承皇位製度》，透過正史、野史分析唐代太子繼位製度以及宮廷的權力鬥爭。唐由盛轉衰的安史之亂發生，唐玄宗派了兒子榮王平亂，後來戰死，正史未提死因。他分析太子把弟弟榮王殺了。他說自己找了很多證據，“證明這個事件是曆史上造假，其實是太子在發動政變，把弟弟殺掉，而且他（太子）占有軍隊，連父親也不敢動他”。他認為馬嵬坡事件就是皇太子發動的武裝政變。唐代皇位繼承他早有留意，1969年4月25日的社評《自來帝皇，不喜太子》提及，“唐太宗英明無比，可是也不喜歡太子承乾，於是太子糾合大將侯君集等造反，事敗被廢”。又提及當年玄武門之變，唐高祖不得不立李世民為太子。
劍橋大學聖約翰學院院長杜柏琛（ChristopherDobson）親飛香港，給他頒發學位證書。當夜身穿長袍的杜柏琛以拉丁文宣布他成為榮譽院士和文學博士，接下來用英語說，劍橋從不在海外頒博士學位，這次是破例。①
當金庸要去劍橋讀博時，老朋友羅孚曾說：“他已是八十以上的老人，年已耄耋，依然好學不倦，這實在使人敬佩。其實他大可不必如此。學無止境……何妨放下、自在，這真是何等自在！”②此時，他已87歲，羅孚則已離世。
金庸曾是億萬男女的偶像，海峽兩岸的座上客，以其武俠小說和《明報》社評征服了華人世界無數凡夫俗子的心。多年來，他的龐大身影覆蓋了海峽兩岸、芸芸眾生。一個冬日的下午，陽光照在香港北角渣華道嘉華國際中心他的辦公室。窗外，維多利亞灣湛藍的海水，一如半個多世紀前他初來香港的日子。那一刻，在記者眼中——
他是一個溫和而細致的人，儀容整潔，戴著金絲邊眼鏡，風度和藹。拍照時，他微微有些羞澀和緊張，手裏拿著一張從雜誌上取下來的塑料封套，卷成細長的棍，不停地玩弄。……看到他略帶靦腆的笑容和不知所措的舉止，在這數百平米環繞書架和海景的大辦公室內，格外顯得孤單。③