烏魯木齊諸屬城皆有團，團各有長，先後戰死，而迪化徐學功戰最力，而曆久不敗，遂獨以民團支拄其間，隱然為一重鎮。學功者，烏魯木齊農家子，好技擊。值回亂，結健兒數十，掠回莊貲貨自贍，遇漢民力護之。後附者益眾，集至五千人，精練馬隊，每戰突陣，驟如風雨，回見之輒走。帕夏聞其名，憚之，使使約和。九年，妥明遣將攻庫車而敗，帕夏潛勾妥明他將馬仲，自吐魯番共攻妥明。妥明降帕夏，帕夏仍令為清真王，居烏垣；以馬仲為阿奇木，總回務。仲又與學功戰，被陣斬，仲子人得襲職。人得與妥明積仇，糾安夷攻妥明。帕夏乃約學功共攻吐魯番、烏魯木齊，皆下之，妥明走綏來死。於是安夷又跨烏魯木齊。始叛之回，名號無複存矣。新疆遂為安夷所據地。
帕夏之交學功也，以學功善戰，計必為清廷所用，冀與相結，向清廷薦己王南八城，而以烏魯木齊至哈密地，使學功歸獻清廷以為功。既見學功百戰不得一階，乃輕之，令還南山，以烏垣仍任馬人得綰回務。
學功大恚，屢攻烏城。土回、纏頭時投學功，時投入得，轉輾受役，迄不得息。十年五月，俄羅斯以代收伊犁來告，且言將進攻烏魯木齊。詔署伊犁將軍榮全赴伊，收回城池；直隸提督劉銘傳出關，規複新疆；都統景廉、成祿規複烏魯木齊；左宗棠、穆圖善撥兵顧關外。銘傳等皆不果行。宗棠則飭徐占彪馳赴肅州，代成祿，使出關而已。時攻河州方急，不遑圖遠舉也。其冬，俄人果糾土回、纏頭襲烏垣，陽稱赴綏來市易，驅駝馬羊隻數千，載洋貨銀鈔以行。學功截之於石河，距綏來止八十裏，斬俄人及回、纏數十，餘悉縱還，盡奪其畜生貨鈔，俄東窺之念乃息。十一年春，景廉率師抵古城，招學功率所部開屯；哈密辦事大臣文麟亦招之，於是烏垣附近屯田大興。學功及哈密團首孔才，皆以其眾為朝廷任耕戰，官皆漸擢至提、鎮。回疆稍見中朝號令措置矣。十二年三月，陝回白彥虎西竄，官軍方攻肅州，彥虎為肅回應援，敗走出關。至秋，掠烏垣、綏來，為學功所截，奪其駝隻貨物，彥虎勢益孤弱，遂服屬於安夷矣。九月，宗棠克肅州，陝、甘平，乃議掃除關外。
左軍之掃除關外，事已在光緒年間，與本節標題不合。但收複新疆與戡定關、隴，人才國力，俱是相連之一事，不能不乘關內既平，並述其始末，且認此為同治中興之結果，湘、楚立功之終局。以後之事，即西後幹政，賄賂公行，有亡征無起色矣。故越時代界限而列之於此。
新疆向為旗員豢養之地，清廷本不願漢人過問。當陝、甘既平，有詔乘勢進規關外，但令金順、景廉、穆圖善輩主兵事，而命宗棠接濟軍餉，指派左軍中張曜、宋慶馳往哈密，會文麟剿賊。蓋以漢人領兵者為偏裨而已，初未欲以督師之任畀宗棠也。是時新疆形勢，南八城已為帕夏所據，伊犁為俄所代收，其極東之一州三廳，原與安西同屬甘肅。然自肅州嘉峪關以外，清廷已視為禁臠，故使穆圖善自涇州移駐安敦玉，為景廉、金順等聲援。其於宗棠，蓋以外人視之。至十三年七月，命宗棠為大學士，猶使留陝甘總督任，而以景廉為欽差大臣，督辦新疆軍務，金順為幫辦，是時猶未有任宗棠出關意也。光緒三年二月二十七日乙未，景廉乃奏宗棠籌辦糧運未能合宜，以宗棠主由北路烏裏雅蘇台、科布多用駝運，戶部侍郎專辦西征糧台之袁保恒主由南路肅州，用車騾運，意不合。