義莊﹑濟世堂﹑善堂是民間開辦的慈善機構，收容老弱孤寡。申時行的奏報中也多次提及災區搢紳寺院慷慨解囊，施舍錢糧衣物，以助賑災；申時行在折子中為其請功，沈覺非一一答應，授予這些人“士”的稱號，以為表彰。這些事情，也啟發了他宗教改革的思路。中華要強盛，就必須與世界交流，那是西方之宗教必然進入中國，與中土佛道二教爭衡。在沈覺非看來，明以來二教人才匱乏，思想上少有創建；而且以佛道二教的傳教習慣，與西方天主基督相比，恐怕難以占到上風。因此必須對佛道二教加以改革，立規矩以成方圓，當然也有為我所用的意思。這都是遠景規劃了。
聽潘季馴說河南災情大體已定，萬曆心中高興，從江南等地采購衣被，已經影響了江南的紡織業，錦衣衛的線報顯示最近江南棉布的價格上漲了兩成。自從大開海禁後，江南的棉布絲綢瓷器等物就大量出口南洋，價格也一路上升，有一些地方，還出現了大片農田不種糧食專種桑麻的情況。
但現在最重要的還是黃河災民的問題，穩定第一嘛。又問道：“各地明年春耕可有準備？災區田畝可妥善處理？”
估摸著萬曆會問這些問題，在潘季馴來之前，申時行已經對他仔細交代過，讓他留心。潘季馴頭上有了細汗，想了想，說道：“陛下，申閣老已經讓各地官府衙門準備種子和耕牛，還申請戶部想其它省區購買耕牛種子。現在存在各地驛站，派有專人飼養照看，準備開春發放給災民，待秋收後，再取回本錢。鄒元標鄒大人也向各地派了禦史，監察此事，督促實行，想來明年春耕會順利進行。”
恢複生產是振濟災民的重要措施，隻有恢複了生產讓災民有了自食其力的能力，才能最終完成振濟災民的任務。潘季馴的回答，與錦衣衛的秘報相吻合，萬曆感到滿意，示意潘季馴繼續說下去。
“災區田畝之事也按照陛下的旨令在進行。將無主的土地分給無田少田的農民，也鼓勵重新開荒，官府免費發給農具。黃河沿岸的土地因為將來治訶要用，臣以為不宜分給農民，因此臣已經給申閣老提了建議，申閣老也以為然。至於清量田畝和重定稅賦，因為陛下要免稅三年，而且水災後天地肥瘠已變，還需明年之後才能展開。”
沈覺非點點頭，看來這一次賑災申時行等人卻是做得不錯。又繼續問道：“在災區，可有豪強權貴趁火打劫，不顧天良？”
“回稟陛下，洪災之後，一些府縣雖小有擾亂，但都立即被鎮壓，首惡以正國法。申閣老到任後，宣皇威，施皇恩，恩威並重，地方清靜。各地的藩王勳貴也多守法，崇王趙王等還大量捐獻，協組賑災。”
“是這樣啊。”萬曆說道，這些藩王能怎樣就好了。
繼位之後，萬曆幾次削減藩王和宗室，規定郡王以下的爵位最多隻能世襲五代，廢除了好幾個民憤尤大的藩王和勳貴。但是卻將宗室頭上的禁令除掉，允許其出仕經商，允許其在通報朝廷後離開封地，允許其每年在京師居住半年，允許其弟子遊學等等。當然還是有些限製的，比如不能擔任軍隊高級職位，不能幹涉地方政務，不能私自結交外國君臣。如此一來，朝廷的負擔減輕了，又能從宗室種選拔出一些人才來，而且解除對藩王的禁令，還給他們一些自由，也降低其心理變態危害百姓的比例。那些藩王宗室可就不同了，雖然禁令沒了，但待遇也低了，對萬曆是又愛又恨，又沒辦法。